Protein–RNA interactions for Protein: Q6A098

Secisbp2l, Selenocysteine insertion sequence-binding protein 2-like, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,086 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Secisbp2lQ6A098 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC46,47■■■■■ 5,03
Secisbp2lQ6A098 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC43,19■■■■■ 4,5
Secisbp2lQ6A098 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,58■■■■■ 4,41
Secisbp2lQ6A098 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC40,5■■■■■ 4,07
Secisbp2lQ6A098 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC40,16■■■■■ 4,02
Secisbp2lQ6A098 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC39,3■■■■□ 3,88
Secisbp2lQ6A098 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,28■■■■□ 3,88
Secisbp2lQ6A098 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,19■■■■□ 3,86
Secisbp2lQ6A098 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC39,15■■■■□ 3,86
Secisbp2lQ6A098 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC38,79■■■■□ 3,8
Secisbp2lQ6A098 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,58■■■■□ 3,77
Secisbp2lQ6A098 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC37,93■■■■□ 3,66
Secisbp2lQ6A098 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,73■■■■□ 3,63
Secisbp2lQ6A098 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37,62■■■■□ 3,61
Secisbp2lQ6A098 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC37,53■■■■□ 3,6
Secisbp2lQ6A098 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,52■■■■□ 3,6
Secisbp2lQ6A098 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,52■■■■□ 3,6
Secisbp2lQ6A098 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,32■■■■□ 3,56
Secisbp2lQ6A098 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC37,19■■■■□ 3,54
Secisbp2lQ6A098 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,99■■■■□ 3,51
Secisbp2lQ6A098 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC36,94■■■■□ 3,5
Secisbp2lQ6A098 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,93■■■■□ 3,5
Secisbp2lQ6A098 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,9■■■■□ 3,5
Secisbp2lQ6A098 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC36,81■■■■□ 3,48
Secisbp2lQ6A098 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,45■■■■□ 3,43
Secisbp2lQ6A098 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,37■■■■□ 3,41
Secisbp2lQ6A098 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36,16■■■■□ 3,38
Secisbp2lQ6A098 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,06■■■■□ 3,36
Secisbp2lQ6A098 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC35,99■■■■□ 3,35
Secisbp2lQ6A098 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,95■■■■□ 3,35
Secisbp2lQ6A098 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC35,9■■■■□ 3,34
Secisbp2lQ6A098 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35,85■■■■□ 3,33
Secisbp2lQ6A098 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC35,67■■■■□ 3,3
Secisbp2lQ6A098 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35,64■■■■□ 3,3
Secisbp2lQ6A098 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,63■■■■□ 3,29
Secisbp2lQ6A098 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC35,63■■■■□ 3,29
Secisbp2lQ6A098 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC35,58■■■■□ 3,29
Secisbp2lQ6A098 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,54■■■■□ 3,28
Secisbp2lQ6A098 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,44■■■■□ 3,26
Secisbp2lQ6A098 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC35,35■■■■□ 3,25
Secisbp2lQ6A098 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC35,28■■■■□ 3,24
Secisbp2lQ6A098 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC35,11■■■■□ 3,21
Secisbp2lQ6A098 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC35,09■■■■□ 3,21
Secisbp2lQ6A098 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC34,97■■■■□ 3,19
Secisbp2lQ6A098 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,93■■■■□ 3,18
Secisbp2lQ6A098 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,89■■■■□ 3,18
Secisbp2lQ6A098 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC34,89■■■■□ 3,18
Secisbp2lQ6A098 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC34,81■■■■□ 3,16
Secisbp2lQ6A098 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC34,8■■■■□ 3,16
Secisbp2lQ6A098 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34,79■■■■□ 3,16
Secisbp2lQ6A098 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,79■■■■□ 3,16
Secisbp2lQ6A098 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC34,77■■■■□ 3,16
Secisbp2lQ6A098 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,68■■■■□ 3,14
Secisbp2lQ6A098 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,64■■■■□ 3,14
Secisbp2lQ6A098 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC34,64■■■■□ 3,14
Secisbp2lQ6A098 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,6■■■■□ 3,13
Secisbp2lQ6A098 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC34,59■■■■□ 3,13
Secisbp2lQ6A098 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC34,58■■■■□ 3,13
Secisbp2lQ6A098 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,58■■■■□ 3,13
Secisbp2lQ6A098 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,52■■■■□ 3,12
Secisbp2lQ6A098 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC34,48■■■■□ 3,11
Secisbp2lQ6A098 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34,41■■■■□ 3,1
Secisbp2lQ6A098 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC34,27■■■■□ 3,08
Secisbp2lQ6A098 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC34,25■■■■□ 3,07
Secisbp2lQ6A098 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC34,24■■■■□ 3,07
Secisbp2lQ6A098 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC34,14■■■■□ 3,06
Secisbp2lQ6A098 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,08■■■■□ 3,05
Secisbp2lQ6A098 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,01■■■■□ 3,04
Secisbp2lQ6A098 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,98■■■■□ 3,03
Secisbp2lQ6A098 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,9■■■■□ 3,02
Secisbp2lQ6A098 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,89■■■■□ 3,02
Secisbp2lQ6A098 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC33,88■■■■□ 3,01
Secisbp2lQ6A098 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC33,88■■■■□ 3,01
Secisbp2lQ6A098 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC33,87■■■■□ 3,01
Secisbp2lQ6A098 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,76■■■□□ 2,99
Secisbp2lQ6A098 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,76■■■□□ 2,99
Secisbp2lQ6A098 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,74■■■□□ 2,99
Secisbp2lQ6A098 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC33,73■■■□□ 2,99
Secisbp2lQ6A098 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,72■■■□□ 2,99
Secisbp2lQ6A098 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,72■■■□□ 2,99
Secisbp2lQ6A098 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,71■■■□□ 2,99
Secisbp2lQ6A098 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC33,65■■■□□ 2,98
Secisbp2lQ6A098 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,63■■■□□ 2,97
Secisbp2lQ6A098 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC33,58■■■□□ 2,97
Secisbp2lQ6A098 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,57■■■□□ 2,97
Secisbp2lQ6A098 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33,56■■■□□ 2,96
Secisbp2lQ6A098 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,46■■■□□ 2,95
Secisbp2lQ6A098 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC33,43■■■□□ 2,94
Secisbp2lQ6A098 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC33,42■■■□□ 2,94
Secisbp2lQ6A098 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC33,4■■■□□ 2,94
Secisbp2lQ6A098 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33,36■■■□□ 2,93
Secisbp2lQ6A098 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,36■■■□□ 2,93
Secisbp2lQ6A098 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC33,33■■■□□ 2,93
Secisbp2lQ6A098 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33,31■■■□□ 2,92
Secisbp2lQ6A098 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC33,26■■■□□ 2,92
Secisbp2lQ6A098 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,22■■■□□ 2,91
Secisbp2lQ6A098 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,2■■■□□ 2,91
Secisbp2lQ6A098 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33,2■■■□□ 2,9
Secisbp2lQ6A098 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC33,15■■■□□ 2,9
Secisbp2lQ6A098 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC33,14■■■□□ 2,9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,1 ms