RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000506510.6

PDE4D-215, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 4

Gene PDE4D, Length 558 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-215ENST00000506510 CILP2Q8IUL8 1156 aa7.36□□□□□ -1.23
PDE4D-215ENST00000506510 TANGO6Q9C0B7 1094 aa7.36□□□□□ -1.23
PDE4D-215ENST00000506510 GULP1Q9UBP9 304 aa7.36□□□□□ -1.23
PDE4D-215ENST00000506510 FBLN5Q9UBX5 448 aa7.36□□□□□ -1.23
PDE4D-215ENST00000506510 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
PDE4D-215ENST00000506510 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa7.35□□□□□ -1.23
PDE4D-215ENST00000506510 IGSF3O75054 1194 aa7.35□□□□□ -1.23
PDE4D-215ENST00000506510 STK10O94804 968 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
PDE4D-215ENST00000506510 EPHB3P54753 998 aa7.35□□□□□ -1.23
PDE4D-215ENST00000506510 KCNA10Q16322 511 aa7.35□□□□□ -1.23
PDE4D-215ENST00000506510 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
PDE4D-215ENST00000506510 OLFML2BQ68BL8 750 aa7.35□□□□□ -1.23
PDE4D-215ENST00000506510 MBLAC2Q68D91 279 aa7.35□□□□□ -1.23
PDE4D-215ENST00000506510 CYP26B1Q9NR63 512 aa7.35□□□□□ -1.23
PDE4D-215ENST00000506510 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa7.35□□□□□ -1.23
PDE4D-215ENST00000506510 C7orf72A4D263 438 aa7.34□□□□□ -1.23
PDE4D-215ENST00000506510 ABLIM1O14639 778 aa7.34□□□□□ -1.23
PDE4D-215ENST00000506510 SRGAP3O43295 1099 aa7.34□□□□□ -1.23
PDE4D-215ENST00000506510 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
PDE4D-215ENST00000506510 ECI1P42126 302 aa7.34□□□□□ -1.23
PDE4D-215ENST00000506510 TMEM62Q0P6H9 643 aa7.34□□□□□ -1.23
PDE4D-215ENST00000506510 RAB33AQ14088 237 aa7.34□□□□□ -1.23
PDE4D-215ENST00000506510 SF1Q15637 639 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
PDE4D-215ENST00000506510 PRSS53Q2L4Q9 553 aa7.34□□□□□ -1.23
PDE4D-215ENST00000506510 NLGN2Q8NFZ4 835 aa7.34□□□□□ -1.23
PDE4D-215ENST00000506510 C8orf37Q96NL8 207 aa7.34□□□□□ -1.23
PDE4D-215ENST00000506510 TOX2Q96NM4 488 aa7.34□□□□□ -1.23
PDE4D-215ENST00000506510 TRIM55Q9BYV6 548 aa7.34□□□□□ -1.23
PDE4D-215ENST00000506510 CNTD2Q9H8S5 307 aa7.34□□□□□ -1.23
PDE4D-215ENST00000506510 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-215ENST00000506510 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-215ENST00000506510 CYBBP04839 570 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-215ENST00000506510 CFPP27918 469 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-215ENST00000506510 CDR1P51861 262 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-215ENST00000506510 LINC00310P59036 64 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-215ENST00000506510 NR1I3Q14994 352 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-215ENST00000506510 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-215ENST00000506510 PAQR3Q6TCH7 311 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-215ENST00000506510 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-215ENST00000506510 LZTR1Q8N653 840 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-215ENST00000506510 NPLOC4Q8TAT6 608 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-215ENST00000506510 FRS2Q8WU20 508 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-215ENST00000506510 EPN3Q9H201 632 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-215ENST00000506510 RXFP1Q9HBX9 757 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-215ENST00000506510 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-215ENST00000506510 AGRPO00253 132 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-215ENST00000506510 NPHS1O60500 1241 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-215ENST00000506510 ATP2B1P20020 1258 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-215ENST00000506510 HOXC12P31275 282 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-215ENST00000506510 KCNJ6P48051 423 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-215ENST00000506510 MAPKAPK2P49137 400 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-215ENST00000506510 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-215ENST00000506510 FZD5Q13467 585 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-215ENST00000506510 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-215ENST00000506510 INF2Q27J81 1249 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-215ENST00000506510 C1QL4Q86Z23 238 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-215ENST00000506510 CKAP2LQ8IYA6 745 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-215ENST00000506510 MMP19Q99542 508 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-215ENST00000506510 MTA3Q9BTC8 594 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-215ENST00000506510 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-215ENST00000506510 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-215ENST00000506510 F8W031 263 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-215ENST00000506510 GLI4P10075 376 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-215ENST00000506510 GRIA2P42262 883 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-215ENST00000506510 NCKAP1LP55160 1127 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-215ENST00000506510 PPP2R2AP63151 447 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-215ENST00000506510 SSPNQ14714 243 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-215ENST00000506510 CABP7Q86V35 215 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-215ENST00000506510 CCDC103Q8IW40 242 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-215ENST00000506510 MZB1Q8WU39 189 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-215ENST00000506510 BTG4Q9NY30 223 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-215ENST00000506510 MARCH2Q9P0N8 246 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-215ENST00000506510 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-215ENST00000506510 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-215ENST00000506510 A0A1W2PQU0 124 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-215ENST00000506510 N4BP3O15049 544 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-215ENST00000506510 NUAK1O60285 661 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-215ENST00000506510 FUCA1P04066 466 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-215ENST00000506510 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP7.3□□□□□ -1.242e-7■■■■■ 26.9
PDE4D-215ENST00000506510 GFRA1P56159 465 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-215ENST00000506510 LDHDQ86WU2 507 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-215ENST00000506510 TMEM145Q8NBT3 493 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-215ENST00000506510 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-215ENST00000506510 USP33Q8TEY7 942 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-215ENST00000506510 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-215ENST00000506510 ARNTLO00327 626 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-215ENST00000506510 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-215ENST00000506510 SCG5P05408 212 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-215ENST00000506510 PI3P19957 117 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-215ENST00000506510 PRR5P85299 388 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-215ENST00000506510 CIAPIN1Q6FI81 312 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-215ENST00000506510 TEX2Q8IWB9 1127 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-215ENST00000506510 PPIL6Q8IXY8 311 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-215ENST00000506510 KREMEN2Q8NCW0 462 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-215ENST00000506510 DPF3Q92784 378 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-215ENST00000506510 SIGLEC10Q96LC7 697 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-215ENST00000506510 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-215ENST00000506510 KCTD3Q9Y597 815 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-215ENST00000506510 IRAK3Q9Y616 596 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-215ENST00000506510 CCDC85CA6NKD9 419 aa7.28□□□□□ -1.24
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