Protein–RNA interactions for Protein: Q9R194

Cry2, Cryptochrome-2, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry2Q9R194 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC46.2■■■■■ 4.99
Cry2Q9R194 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC42.82■■■■■ 4.45
Cry2Q9R194 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
Cry2Q9R194 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC40.19■■■■■ 4.02
Cry2Q9R194 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC40.13■■■■■ 4.01
Cry2Q9R194 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC39.23■■■■□ 3.87
Cry2Q9R194 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
Cry2Q9R194 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
Cry2Q9R194 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
Cry2Q9R194 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC38.55■■■■□ 3.76
Cry2Q9R194 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
Cry2Q9R194 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Cry2Q9R194 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
Cry2Q9R194 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC37.51■■■■□ 3.6
Cry2Q9R194 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
Cry2Q9R194 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC37.22■■■■□ 3.55
Cry2Q9R194 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
Cry2Q9R194 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC37.11■■■■□ 3.53
Cry2Q9R194 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
Cry2Q9R194 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
Cry2Q9R194 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Cry2Q9R194 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Cry2Q9R194 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Cry2Q9R194 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Cry2Q9R194 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
Cry2Q9R194 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
Cry2Q9R194 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC36.45■■■■□ 3.43
Cry2Q9R194 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Cry2Q9R194 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Cry2Q9R194 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Cry2Q9R194 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Cry2Q9R194 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Cry2Q9R194 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
Cry2Q9R194 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
Cry2Q9R194 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Cry2Q9R194 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Cry2Q9R194 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
Cry2Q9R194 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC35.5■■■■□ 3.27
Cry2Q9R194 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC35.44■■■■□ 3.26
Cry2Q9R194 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Cry2Q9R194 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Cry2Q9R194 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Cry2Q9R194 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
Cry2Q9R194 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
Cry2Q9R194 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.2
Cry2Q9R194 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
Cry2Q9R194 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Cry2Q9R194 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
Cry2Q9R194 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Cry2Q9R194 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
Cry2Q9R194 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
Cry2Q9R194 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
Cry2Q9R194 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Cry2Q9R194 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Cry2Q9R194 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Cry2Q9R194 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Cry2Q9R194 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
Cry2Q9R194 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Cry2Q9R194 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
Cry2Q9R194 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
Cry2Q9R194 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Cry2Q9R194 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Cry2Q9R194 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
Cry2Q9R194 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Cry2Q9R194 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Cry2Q9R194 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Cry2Q9R194 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
Cry2Q9R194 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Cry2Q9R194 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Cry2Q9R194 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Cry2Q9R194 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
Cry2Q9R194 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Cry2Q9R194 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Cry2Q9R194 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Cry2Q9R194 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Cry2Q9R194 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Cry2Q9R194 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Cry2Q9R194 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Cry2Q9R194 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Cry2Q9R194 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Cry2Q9R194 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Cry2Q9R194 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Cry2Q9R194 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Cry2Q9R194 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Cry2Q9R194 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Cry2Q9R194 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Cry2Q9R194 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Cry2Q9R194 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Cry2Q9R194 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
Cry2Q9R194 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Cry2Q9R194 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Cry2Q9R194 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Cry2Q9R194 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Cry2Q9R194 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Cry2Q9R194 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Cry2Q9R194 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Cry2Q9R194 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Cry2Q9R194 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Cry2Q9R194 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Cry2Q9R194 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms