Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK7

Tmod2, Tropomodulin-2, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod2Q9JKK7 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC46,11■■■■■ 4,97
Tmod2Q9JKK7 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC42,75■■■■■ 4,43
Tmod2Q9JKK7 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,19■■■■■ 4,34
Tmod2Q9JKK7 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC40,1■■■■■ 4,01
Tmod2Q9JKK7 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC40,06■■■■■ 4
Tmod2Q9JKK7 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC39,1■■■■□ 3,85
Tmod2Q9JKK7 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,06■■■■□ 3,84
Tmod2Q9JKK7 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC38,96■■■■□ 3,83
Tmod2Q9JKK7 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,94■■■■□ 3,82
Tmod2Q9JKK7 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC38,54■■■■□ 3,76
Tmod2Q9JKK7 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,31■■■■□ 3,72
Tmod2Q9JKK7 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,01■■■■□ 3,68
Tmod2Q9JKK7 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,6■■■■□ 3,61
Tmod2Q9JKK7 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC37,44■■■■□ 3,58
Tmod2Q9JKK7 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,41■■■■□ 3,58
Tmod2Q9JKK7 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37,13■■■■□ 3,53
Tmod2Q9JKK7 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC37,1■■■■□ 3,53
Tmod2Q9JKK7 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC37,07■■■■□ 3,53
Tmod2Q9JKK7 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,95■■■■□ 3,51
Tmod2Q9JKK7 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,87■■■■□ 3,49
Tmod2Q9JKK7 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,69■■■■□ 3,46
Tmod2Q9JKK7 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,62■■■■□ 3,45
Tmod2Q9JKK7 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,6■■■■□ 3,45
Tmod2Q9JKK7 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,57■■■■□ 3,44
Tmod2Q9JKK7 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC36,56■■■■□ 3,44
Tmod2Q9JKK7 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC36,43■■■■□ 3,42
Tmod2Q9JKK7 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC36,39■■■■□ 3,42
Tmod2Q9JKK7 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,38■■■■□ 3,41
Tmod2Q9JKK7 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,36■■■■□ 3,41
Tmod2Q9JKK7 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,19■■■■□ 3,38
Tmod2Q9JKK7 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36,02■■■■□ 3,36
Tmod2Q9JKK7 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,92■■■■□ 3,34
Tmod2Q9JKK7 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35,81■■■■□ 3,32
Tmod2Q9JKK7 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC35,73■■■■□ 3,31
Tmod2Q9JKK7 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC35,61■■■■□ 3,29
Tmod2Q9JKK7 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,59■■■■□ 3,29
Tmod2Q9JKK7 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC35,46■■■■□ 3,27
Tmod2Q9JKK7 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,4■■■■□ 3,26
Tmod2Q9JKK7 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35,39■■■■□ 3,26
Tmod2Q9JKK7 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC35,35■■■■□ 3,25
Tmod2Q9JKK7 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,32■■■■□ 3,25
Tmod2Q9JKK7 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,22■■■■□ 3,23
Tmod2Q9JKK7 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC35,12■■■■□ 3,21
Tmod2Q9JKK7 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC35,08■■■■□ 3,21
Tmod2Q9JKK7 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC35,07■■■■□ 3,2
Tmod2Q9JKK7 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC34,99■■■■□ 3,19
Tmod2Q9JKK7 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,79■■■■□ 3,16
Tmod2Q9JKK7 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC34,73■■■■□ 3,15
Tmod2Q9JKK7 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,7■■■■□ 3,15
Tmod2Q9JKK7 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC34,63■■■■□ 3,13
Tmod2Q9JKK7 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC34,59■■■■□ 3,13
Tmod2Q9JKK7 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC34,57■■■■□ 3,12
Tmod2Q9JKK7 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,54■■■■□ 3,12
Tmod2Q9JKK7 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,51■■■■□ 3,11
Tmod2Q9JKK7 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC34,49■■■■□ 3,11
Tmod2Q9JKK7 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC34,41■■■■□ 3,1
Tmod2Q9JKK7 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC34,39■■■■□ 3,1
Tmod2Q9JKK7 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC34,39■■■■□ 3,1
Tmod2Q9JKK7 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC34,35■■■■□ 3,09
Tmod2Q9JKK7 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,31■■■■□ 3,08
Tmod2Q9JKK7 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,21■■■■□ 3,07
Tmod2Q9JKK7 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34,17■■■■□ 3,06
Tmod2Q9JKK7 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,15■■■■□ 3,06
Tmod2Q9JKK7 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC34,12■■■■□ 3,05
Tmod2Q9JKK7 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34,11■■■■□ 3,05
Tmod2Q9JKK7 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC34,09■■■■□ 3,05
Tmod2Q9JKK7 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC34,08■■■■□ 3,05
Tmod2Q9JKK7 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,07■■■■□ 3,04
Tmod2Q9JKK7 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC34,04■■■■□ 3,04
Tmod2Q9JKK7 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC34,03■■■■□ 3,04
Tmod2Q9JKK7 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,02■■■■□ 3,04
Tmod2Q9JKK7 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC33,94■■■■□ 3,02
Tmod2Q9JKK7 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,93■■■■□ 3,02
Tmod2Q9JKK7 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33,87■■■■□ 3,01
Tmod2Q9JKK7 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,86■■■■□ 3,01
Tmod2Q9JKK7 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC33,85■■■■□ 3,01
Tmod2Q9JKK7 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,85■■■■□ 3,01
Tmod2Q9JKK7 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,84■■■■□ 3,01
Tmod2Q9JKK7 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,67■■■□□ 2,98
Tmod2Q9JKK7 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,66■■■□□ 2,98
Tmod2Q9JKK7 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,64■■■□□ 2,98
Tmod2Q9JKK7 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC33,6■■■□□ 2,97
Tmod2Q9JKK7 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33,6■■■□□ 2,97
Tmod2Q9JKK7 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC33,56■■■□□ 2,96
Tmod2Q9JKK7 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,55■■■□□ 2,96
Tmod2Q9JKK7 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,48■■■□□ 2,95
Tmod2Q9JKK7 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC33,48■■■□□ 2,95
Tmod2Q9JKK7 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC33,47■■■□□ 2,95
Tmod2Q9JKK7 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,43■■■□□ 2,94
Tmod2Q9JKK7 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC33,39■■■□□ 2,94
Tmod2Q9JKK7 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,35■■■□□ 2,93
Tmod2Q9JKK7 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,34■■■□□ 2,93
Tmod2Q9JKK7 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33,33■■■□□ 2,93
Tmod2Q9JKK7 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC33,3■■■□□ 2,92
Tmod2Q9JKK7 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,2■■■□□ 2,91
Tmod2Q9JKK7 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33,19■■■□□ 2,9
Tmod2Q9JKK7 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC33,16■■■□□ 2,9
Tmod2Q9JKK7 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,16■■■□□ 2,9
Tmod2Q9JKK7 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,14■■■□□ 2,9
Tmod2Q9JKK7 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC33,1■■■□□ 2,89
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