RNA–Protein interactions for RNA: YPR119W

CLB2, Transcript of B-type cyclin involved in cell cycle progression, yeast

Gene CLB2, Length 1,476 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cellular bud .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CLB2	YPR119W	YJL132W	P47014	750 aa		5.82	□□□□□ -1.48
CLB2	YPR119W	CCT8	P47079	568 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
CLB2	YPR119W	AIF1	P52923	378 aa		5.82	□□□□□ -1.48
CLB2	YPR119W	COG1	P53079	417 aa		5.82	□□□□□ -1.48
CLB2	YPR119W	BUD32	P53323	261 aa		5.82	□□□□□ -1.48
CLB2	YPR119W	FYV6	P53913	173 aa		5.82	□□□□□ -1.48
CLB2	YPR119W	LSM3	P57743	89 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
CLB2	YPR119W	GCN5	Q03330	439 aa		5.82	□□□□□ -1.48
CLB2	YPR119W	HER2	Q03557	464 aa		5.82	□□□□□ -1.48
CLB2	YPR119W	RSC2	Q06488	889 aa		5.82	□□□□□ -1.48
CLB2	YPR119W	YPR172W	Q06608	200 aa		5.82	□□□□□ -1.48
CLB2	YPR119W	AIM39	Q08223	395 aa		5.82	□□□□□ -1.48
CLB2	YPR119W	PFK27	Q12471	397 aa	Predicted RBP	5.82	□□□□□ -1.48
CLB2	YPR119W	SAS5	Q99314	248 aa		5.82	□□□□□ -1.48
CLB2	YPR119W	GAL10	P04397	699 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CLB2	YPR119W	COS2	P0CX12	379 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CLB2	YPR119W	COS3	P0CX13	379 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CLB2	YPR119W	MRP2	P10663	115 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
CLB2	YPR119W	PUT4	P15380	627 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CLB2	YPR119W	DAP2	P18962	818 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CLB2	YPR119W	SIT4	P20604	311 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CLB2	YPR119W	HXT2	P23585	541 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CLB2	YPR119W	YCL049C	P25577	312 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CLB2	YPR119W	YCL068C	P25593	260 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CLB2	YPR119W	CPR3	P25719	182 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CLB2	YPR119W	THI4	P32318	326 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CLB2	YPR119W	COT1	P32798	439 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CLB2	YPR119W	BEM3	P32873	1128 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CLB2	YPR119W	NOP4	P37838	685 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
CLB2	YPR119W	CST26	P38226	397 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CLB2	YPR119W	SDH8	P38345	138 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CLB2	YPR119W	RIM4	P38741	713 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CLB2	YPR119W	UTP18	P40362	594 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
CLB2	YPR119W	PRM2	P40534	656 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CLB2	YPR119W	YKE4	P40544	346 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CLB2	YPR119W	GUF1	P46943	645 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CLB2	YPR119W	IML2	P47031	731 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CLB2	YPR119W	IRC18	P47056	224 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CLB2	YPR119W	MPS3	P47069	682 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CLB2	YPR119W	BIO3	P50277	480 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CLB2	YPR119W	YPT32	P51996	222 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
CLB2	YPR119W	CGR1	P53188	120 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CLB2	YPR119W	NSE5	Q03718	556 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CLB2	YPR119W	CSN9	Q03981	162 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CLB2	YPR119W	HPT1	Q04178	221 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
CLB2	YPR119W	EMI2	Q04409	500 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
CLB2	YPR119W	BSC2	Q05611	235 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CLB2	YPR119W	EMG1	Q06287	252 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
CLB2	YPR119W	RSC3	Q06639	885 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CLB2	YPR119W	YDL073W	Q07454	984 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CLB2	YPR119W	TPO1	Q07824	586 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CLB2	YPR119W	HFI1	Q12060	488 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CLB2	YPR119W	RPN6	Q12377	434 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CLB2	YPR119W	FKS1	P38631	1876 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
CLB2	YPR119W	DSF1	P0CX08	502 aa		5.8	□□□□□ -1.48
CLB2	YPR119W	YNR073C	P0CX09	502 aa		5.8	□□□□□ -1.48
CLB2	YPR119W	KIN1	P13185	1064 aa		5.8	□□□□□ -1.48
CLB2	YPR119W	ACO1	P19414	778 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.8	□□□□□ -1.48	not detected
CLB2	YPR119W	DBP3	P20447	523 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
CLB2	YPR119W	ECM31	P38122	312 aa		5.8	□□□□□ -1.48
CLB2	YPR119W	ROT2	P38138	954 aa		5.8	□□□□□ -1.48
CLB2	YPR119W	APD1	P38281	316 aa		5.8	□□□□□ -1.48
CLB2	YPR119W	RIM11	P38615	370 aa		5.8	□□□□□ -1.48
CLB2	YPR119W	LEU5	P38702	357 aa		5.8	□□□□□ -1.48
CLB2	YPR119W	YHR182W	P38870	785 aa		5.8	□□□□□ -1.48
CLB2	YPR119W	MLH1	P38920	769 aa		5.8	□□□□□ -1.48
CLB2	YPR119W	PLB1	P39105	664 aa		5.8	□□□□□ -1.48
CLB2	YPR119W	EXO1	P39875	702 aa		5.8	□□□□□ -1.48
CLB2	YPR119W	GSM1	P42950	618 aa		5.8	□□□□□ -1.48
CLB2	YPR119W	BUD13	P46947	266 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
CLB2	YPR119W	LSM1	P47017	172 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
CLB2	YPR119W	NUP42	P49686	430 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
CLB2	YPR119W	KEL2	P50090	882 aa		5.8	□□□□□ -1.48
CLB2	YPR119W	YNR068C	P53754	272 aa		5.8	□□□□□ -1.48
CLB2	YPR119W	SPR6	Q01684	191 aa		5.8	□□□□□ -1.48
CLB2	YPR119W	SMA1	Q02651	245 aa		5.8	□□□□□ -1.48
CLB2	YPR119W	ARX1	Q03862	593 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
CLB2	YPR119W	RQC1	Q05468	723 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
CLB2	YPR119W	GPI11	Q06636	219 aa		5.8	□□□□□ -1.48
CLB2	YPR119W	ECM30	Q06673	1274 aa		5.8	□□□□□ -1.48
CLB2	YPR119W	GRS2	Q06817	618 aa		5.8	□□□□□ -1.48
CLB2	YPR119W	CRD1	Q07560	283 aa		5.8	□□□□□ -1.48
CLB2	YPR119W	ACF2	Q12168	779 aa		5.8	□□□□□ -1.48
CLB2	YPR119W	RBD2	Q12270	262 aa		5.8	□□□□□ -1.48
CLB2	YPR119W	PCD1	Q12524	340 aa		5.8	□□□□□ -1.48
CLB2	YPR119W	YHR213W-A	Q8TGT4	77 aa		5.8	□□□□□ -1.48
CLB2	YPR119W	RIB3	Q99258	208 aa		5.8	□□□□□ -1.48
CLB2	YPR119W	FRT1	Q99332	602 aa		5.8	□□□□□ -1.48
CLB2	YPR119W	TRP3	P00937	484 aa		5.79	□□□□□ -1.48
CLB2	YPR119W	SPS1	P08458	490 aa		5.79	□□□□□ -1.48
CLB2	YPR119W	FUS1	P11710	512 aa		5.79	□□□□□ -1.48
CLB2	YPR119W	ABF1	P14164	731 aa		5.79	□□□□□ -1.48
CLB2	YPR119W	MRPL33	P20084	86 aa		5.79	□□□□□ -1.48
CLB2	YPR119W	DBR1	P24309	405 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
CLB2	YPR119W	NTG1	P31378	399 aa		5.79	□□□□□ -1.48
CLB2	YPR119W	STE5	P32917	917 aa		5.79	□□□□□ -1.48
CLB2	YPR119W	TOD6	P34219	525 aa		5.79	□□□□□ -1.48
CLB2	YPR119W	DUN1	P39009	513 aa		5.79	□□□□□ -1.48
CLB2	YPR119W	YAR028W	P39548	234 aa		5.79	□□□□□ -1.48
CLB2	YPR119W	GIP4	P39732	760 aa		5.79	□□□□□ -1.48

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