RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512427.5

HOXC-AS1-202, HOXC cluster antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene HOXC-AS1, Length 290 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS1-202ENST00000512427 PPARAQ07869 468 aa10.96□□□□□ -0.65
HOXC-AS1-202ENST00000512427 FAM47CQ5HY64 1035 aa10.96□□□□□ -0.65
HOXC-AS1-202ENST00000512427 TAPT1Q6NXT6 567 aa10.96□□□□□ -0.65
HOXC-AS1-202ENST00000512427 MORC4Q8TE76 937 aa10.96□□□□□ -0.65
HOXC-AS1-202ENST00000512427 SCLYQ96I15 445 aa10.96□□□□□ -0.65
HOXC-AS1-202ENST00000512427 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP10.96□□□□□ -0.65
HOXC-AS1-202ENST00000512427 WDR11Q9BZH6 1224 aa10.96□□□□□ -0.65
HOXC-AS1-202ENST00000512427 PDGFCQ9NRA1 345 aa10.96□□□□□ -0.65
HOXC-AS1-202ENST00000512427 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa10.96□□□□□ -0.65
HOXC-AS1-202ENST00000512427 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP10.95□□□□□ -0.66
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ICAM1P05362 532 aa10.95□□□□□ -0.66
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CA3P07451 260 aa10.95□□□□□ -0.66
HOXC-AS1-202ENST00000512427 MYL3P08590 195 aa10.95□□□□□ -0.66
HOXC-AS1-202ENST00000512427 BFSP2Q13515 415 aa10.95□□□□□ -0.66
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CCDC96Q2M329 555 aa10.95□□□□□ -0.66
HOXC-AS1-202ENST00000512427 MUM1L1Q5H9M0 696 aa10.95□□□□□ -0.66
HOXC-AS1-202ENST00000512427 KCTD1Q719H9 257 aa10.95□□□□□ -0.66
HOXC-AS1-202ENST00000512427 DEFB128Q7Z7B8 93 aa10.95□□□□□ -0.66
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CCDC155Q8N6L0 562 aa10.95□□□□□ -0.66
HOXC-AS1-202ENST00000512427 OR6J1Q8NGC5 347 aa10.95□□□□□ -0.66
HOXC-AS1-202ENST00000512427 DCAF4Q8WV16 495 aa10.95□□□□□ -0.66
HOXC-AS1-202ENST00000512427 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP10.95□□□□□ -0.66
HOXC-AS1-202ENST00000512427 PRR12Q9ULL5 1215 aa10.95□□□□□ -0.66
HOXC-AS1-202ENST00000512427 NOD1Q9Y239 953 aa10.95□□□□□ -0.66
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP10.95□□□□□ -0.66
HOXC-AS1-202ENST00000512427 MTCH2Q9Y6C9 303 aa10.95□□□□□ -0.66
HOXC-AS1-202ENST00000512427 GBF1Q92538 1859 aa10.95□□□□□ -0.66
HOXC-AS1-202ENST00000512427 LRRC37A2A6NM11 1700 aa10.95□□□□□ -0.66
HOXC-AS1-202ENST00000512427 TRANK1O15050 2925 aa10.95□□□□□ -0.66
HOXC-AS1-202ENST00000512427 TTC41PQ6P2S7 1318 aa10.94□□□□□ -0.66
HOXC-AS1-202ENST00000512427 M0R2C6 588 aa10.94□□□□□ -0.66
HOXC-AS1-202ENST00000512427 BAIAP3O94812 1187 aa10.94□□□□□ -0.66
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CYP2C9P11712 490 aa10.94□□□□□ -0.66
HOXC-AS1-202ENST00000512427 MYOGP15173 224 aa10.94□□□□□ -0.66
HOXC-AS1-202ENST00000512427 KCNJ6P48051 423 aa10.94□□□□□ -0.66
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP10.94□□□□□ -0.66
HOXC-AS1-202ENST00000512427 PURAQ00577 322 aaKnown RBP10.94□□□□□ -0.66
HOXC-AS1-202ENST00000512427 TFF2Q03403 129 aa10.94□□□□□ -0.66
HOXC-AS1-202ENST00000512427 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP10.94□□□□□ -0.66
HOXC-AS1-202ENST00000512427 TTLL4Q14679 1199 aa10.94□□□□□ -0.66
HOXC-AS1-202ENST00000512427 PPP2R5BQ15173 497 aa10.94□□□□□ -0.66
HOXC-AS1-202ENST00000512427 NFRKBQ6P4R8 1299 aa10.94□□□□□ -0.66
HOXC-AS1-202ENST00000512427 FSD1Q9BTV5 496 aa10.94□□□□□ -0.66
HOXC-AS1-202ENST00000512427 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP10.94□□□□□ -0.66
HOXC-AS1-202ENST00000512427 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa10.94□□□□□ -0.66
HOXC-AS1-202ENST00000512427 BDP1A6H8Y1 2624 aa10.93□□□□□ -0.66
HOXC-AS1-202ENST00000512427 PTPDC1A2A3K4 754 aa10.93□□□□□ -0.66
HOXC-AS1-202ENST00000512427 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP10.93□□□□□ -0.66
HOXC-AS1-202ENST00000512427 PARNO95453 639 aaKnown RBP10.93□□□□□ -0.66
HOXC-AS1-202ENST00000512427 KCNQ1P51787 676 aa10.93□□□□□ -0.66
HOXC-AS1-202ENST00000512427 PDE4DQ08499 809 aa10.93□□□□□ -0.66
HOXC-AS1-202ENST00000512427 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP10.93□□□□□ -0.66
HOXC-AS1-202ENST00000512427 SCFD2Q8WU76 684 aa10.93□□□□□ -0.66
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ARNTL2Q8WYA1 636 aa10.93□□□□□ -0.66
HOXC-AS1-202ENST00000512427 HLA-CQ95604 372 aa10.93□□□□□ -0.66
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CHMP4CQ96CF2 233 aa10.93□□□□□ -0.66
HOXC-AS1-202ENST00000512427 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP10.93□□□□□ -0.66
HOXC-AS1-202ENST00000512427 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP10.93□□□□□ -0.66
HOXC-AS1-202ENST00000512427 MTMR7Q9Y216 660 aa10.93□□□□□ -0.66
HOXC-AS1-202ENST00000512427 NCOR1O75376 2440 aa10.92□□□□□ -0.66
HOXC-AS1-202ENST00000512427 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP10.92□□□□□ -0.66
HOXC-AS1-202ENST00000512427 TLL1O43897 1013 aa10.92□□□□□ -0.66
HOXC-AS1-202ENST00000512427 IQCF3P0C7M6 154 aa10.92□□□□□ -0.66
HOXC-AS1-202ENST00000512427 SNAP25P60880 206 aa10.92□□□□□ -0.66
HOXC-AS1-202ENST00000512427 NBPF20Q3BBV1 942 aa10.92□□□□□ -0.66
HOXC-AS1-202ENST00000512427 TMEM31Q5JXX7 168 aa10.92□□□□□ -0.66
HOXC-AS1-202ENST00000512427 SYDE2Q5VT97 1194 aa10.92□□□□□ -0.66
HOXC-AS1-202ENST00000512427 BTNL9Q6UXG8 535 aa10.92□□□□□ -0.66
HOXC-AS1-202ENST00000512427 HERC6Q8IVU3 1022 aa10.92□□□□□ -0.66
HOXC-AS1-202ENST00000512427 DNERQ8NFT8 737 aa10.92□□□□□ -0.66
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CAGE1Q8TC20 777 aa10.92□□□□□ -0.66
HOXC-AS1-202ENST00000512427 LMCD1Q9NZU5 365 aa10.92□□□□□ -0.66
HOXC-AS1-202ENST00000512427 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP10.92□□□□□ -0.66
HOXC-AS1-202ENST00000512427 REV3LO60673 3130 aa10.91□□□□□ -0.66
HOXC-AS1-202ENST00000512427 XIRP2A4UGR9 3374 aa10.91□□□□□ -0.66
HOXC-AS1-202ENST00000512427 A6NJR5 290 aa10.91□□□□□ -0.66
HOXC-AS1-202ENST00000512427 NFIBO00712 420 aa10.91□□□□□ -0.66
HOXC-AS1-202ENST00000512427 PTGS1P23219 599 aa10.91□□□□□ -0.66
HOXC-AS1-202ENST00000512427 TAP1Q03518 808 aa10.91□□□□□ -0.66
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa10.91□□□□□ -0.66
HOXC-AS1-202ENST00000512427 TSHZ3Q63HK5 1081 aa10.91□□□□□ -0.66
HOXC-AS1-202ENST00000512427 RNF207Q6ZRF8 634 aa10.91□□□□□ -0.66
HOXC-AS1-202ENST00000512427 AFAP1L1Q8TED9 768 aa10.91□□□□□ -0.66
HOXC-AS1-202ENST00000512427 VWCEQ96DN2 955 aa10.91□□□□□ -0.66
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ZBED2Q9BTP6 218 aa10.91□□□□□ -0.66
HOXC-AS1-202ENST00000512427 DCTPP1Q9H773 170 aa10.91□□□□□ -0.66
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CERS4Q9HA82 394 aa10.91□□□□□ -0.66
HOXC-AS1-202ENST00000512427 TOMM22Q9NS69 142 aa10.91□□□□□ -0.66
HOXC-AS1-202ENST00000512427 RCAN3Q9UKA8 241 aa10.91□□□□□ -0.66
HOXC-AS1-202ENST00000512427 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP10.91□□□□□ -0.66
HOXC-AS1-202ENST00000512427 RFXAPO00287 272 aa10.9□□□□□ -0.66
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ORC4O43929 436 aa10.9□□□□□ -0.66
HOXC-AS1-202ENST00000512427 EFCAB14O75071 495 aa10.9□□□□□ -0.66
HOXC-AS1-202ENST00000512427 TOP1P11387 765 aaKnown RBP10.9□□□□□ -0.66
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CALML3P27482 149 aa10.9□□□□□ -0.66
HOXC-AS1-202ENST00000512427 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP10.9□□□□□ -0.66
HOXC-AS1-202ENST00000512427 TMEM63BQ5T3F8 832 aa10.9□□□□□ -0.66
HOXC-AS1-202ENST00000512427 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP10.9□□□□□ -0.66
HOXC-AS1-202ENST00000512427 LRFN3Q9BTN0 628 aa10.9□□□□□ -0.66
HOXC-AS1-202ENST00000512427 MAF1Q9H063 256 aa10.9□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.3 ms