RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461448.5

SNHG12-201, Transcript of small nucleolar RNA host gene 12, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SNHG12, Length 1,629 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12-201ENST00000461448 ADORA2AP29274 412 aa22.46■■□□□ 1.19
SNHG12-201ENST00000461448 GNA11P29992 359 aa22.46■■□□□ 1.19
SNHG12-201ENST00000461448 ADCY7P51828 1080 aa22.46■■□□□ 1.19
SNHG12-201ENST00000461448 NLRP5P59047 1200 aa22.46■■□□□ 1.19
SNHG12-201ENST00000461448 GRB14Q14449 540 aa22.46■■□□□ 1.19
SNHG12-201ENST00000461448 IFFO2Q5TF58 517 aa22.46■■□□□ 1.19
SNHG12-201ENST00000461448 GALNT17Q6IS24 598 aa22.46■■□□□ 1.19
SNHG12-201ENST00000461448 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP22.46■■□□□ 1.19
SNHG12-201ENST00000461448 NUDT12Q9BQG2 462 aa22.46■■□□□ 1.19
SNHG12-201ENST00000461448 C6orf50Q9HD87 102 aa22.46■■□□□ 1.19
SNHG12-201ENST00000461448 GJB4Q9NTQ9 266 aa22.46■■□□□ 1.19
SNHG12-201ENST00000461448 CYP39A1Q9NYL5 469 aa22.46■■□□□ 1.19
SNHG12-201ENST00000461448 PFASO15067 1338 aa22.45■■□□□ 1.19
SNHG12-201ENST00000461448 SMCHD1A6NHR9 2005 aa22.45■■□□□ 1.18
SNHG12-201ENST00000461448 PGK2P07205 417 aa22.45■■□□□ 1.18
SNHG12-201ENST00000461448 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
SNHG12-201ENST00000461448 RPS6P62753 249 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
SNHG12-201ENST00000461448 MORN1Q5T089 497 aa22.45■■□□□ 1.18
SNHG12-201ENST00000461448 SLC30A10Q6XR72 485 aa22.45■■□□□ 1.18
SNHG12-201ENST00000461448 DPP9Q86TI2 863 aa22.45■■□□□ 1.18
SNHG12-201ENST00000461448 CUL5Q93034 780 aa22.45■■□□□ 1.18
SNHG12-201ENST00000461448 SHISA4Q96DD7 197 aa22.45■■□□□ 1.18
SNHG12-201ENST00000461448 BRMS1Q9HCU9 246 aa22.45■■□□□ 1.18
SNHG12-201ENST00000461448 KCNJ14Q9UNX9 436 aa22.45■■□□□ 1.18
SNHG12-201ENST00000461448 ESYT2A0FGR8 921 aa22.44■■□□□ 1.18
SNHG12-201ENST00000461448 POTEB2H3BUK9 544 aa22.44■■□□□ 1.18
SNHG12-201ENST00000461448 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
SNHG12-201ENST00000461448 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP22.44■■□□□ 1.18
SNHG12-201ENST00000461448 SAMD3Q8N6K7 520 aa22.44■■□□□ 1.18
SNHG12-201ENST00000461448 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa22.44■■□□□ 1.18
SNHG12-201ENST00000461448 BICD2Q8TD16 824 aa22.44■■□□□ 1.18
SNHG12-201ENST00000461448 SOCS4Q8WXH5 440 aa22.44■■□□□ 1.18
SNHG12-201ENST00000461448 RIC8AQ9NPQ8 531 aa22.44■■□□□ 1.18
SNHG12-201ENST00000461448 GJD2Q9UKL4 321 aa22.44■■□□□ 1.18
SNHG12-201ENST00000461448 GABRQQ9UN88 632 aa22.44■■□□□ 1.18
SNHG12-201ENST00000461448 GNRH1P01148 92 aa22.43■■□□□ 1.18
SNHG12-201ENST00000461448 MAP2K5Q13163 448 aa22.43■■□□□ 1.18
SNHG12-201ENST00000461448 USP17L6PQ6QN14 398 aa22.43■■□□□ 1.18
SNHG12-201ENST00000461448 ZMYND12Q9H0C1 365 aa22.43■■□□□ 1.18
SNHG12-201ENST00000461448 TRIM17Q9Y577 477 aa22.43■■□□□ 1.18
SNHG12-201ENST00000461448 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa22.43■■□□□ 1.18
SNHG12-201ENST00000461448 COBLO75128 1261 aa22.42■■□□□ 1.18
SNHG12-201ENST00000461448 CYP2B6P20813 491 aa22.42■■□□□ 1.18
SNHG12-201ENST00000461448 HSD17B4P51659 736 aa22.42■■□□□ 1.18
SNHG12-201ENST00000461448 PRKCZQ05513 592 aa22.42■■□□□ 1.18
SNHG12-201ENST00000461448 UBE2SQ16763 222 aa22.42■■□□□ 1.18
SNHG12-201ENST00000461448 KRT40Q6A162 431 aa22.42■■□□□ 1.18
SNHG12-201ENST00000461448 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
SNHG12-201ENST00000461448 PHF20Q9BVI0 1012 aa22.42■■□□□ 1.18
SNHG12-201ENST00000461448 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
SNHG12-201ENST00000461448 SRRDQ9UH36 339 aa22.42■■□□□ 1.18
SNHG12-201ENST00000461448 MEIS2O14770 477 aa22.42■■□□□ 1.18
SNHG12-201ENST00000461448 SYT1P21579 422 aa22.42■■□□□ 1.18
SNHG12-201ENST00000461448 RGS2P41220 211 aa22.42■■□□□ 1.18
SNHG12-201ENST00000461448 FLT3LGP49771 235 aa22.42■■□□□ 1.18
SNHG12-201ENST00000461448 GUCY1B3Q02153 619 aa22.42■■□□□ 1.18
SNHG12-201ENST00000461448 CNTN2Q02246 1040 aa22.42■■□□□ 1.18
SNHG12-201ENST00000461448 OTOP1Q7RTM1 612 aa22.42■■□□□ 1.18
SNHG12-201ENST00000461448 FCHSD1Q86WN1 690 aa22.42■■□□□ 1.18
SNHG12-201ENST00000461448 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
SNHG12-201ENST00000461448 SLC5A4Q9NY91 659 aa22.42■■□□□ 1.18
SNHG12-201ENST00000461448 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa22.41■■□□□ 1.18
SNHG12-201ENST00000461448 STX6O43752 255 aa22.41■■□□□ 1.18
SNHG12-201ENST00000461448 GHRHRQ02643 423 aa22.41■■□□□ 1.18
SNHG12-201ENST00000461448 MCTP2Q6DN12 878 aa22.41■■□□□ 1.18
SNHG12-201ENST00000461448 USP6NLQ92738 828 aa22.41■■□□□ 1.18
SNHG12-201ENST00000461448 MGAMO43451 1857 aa22.4■■□□□ 1.18
SNHG12-201ENST00000461448 PLXNB2O15031 1838 aa22.4■■□□□ 1.18
SNHG12-201ENST00000461448 PIK3CDO00329 1044 aa22.4■■□□□ 1.18
SNHG12-201ENST00000461448 MMP1P03956 469 aa22.4■■□□□ 1.18
SNHG12-201ENST00000461448 TAAR1Q96RJ0 339 aa22.4■■□□□ 1.18
SNHG12-201ENST00000461448 COL20A1Q9P218 1284 aa22.4■■□□□ 1.18
SNHG12-201ENST00000461448 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
SNHG12-201ENST00000461448 PCDHA4Q9UN74 947 aa22.4■■□□□ 1.18
SNHG12-201ENST00000461448 ADAMTS3O15072 1205 aa22.39■■□□□ 1.18
SNHG12-201ENST00000461448 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.18
SNHG12-201ENST00000461448 ZNF792Q3KQV3 632 aa22.39■■□□□ 1.18
SNHG12-201ENST00000461448 BLIDQ8IZY5 108 aa22.39■■□□□ 1.18
SNHG12-201ENST00000461448 FAM133AQ8N9E0 248 aa22.39■■□□□ 1.18
SNHG12-201ENST00000461448 DAGLBQ8NCG7 672 aa22.39■■□□□ 1.18
SNHG12-201ENST00000461448 NPLOC4Q8TAT6 608 aa22.39■■□□□ 1.18
SNHG12-201ENST00000461448 TMEM260Q9NX78 707 aa22.39■■□□□ 1.18
SNHG12-201ENST00000461448 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
SNHG12-201ENST00000461448 SOWAHBA6NEL2 793 aa22.39■■□□□ 1.17
SNHG12-201ENST00000461448 KRT2P35908 639 aa22.39■■□□□ 1.17
SNHG12-201ENST00000461448 PRMT2P55345 433 aa22.39■■□□□ 1.17
SNHG12-201ENST00000461448 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa22.39■■□□□ 1.17
SNHG12-201ENST00000461448 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
SNHG12-201ENST00000461448 RAET1EQ8TD07 263 aa22.39■■□□□ 1.17
SNHG12-201ENST00000461448 APBA2Q99767 749 aa22.39■■□□□ 1.17
SNHG12-201ENST00000461448 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
SNHG12-201ENST00000461448 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
SNHG12-201ENST00000461448 SPDYE3A6NKU9 549 aa22.38■■□□□ 1.17
SNHG12-201ENST00000461448 HOXC6P09630 235 aa22.38■■□□□ 1.17
SNHG12-201ENST00000461448 NUCB2P80303 420 aa22.38■■□□□ 1.17
SNHG12-201ENST00000461448 RASGRP4Q8TDF6 673 aa22.38■■□□□ 1.17
SNHG12-201ENST00000461448 RMDN3Q96TC7 470 aa22.38■■□□□ 1.17
SNHG12-201ENST00000461448 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa22.37■■□□□ 1.17
SNHG12-201ENST00000461448 NPY5RQ15761 445 aa22.37■■□□□ 1.17
SNHG12-201ENST00000461448 ARHGEF16Q5VV41 709 aa22.37■■□□□ 1.17
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