Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN22

Txndc16, Thioredoxin domain-containing protein 16, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Txndc16Q7TN22 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC40,34■■■■■ 4,05
Txndc16Q7TN22 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,26■■■■□ 3,72
Txndc16Q7TN22 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,17■■■■□ 3,54
Txndc16Q7TN22 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC36,98■■■■□ 3,51
Txndc16Q7TN22 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,95■■■■□ 3,51
Txndc16Q7TN22 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,57■■■■□ 3,44
Txndc16Q7TN22 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC35,91■■■■□ 3,34
Txndc16Q7TN22 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC35,59■■■■□ 3,29
Txndc16Q7TN22 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,54■■■■□ 3,28
Txndc16Q7TN22 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC35,21■■■■□ 3,23
Txndc16Q7TN22 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,94■■■■□ 3,18
Txndc16Q7TN22 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,75■■■■□ 3,15
Txndc16Q7TN22 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC34,75■■■■□ 3,15
Txndc16Q7TN22 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC34,63■■■■□ 3,13
Txndc16Q7TN22 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,6■■■■□ 3,13
Txndc16Q7TN22 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,3■■■■□ 3,08
Txndc16Q7TN22 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,25■■■■□ 3,07
Txndc16Q7TN22 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,22■■■■□ 3,07
Txndc16Q7TN22 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,11■■■■□ 3,05
Txndc16Q7TN22 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,07■■■■□ 3,05
Txndc16Q7TN22 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,01■■■■□ 3,04
Txndc16Q7TN22 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3,03
Txndc16Q7TN22 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,99■■■■□ 3,03
Txndc16Q7TN22 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,96■■■■□ 3,03
Txndc16Q7TN22 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,92■■■■□ 3,02
Txndc16Q7TN22 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33,88■■■■□ 3,01
Txndc16Q7TN22 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC33,79■■■■□ 3
Txndc16Q7TN22 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC33,79■■■■□ 3
Txndc16Q7TN22 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33,64■■■□□ 2,98
Txndc16Q7TN22 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,6■■■□□ 2,97
Txndc16Q7TN22 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,57■■■□□ 2,96
Txndc16Q7TN22 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,53■■■□□ 2,96
Txndc16Q7TN22 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,52■■■□□ 2,96
Txndc16Q7TN22 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC33,48■■■□□ 2,95
Txndc16Q7TN22 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,43■■■□□ 2,94
Txndc16Q7TN22 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,28■■■□□ 2,92
Txndc16Q7TN22 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,11■■■□□ 2,89
Txndc16Q7TN22 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,07■■■□□ 2,88
Txndc16Q7TN22 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,06■■■□□ 2,88
Txndc16Q7TN22 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC33,02■■■□□ 2,88
Txndc16Q7TN22 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC33,01■■■□□ 2,87
Txndc16Q7TN22 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC32,87■■■□□ 2,85
Txndc16Q7TN22 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,86■■■□□ 2,85
Txndc16Q7TN22 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC32,73■■■□□ 2,83
Txndc16Q7TN22 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC32,65■■■□□ 2,82
Txndc16Q7TN22 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,61■■■□□ 2,81
Txndc16Q7TN22 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,55■■■□□ 2,8
Txndc16Q7TN22 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC32,55■■■□□ 2,8
Txndc16Q7TN22 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC32,51■■■□□ 2,79
Txndc16Q7TN22 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC32,46■■■□□ 2,79
Txndc16Q7TN22 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,28■■■□□ 2,76
Txndc16Q7TN22 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,13■■■□□ 2,73
Txndc16Q7TN22 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,04■■■□□ 2,72
Txndc16Q7TN22 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC32,01■■■□□ 2,71
Txndc16Q7TN22 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,97■■■□□ 2,71
Txndc16Q7TN22 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC31,95■■■□□ 2,71
Txndc16Q7TN22 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,92■■■□□ 2,7
Txndc16Q7TN22 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,85■■■□□ 2,69
Txndc16Q7TN22 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,85■■■□□ 2,69
Txndc16Q7TN22 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC31,83■■■□□ 2,69
Txndc16Q7TN22 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,78■■■□□ 2,68
Txndc16Q7TN22 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31,78■■■□□ 2,68
Txndc16Q7TN22 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC31,77■■■□□ 2,68
Txndc16Q7TN22 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,77■■■□□ 2,68
Txndc16Q7TN22 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,77■■■□□ 2,68
Txndc16Q7TN22 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31,75■■■□□ 2,67
Txndc16Q7TN22 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,73■■■□□ 2,67
Txndc16Q7TN22 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC31,63■■■□□ 2,65
Txndc16Q7TN22 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,63■■■□□ 2,65
Txndc16Q7TN22 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31,62■■■□□ 2,65
Txndc16Q7TN22 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC31,62■■■□□ 2,65
Txndc16Q7TN22 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC31,59■■■□□ 2,65
Txndc16Q7TN22 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC31,53■■■□□ 2,64
Txndc16Q7TN22 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,53■■■□□ 2,64
Txndc16Q7TN22 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,39■■■□□ 2,62
Txndc16Q7TN22 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,38■■■□□ 2,61
Txndc16Q7TN22 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,37■■■□□ 2,61
Txndc16Q7TN22 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,33■■■□□ 2,61
Txndc16Q7TN22 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC31,33■■■□□ 2,61
Txndc16Q7TN22 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,32■■■□□ 2,6
Txndc16Q7TN22 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC31,31■■■□□ 2,6
Txndc16Q7TN22 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,28■■■□□ 2,6
Txndc16Q7TN22 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,23■■■□□ 2,59
Txndc16Q7TN22 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,2■■■□□ 2,58
Txndc16Q7TN22 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,19■■■□□ 2,58
Txndc16Q7TN22 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,19■■■□□ 2,58
Txndc16Q7TN22 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,14■■■□□ 2,58
Txndc16Q7TN22 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,1■■■□□ 2,57
Txndc16Q7TN22 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,05■■■□□ 2,56
Txndc16Q7TN22 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31,04■■■□□ 2,56
Txndc16Q7TN22 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31,03■■■□□ 2,56
Txndc16Q7TN22 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2,55
Txndc16Q7TN22 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,99■■■□□ 2,55
Txndc16Q7TN22 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,95■■■□□ 2,55
Txndc16Q7TN22 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC30,95■■■□□ 2,54
Txndc16Q7TN22 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,94■■■□□ 2,54
Txndc16Q7TN22 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,91■■■□□ 2,54
Txndc16Q7TN22 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC30,87■■■□□ 2,53
Txndc16Q7TN22 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC30,84■■■□□ 2,53
Txndc16Q7TN22 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,83■■■□□ 2,53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,1 ms