RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF532Q9HCE3 1301 aa19.75■□□□□ 0.75
SPCS1-201ENST00000233025 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa19.74■□□□□ 0.75
SPCS1-201ENST00000233025 GPNMBQ14956 572 aa19.74■□□□□ 0.75
SPCS1-201ENST00000233025 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa19.74■□□□□ 0.75
SPCS1-201ENST00000233025 RETREG2Q8NC44 543 aa19.74■□□□□ 0.75
SPCS1-201ENST00000233025 SSH3Q8TE77 659 aa19.74■□□□□ 0.75
SPCS1-201ENST00000233025 RAD9AQ99638 391 aa19.74■□□□□ 0.75
SPCS1-201ENST00000233025 ZBED2Q9BTP6 218 aa19.74■□□□□ 0.75
SPCS1-201ENST00000233025 HOMER2Q9NSB8 354 aa19.74■□□□□ 0.75
SPCS1-201ENST00000233025 POLR3EQ9NVU0 708 aa19.74■□□□□ 0.75
SPCS1-201ENST00000233025 MUTYHQ9UIF7 546 aa19.74■□□□□ 0.75
SPCS1-201ENST00000233025 VPS13AQ96RL7 3174 aa19.73■□□□□ 0.75
SPCS1-201ENST00000233025 F5H6K3 240 aa19.73■□□□□ 0.75
SPCS1-201ENST00000233025 PRKAB2O43741 272 aa19.73■□□□□ 0.75
SPCS1-201ENST00000233025 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP19.73■□□□□ 0.75
SPCS1-201ENST00000233025 KLRC3Q07444 240 aa19.73■□□□□ 0.75
SPCS1-201ENST00000233025 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa19.73■□□□□ 0.75
SPCS1-201ENST00000233025 ARHGAP45Q92619 1136 aa19.73■□□□□ 0.75
SPCS1-201ENST00000233025 KIFC2Q96AC6 838 aa19.73■□□□□ 0.75
SPCS1-201ENST00000233025 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP19.73■□□□□ 0.75
SPCS1-201ENST00000233025 ACAD9Q9H845 621 aa19.73■□□□□ 0.75
SPCS1-201ENST00000233025 ARMT1Q9H993 441 aa19.73■□□□□ 0.75
SPCS1-201ENST00000233025 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP19.73■□□□□ 0.75
SPCS1-201ENST00000233025 FAM50BQ9Y247 325 aa19.73■□□□□ 0.75
SPCS1-201ENST00000233025 EPG5Q9HCE0 2579 aa19.73■□□□□ 0.75
SPCS1-201ENST00000233025 COL4A6Q14031 1691 aa19.72■□□□□ 0.75
SPCS1-201ENST00000233025 SURF6O75683 361 aaKnown RBP19.72■□□□□ 0.75
SPCS1-201ENST00000233025 BFSP2Q13515 415 aa19.72■□□□□ 0.75
SPCS1-201ENST00000233025 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP19.72■□□□□ 0.75
SPCS1-201ENST00000233025 NBPF20Q3BBV1 942 aa19.72■□□□□ 0.75
SPCS1-201ENST00000233025 NFRKBQ6P4R8 1299 aa19.72■□□□□ 0.75
SPCS1-201ENST00000233025 EEPD1Q7L9B9 569 aa19.72■□□□□ 0.75
SPCS1-201ENST00000233025 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP19.72■□□□□ 0.75
SPCS1-201ENST00000233025 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP19.72■□□□□ 0.75
SPCS1-201ENST00000233025 PRRX2Q99811 253 aa19.72■□□□□ 0.75
SPCS1-201ENST00000233025 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa19.72■□□□□ 0.75
SPCS1-201ENST00000233025 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP19.72■□□□□ 0.75
SPCS1-201ENST00000233025 DUSP28Q4G0W2 176 aa19.71■□□□□ 0.75
SPCS1-201ENST00000233025 TIGD5Q53EQ6 642 aa19.71■□□□□ 0.75
SPCS1-201ENST00000233025 FAM47CQ5HY64 1035 aa19.71■□□□□ 0.75
SPCS1-201ENST00000233025 FBXO22Q8NEZ5 403 aa19.71■□□□□ 0.75
SPCS1-201ENST00000233025 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa19.71■□□□□ 0.75
SPCS1-201ENST00000233025 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP19.71■□□□□ 0.75
SPCS1-201ENST00000233025 VTA1Q9NP79 307 aa19.71■□□□□ 0.75
SPCS1-201ENST00000233025 NYAP2Q9P242 653 aa19.71■□□□□ 0.75
SPCS1-201ENST00000233025 COG6Q9Y2V7 657 aa19.71■□□□□ 0.75
SPCS1-201ENST00000233025 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP19.71■□□□□ 0.75
SPCS1-201ENST00000233025 USP17L12C9JPN9 530 aa19.7■□□□□ 0.74
SPCS1-201ENST00000233025 USP17L21D6R901 530 aa19.7■□□□□ 0.74
SPCS1-201ENST00000233025 CCER2I3L3R5 266 aa19.7■□□□□ 0.74
SPCS1-201ENST00000233025 MYL3P08590 195 aa19.7■□□□□ 0.74
SPCS1-201ENST00000233025 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP19.7■□□□□ 0.74
SPCS1-201ENST00000233025 TCTN1Q2MV58 587 aa19.7■□□□□ 0.74
SPCS1-201ENST00000233025 C17orf80Q9BSJ5 609 aa19.7■□□□□ 0.74
SPCS1-201ENST00000233025 ZBED9Q6R2W3 1325 aa19.7■□□□□ 0.74
SPCS1-201ENST00000233025 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa19.69■□□□□ 0.74
SPCS1-201ENST00000233025 CNKSR3Q6P9H4 555 aa19.69■□□□□ 0.74
SPCS1-201ENST00000233025 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa19.69■□□□□ 0.74
SPCS1-201ENST00000233025 MORC4Q8TE76 937 aa19.69■□□□□ 0.74
SPCS1-201ENST00000233025 EDAQ92838 391 aa19.69■□□□□ 0.74
SPCS1-201ENST00000233025 CTAGE1Q96RT6 745 aa19.69■□□□□ 0.74
SPCS1-201ENST00000233025 RNF146Q9NTX7 359 aa19.69■□□□□ 0.74
SPCS1-201ENST00000233025 FAM86C1Q9NVL1 165 aa19.69■□□□□ 0.74
SPCS1-201ENST00000233025 FEM1BQ9UK73 627 aa19.69■□□□□ 0.74
SPCS1-201ENST00000233025 MBD4O95243 580 aa19.68■□□□□ 0.74
SPCS1-201ENST00000233025 CXCL10P02778 98 aa19.68■□□□□ 0.74
SPCS1-201ENST00000233025 CPT1AP50416 773 aa19.68■□□□□ 0.74
SPCS1-201ENST00000233025 RARSP54136 660 aaKnown RBP19.68■□□□□ 0.74
SPCS1-201ENST00000233025 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP19.68■□□□□ 0.74
SPCS1-201ENST00000233025 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP19.68■□□□□ 0.74
SPCS1-201ENST00000233025 RNF135Q8IUD6 432 aa19.68■□□□□ 0.74
SPCS1-201ENST00000233025 CAGE1Q8TC20 777 aa19.68■□□□□ 0.74
SPCS1-201ENST00000233025 AFAP1L1Q8TED9 768 aa19.68■□□□□ 0.74
SPCS1-201ENST00000233025 CTNNA3Q9UI47 895 aa19.68■□□□□ 0.74
SPCS1-201ENST00000233025 BCAR3O75815 825 aa19.67■□□□□ 0.74
SPCS1-201ENST00000233025 ATP8B2P98198 1209 aa19.67■□□□□ 0.74
SPCS1-201ENST00000233025 PKN1Q16512 942 aa19.67■□□□□ 0.74
SPCS1-201ENST00000233025 TCEAL5Q5H9L2 206 aa19.67■□□□□ 0.74
SPCS1-201ENST00000233025 AMOTL1Q8IY63 956 aa19.67■□□□□ 0.74
SPCS1-201ENST00000233025 BANK1Q8NDB2 785 aa19.67■□□□□ 0.74
SPCS1-201ENST00000233025 TNNQ9UQP3 1299 aa19.67■□□□□ 0.74
SPCS1-201ENST00000233025 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa19.66■□□□□ 0.74
SPCS1-201ENST00000233025 TMEM221A6NGB7 291 aa19.66■□□□□ 0.74
SPCS1-201ENST00000233025 M0R296 226 aa19.66■□□□□ 0.74
SPCS1-201ENST00000233025 TRIM27P14373 513 aa19.66■□□□□ 0.74
SPCS1-201ENST00000233025 LTBRP36941 435 aa19.66■□□□□ 0.74
SPCS1-201ENST00000233025 PTPROQ16827 1216 aa19.66■□□□□ 0.74
SPCS1-201ENST00000233025 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP19.66■□□□□ 0.74
SPCS1-201ENST00000233025 TPRP12270 2363 aaKnown RBP19.65■□□□□ 0.74
SPCS1-201ENST00000233025 NBNO60934 754 aa19.65■□□□□ 0.74
SPCS1-201ENST00000233025 SELPP16109 830 aa19.65■□□□□ 0.74
SPCS1-201ENST00000233025 RASA1P20936 1047 aa19.65■□□□□ 0.74
SPCS1-201ENST00000233025 RBL2Q08999 1139 aa19.65■□□□□ 0.74
SPCS1-201ENST00000233025 SLFNL1Q499Z3 407 aa19.65■□□□□ 0.74
SPCS1-201ENST00000233025 FAM117BQ6P1L5 589 aa19.65■□□□□ 0.74
SPCS1-201ENST00000233025 CTR9Q6PD62 1173 aa19.65■□□□□ 0.74
SPCS1-201ENST00000233025 TRIM67Q6ZTA4 783 aa19.65■□□□□ 0.74
SPCS1-201ENST00000233025 CCDC155Q8N6L0 562 aa19.65■□□□□ 0.74
SPCS1-201ENST00000233025 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP19.65■□□□□ 0.74
SPCS1-201ENST00000233025 PBXIP1Q96AQ6 731 aa19.65■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.3 ms