Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK7

Tmod2, Tropomodulin-2, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod2Q9JKK7 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC46.11■■■■■ 4.97
Tmod2Q9JKK7 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
Tmod2Q9JKK7 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
Tmod2Q9JKK7 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC40.1■■■■■ 4.01
Tmod2Q9JKK7 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC40.06■■■■■ 4
Tmod2Q9JKK7 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC39.1■■■■□ 3.85
Tmod2Q9JKK7 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
Tmod2Q9JKK7 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
Tmod2Q9JKK7 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
Tmod2Q9JKK7 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC38.54■■■■□ 3.76
Tmod2Q9JKK7 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
Tmod2Q9JKK7 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
Tmod2Q9JKK7 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
Tmod2Q9JKK7 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC37.44■■■■□ 3.58
Tmod2Q9JKK7 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Tmod2Q9JKK7 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.53
Tmod2Q9JKK7 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC37.1■■■■□ 3.53
Tmod2Q9JKK7 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC37.07■■■■□ 3.53
Tmod2Q9JKK7 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Tmod2Q9JKK7 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
Tmod2Q9JKK7 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Tmod2Q9JKK7 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Tmod2Q9JKK7 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Tmod2Q9JKK7 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
Tmod2Q9JKK7 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
Tmod2Q9JKK7 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
Tmod2Q9JKK7 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
Tmod2Q9JKK7 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Tmod2Q9JKK7 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Tmod2Q9JKK7 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Tmod2Q9JKK7 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Tmod2Q9JKK7 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Tmod2Q9JKK7 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
Tmod2Q9JKK7 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
Tmod2Q9JKK7 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Tmod2Q9JKK7 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Tmod2Q9JKK7 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC35.46■■■■□ 3.27
Tmod2Q9JKK7 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Tmod2Q9JKK7 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
Tmod2Q9JKK7 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC35.35■■■■□ 3.25
Tmod2Q9JKK7 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
Tmod2Q9JKK7 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Tmod2Q9JKK7 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
Tmod2Q9JKK7 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
Tmod2Q9JKK7 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC35.07■■■■□ 3.2
Tmod2Q9JKK7 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
Tmod2Q9JKK7 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Tmod2Q9JKK7 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
Tmod2Q9JKK7 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Tmod2Q9JKK7 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
Tmod2Q9JKK7 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
Tmod2Q9JKK7 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
Tmod2Q9JKK7 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Tmod2Q9JKK7 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
Tmod2Q9JKK7 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Tmod2Q9JKK7 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Tmod2Q9JKK7 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Tmod2Q9JKK7 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
Tmod2Q9JKK7 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
Tmod2Q9JKK7 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Tmod2Q9JKK7 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Tmod2Q9JKK7 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Tmod2Q9JKK7 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Tmod2Q9JKK7 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Tmod2Q9JKK7 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Tmod2Q9JKK7 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Tmod2Q9JKK7 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
Tmod2Q9JKK7 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Tmod2Q9JKK7 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Tmod2Q9JKK7 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Tmod2Q9JKK7 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Tmod2Q9JKK7 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Tmod2Q9JKK7 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Tmod2Q9JKK7 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Tmod2Q9JKK7 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Tmod2Q9JKK7 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Tmod2Q9JKK7 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Tmod2Q9JKK7 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Tmod2Q9JKK7 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Tmod2Q9JKK7 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Tmod2Q9JKK7 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Tmod2Q9JKK7 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Tmod2Q9JKK7 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Tmod2Q9JKK7 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Tmod2Q9JKK7 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Tmod2Q9JKK7 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Tmod2Q9JKK7 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Tmod2Q9JKK7 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Tmod2Q9JKK7 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Tmod2Q9JKK7 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
Tmod2Q9JKK7 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Tmod2Q9JKK7 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Tmod2Q9JKK7 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Tmod2Q9JKK7 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Tmod2Q9JKK7 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Tmod2Q9JKK7 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Tmod2Q9JKK7 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
Tmod2Q9JKK7 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Tmod2Q9JKK7 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Tmod2Q9JKK7 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms