RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000086471.11

Suds3-201, Transcript of Sin3 histone deacetylase corepressor complex component SDS3, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Suds3, Length 2,425 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Suds3-201ENSMUST00000086471 Brms1Q99N20 246 aa26.05■■□□□ 1.76
Suds3-201ENSMUST00000086471 Ifi202Q9R002 445 aa26.05■■□□□ 1.76
Suds3-201ENSMUST00000086471 BcamQ9R069 622 aa26.05■■□□□ 1.76
Suds3-201ENSMUST00000086471 Cacna1fQ9JIS7 1985 aa26.05■■□□□ 1.76
Suds3-201ENSMUST00000086471 Pgrmc2Q80UU9 217 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
Suds3-201ENSMUST00000086471 Thap2Q9D305 217 aa26.05■■□□□ 1.76
Suds3-201ENSMUST00000086471 Tjp3Q9QXY1 905 aa26.05■■□□□ 1.76
Suds3-201ENSMUST00000086471 Cul4bA2A432 970 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
Suds3-201ENSMUST00000086471 Mcm6P97311 821 aa26.04■■□□□ 1.76
Suds3-201ENSMUST00000086471 Nlrp2Q4PLS0 1046 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
Suds3-201ENSMUST00000086471 Zkscan4Q5SZT6 480 aa26.04■■□□□ 1.76
Suds3-201ENSMUST00000086471 Sox30Q8CGW4 782 aa26.04■■□□□ 1.76
Suds3-201ENSMUST00000086471 C8aQ8K182 587 aa26.04■■□□□ 1.76
Suds3-201ENSMUST00000086471 MyripQ8K3I4 856 aa26.04■■□□□ 1.76
Suds3-201ENSMUST00000086471 Mettl16Q9CQG2 553 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
Suds3-201ENSMUST00000086471 Gm4307E9PZY4 289 aa26.04■■□□□ 1.76
Suds3-201ENSMUST00000086471 Gm4312K9J7E2 289 aa26.04■■□□□ 1.76
Suds3-201ENSMUST00000086471 PpardP35396 440 aa26.04■■□□□ 1.76
Suds3-201ENSMUST00000086471 Pls1Q3V0K9 630 aa26.04■■□□□ 1.76
Suds3-201ENSMUST00000086471 NapaQ9DB05 295 aa26.04■■□□□ 1.76
Suds3-201ENSMUST00000086471 Scn3aA2ASI5 1947 aa26.03■■□□□ 1.76
Suds3-201ENSMUST00000086471 Git2Q9JLQ2 708 aa26.03■■□□□ 1.76
Suds3-201ENSMUST00000086471 Fermt2Q8CIB5 680 aa26.03■■□□□ 1.76
Suds3-201ENSMUST00000086471 Vmn2r71L7N2D8 855 aa26.02■■□□□ 1.76
Suds3-201ENSMUST00000086471 Fgfr2P21803 821 aa26.02■■□□□ 1.76
Suds3-201ENSMUST00000086471 Xxylt1Q3U4G3 392 aa26.02■■□□□ 1.76
Suds3-201ENSMUST00000086471 Foxd1Q61345 456 aa26.02■■□□□ 1.76
Suds3-201ENSMUST00000086471 Aggf1Q7TN31 711 aa26.02■■□□□ 1.76
Suds3-201ENSMUST00000086471 Amer1Q7TS75 1132 aa26.02■■□□□ 1.76
Suds3-201ENSMUST00000086471 Vav3Q9R0C8 847 aa26.02■■□□□ 1.76
Suds3-201ENSMUST00000086471 Mrvi1Q9WUX5 899 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
Suds3-201ENSMUST00000086471 SrcapA0A087WQ44 3271 aa26.02■■□□□ 1.76
Suds3-201ENSMUST00000086471 Ccdc88cQ6VGS5 2009 aa26.02■■□□□ 1.76
Suds3-201ENSMUST00000086471 Has3O08650 554 aa26.02■■□□□ 1.76
Suds3-201ENSMUST00000086471 Gprc5cQ8K3J9 440 aa26.02■■□□□ 1.76
Suds3-201ENSMUST00000086471 Txndc5Q91W90 417 aa26.02■■□□□ 1.76
Suds3-201ENSMUST00000086471 BaatQ91X34 420 aa26.02■■□□□ 1.76
Suds3-201ENSMUST00000086471 Tfr2Q9JKX3 798 aa26.02■■□□□ 1.76
Suds3-201ENSMUST00000086471 Fxr2Q9WVR4 673 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
Suds3-201ENSMUST00000086471 Dock2Q8C3J5 1828 aa26.01■■□□□ 1.75
Suds3-201ENSMUST00000086471 Magea1O89006 320 aa26.01■■□□□ 1.75
Suds3-201ENSMUST00000086471 Magea5O89009 320 aa26.01■■□□□ 1.75
Suds3-201ENSMUST00000086471 Parp1P11103 1013 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
Suds3-201ENSMUST00000086471 NfibP97863 570 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
Suds3-201ENSMUST00000086471 Eps8l1Q8R5F8 716 aa26.01■■□□□ 1.75
Suds3-201ENSMUST00000086471 Kremen1Q99N43 473 aa26.01■■□□□ 1.75
Suds3-201ENSMUST00000086471 Tmod2Q9JKK7 351 aa26.01■■□□□ 1.75
Suds3-201ENSMUST00000086471 Mkrn1Q9QXP6 481 aa26.01■■□□□ 1.75
Suds3-201ENSMUST00000086471 Magea2Q9R2A2 320 aa26.01■■□□□ 1.75
Suds3-201ENSMUST00000086471 CatspereP0DP43 985 aa26■■□□□ 1.75
Suds3-201ENSMUST00000086471 LeprP48356 1162 aa26■■□□□ 1.75
Suds3-201ENSMUST00000086471 Zc3h15Q3TIV5 426 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
Suds3-201ENSMUST00000086471 Rasa3Q60790 834 aa26■■□□□ 1.75
Suds3-201ENSMUST00000086471 Ccdc189Q6NZQ0 333 aa26■■□□□ 1.75
Suds3-201ENSMUST00000086471 Txndc16Q7TN22 820 aa26■■□□□ 1.75
Suds3-201ENSMUST00000086471 Dennd2aQ8C4S8 1000 aa26■■□□□ 1.75
Suds3-201ENSMUST00000086471 Nr3c2Q8VII8 978 aa26■■□□□ 1.75
Suds3-201ENSMUST00000086471 Pdcd6ipQ9WU78 869 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
Suds3-201ENSMUST00000086471 Herc3A6H6S0 1050 aa25.99■■□□□ 1.75
Suds3-201ENSMUST00000086471 Flot1O08917 428 aa25.99■■□□□ 1.75
Suds3-201ENSMUST00000086471 Rad51bO35719 350 aa25.99■■□□□ 1.75
Suds3-201ENSMUST00000086471 Setd4P58467 439 aa25.99■■□□□ 1.75
Suds3-201ENSMUST00000086471 Eif3j2Q66JS6 263 aa25.99■■□□□ 1.75
Suds3-201ENSMUST00000086471 Dync1li2Q6PDL0 492 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
Suds3-201ENSMUST00000086471 Ccdc122Q8BVN0 290 aa25.99■■□□□ 1.75
Suds3-201ENSMUST00000086471 Tnip1Q9WUU8 647 aa25.99■■□□□ 1.75
Suds3-201ENSMUST00000086471 Ankrd40Q5SUE8 363 aa25.99■■□□□ 1.75
Suds3-201ENSMUST00000086471 Churc1Q6DG52 112 aa25.99■■□□□ 1.75
Suds3-201ENSMUST00000086471 Asnsd1Q8BFS9 627 aa25.99■■□□□ 1.75
Suds3-201ENSMUST00000086471 Enox1Q8BHR2 643 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
Suds3-201ENSMUST00000086471 Trim9Q8C7M3 817 aa25.99■■□□□ 1.75
Suds3-201ENSMUST00000086471 Tdrd1Q99MV1 1172 aa25.99■■□□□ 1.75
Suds3-201ENSMUST00000086471 Armc3A2AU72 881 aa25.98■■□□□ 1.75
Suds3-201ENSMUST00000086471 Ddx23D3Z0M9 819 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
Suds3-201ENSMUST00000086471 L1camP11627 1260 aa25.98■■□□□ 1.75
Suds3-201ENSMUST00000086471 Mmp14P53690 582 aa25.98■■□□□ 1.75
Suds3-201ENSMUST00000086471 Gzf1Q4VBD9 706 aa25.98■■□□□ 1.75
Suds3-201ENSMUST00000086471 Asic1Q6NXK8 526 aa25.98■■□□□ 1.75
Suds3-201ENSMUST00000086471 Usp17leQ7M764 540 aa25.98■■□□□ 1.75
Suds3-201ENSMUST00000086471 Cnksr2Q80YA9 1032 aa25.98■■□□□ 1.75
Suds3-201ENSMUST00000086471 Gtf3c5Q8R2T8 520 aa25.98■■□□□ 1.75
Suds3-201ENSMUST00000086471 Cry2Q9R194 592 aa25.98■■□□□ 1.75
Suds3-201ENSMUST00000086471 Polr2aP08775 1970 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
Suds3-201ENSMUST00000086471 Oog1E9Q5G7 496 aa25.98■■□□□ 1.75
Suds3-201ENSMUST00000086471 Mmp10O55123 476 aa25.98■■□□□ 1.75
Suds3-201ENSMUST00000086471 Secisbp2lQ6A098 1086 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
Suds3-201ENSMUST00000086471 Adam6bQ6IMH7 756 aa25.98■■□□□ 1.75
Suds3-201ENSMUST00000086471 Garem2Q6PAJ3 880 aa25.98■■□□□ 1.75
Suds3-201ENSMUST00000086471 Sap130Q8BIH0 1057 aa25.98■■□□□ 1.75
Suds3-201ENSMUST00000086471 Thap3Q8BJ25 218 aa25.98■■□□□ 1.75
Suds3-201ENSMUST00000086471 Klhl30Q8C3F7 581 aa25.98■■□□□ 1.75
Suds3-201ENSMUST00000086471 Cacnb1Q8R3Z5 597 aa25.98■■□□□ 1.75
Suds3-201ENSMUST00000086471 Pcdha12Q91Y18 950 aa25.98■■□□□ 1.75
Suds3-201ENSMUST00000086471 Ddx20Q9JJY4 825 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
Suds3-201ENSMUST00000086471 C87977A2A958 498 aa25.97■■□□□ 1.75
Suds3-201ENSMUST00000086471 Akap2O54931 893 aa25.97■■□□□ 1.75
Suds3-201ENSMUST00000086471 GabpaQ00422 454 aa25.97■■□□□ 1.75
Suds3-201ENSMUST00000086471 Meis1Q60954 390 aa25.97■■□□□ 1.75
Suds3-201ENSMUST00000086471 Anks1bQ8BIZ1 1259 aa25.97■■□□□ 1.75
Suds3-201ENSMUST00000086471 CnstQ8CBC4 711 aa25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 20.8 ms