RNA–Protein interactions for RNA: YOR368W

RAD17, Transcript of Checkpoint protein, yeast

Gene RAD17, Length 1,206 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RAD17	YOR368W	ARG3	P05150	338 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAD17	YOR368W	MCM4	P30665	933 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RAD17	YOR368W	PHD1	P36093	366 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAD17	YOR368W	ERG7	P38604	731 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAD17	YOR368W	SPO22	P40511	975 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAD17	YOR368W	IRC6	P43615	237 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAD17	YOR368W	RMD8	P43620	662 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAD17	YOR368W	SMM1	P53720	384 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RAD17	YOR368W	MDM1	Q01846	1127 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAD17	YOR368W	NUP53	Q03790	475 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAD17	YOR368W	SSK1	Q07084	712 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAD17	YOR368W	CDC45	Q08032	650 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAD17	YOR368W	TAH18	Q12181	623 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAD17	YOR368W	RLM1	Q12224	676 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAD17	YOR368W	PDA1	P16387	420 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RAD17	YOR368W	HNM1	P19807	563 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAD17	YOR368W	SPC34	P36131	295 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAD17	YOR368W	YEL057C	P39983	233 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAD17	YOR368W	MET28	P40573	187 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAD17	YOR368W	ARF3	P40994	183 aa	RIP-Chip data	4.88	□□□□□ -1.63	not detected
RAD17	YOR368W	SNG1	P46950	547 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAD17	YOR368W	YGR126W	P53274	230 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAD17	YOR368W	LSC1	P53598	329 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RAD17	YOR368W	DUG3	P53871	357 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAD17	YOR368W	FIN1	Q03898	291 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAD17	YOR368W	YLR352W	Q06479	807 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAD17	YOR368W	NCE102	Q12207	173 aa	RIP-Chip data	4.88	□□□□□ -1.63	not detected
RAD17	YOR368W	GAL80	P04387	435 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAD17	YOR368W	CDC31	P06704	161 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RAD17	YOR368W	SUI2	P20459	304 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RAD17	YOR368W	PRD1	P25375	712 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAD17	YOR368W	RPS2	P25443	254 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RAD17	YOR368W	RAD24	P32641	659 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAD17	YOR368W	WBP1	P33767	430 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RAD17	YOR368W	RKM3	P38222	552 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAD17	YOR368W	YND1	P40009	630 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAD17	YOR368W	FMP42	Q04991	504 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAD17	YOR368W	ARP6	Q12509	438 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAD17	YOR368W	INH1	P01097	85 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAD17	YOR368W	ELO2	P25358	347 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAD17	YOR368W	RPN2	P32565	945 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RAD17	YOR368W	YKL023W	P36103	277 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RAD17	YOR368W	UTP9	P38882	575 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RAD17	YOR368W	DOT5	P40553	215 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAD17	YOR368W	YIR014W	P40570	242 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAD17	YOR368W	YFR016C	P43597	1233 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RAD17	YOR368W	ATG27	P46989	271 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAD17	YOR368W	MRPL19	P53875	158 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAD17	YOR368W	RHO4	Q00246	291 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAD17	YOR368W	YPL014W	Q02606	381 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAD17	YOR368W	COQ9	Q05779	260 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAD17	YOR368W	DIC1	Q06143	298 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAD17	YOR368W	FOB1	O13329	566 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RAD17	YOR368W	PEP4	P07267	405 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RAD17	YOR368W	SGV1	P23293	657 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RAD17	YOR368W	MRE11	P32829	692 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RAD17	YOR368W	MIC60	P36112	540 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RAD17	YOR368W	MSR1	P38714	643 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RAD17	YOR368W	YHR210C	P38893	341 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RAD17	YOR368W	YER130C	P39959	443 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RAD17	YOR368W	AXL1	P40851	1208 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RAD17	YOR368W	GUF1	P46943	645 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RAD17	YOR368W	PET130	P47065	347 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RAD17	YOR368W	BUD32	P53323	261 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RAD17	YOR368W	SHR3	Q02774	210 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RAD17	YOR368W	MSS11	Q03825	758 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RAD17	YOR368W	YDL057W	Q07379	328 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RAD17	YOR368W	YOR365C	Q08844	703 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RAD17	YOR368W	BAR1	P12630	587 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RAD17	YOR368W	PEP5	P12868	1029 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RAD17	YOR368W	TYR1	P20049	452 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RAD17	YOR368W	MET18	P40469	1032 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RAD17	YOR368W	AZF1	P41696	914 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RAD17	YOR368W	ROK1	P45818	564 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RAD17	YOR368W	TCB2	P48231	1178 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RAD17	YOR368W	DRN1	P53255	507 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RAD17	YOR368W	TOF2	Q02208	771 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RAD17	YOR368W	YDR415C	Q04033	374 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RAD17	YOR368W	CKA1	P15790	372 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RAD17	YOR368W	CDC23	P16522	626 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RAD17	YOR368W	GLN3	P18494	730 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RAD17	YOR368W	ACH1	P32316	526 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RAD17	YOR368W	ERG1	P32476	496 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RAD17	YOR368W	MUM2	P38236	366 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RAD17	YOR368W	BZZ1	P38822	633 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RAD17	YOR368W	ALK1	P43633	760 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RAD17	YOR368W	AIM22	P47051	409 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RAD17	YOR368W	HSH49	Q99181	213 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RAD17	YOR368W	MET17	P06106	444 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RAD17	YOR368W	CLC1	P17891	233 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RAD17	YOR368W	YME1	P32795	747 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RAD17	YOR368W	SHP1	P34223	423 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RAD17	YOR368W	CST26	P38226	397 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RAD17	YOR368W	SRB7	P47822	140 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RAD17	YOR368W	ALT2	P52892	507 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RAD17	YOR368W	JJJ1	P53863	590 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RAD17	YOR368W	TDA7	P53882	636 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
RAD17	YOR368W	SAM50	P53969	484 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RAD17	YOR368W	YDR239C	Q03780	787 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RAD17	YOR368W	TAF11	Q04226	346 aa		4.82	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 11.3 ms