RNA–Protein interactions for RNA: YOR349W

CIN1, Transcript of Tubulin folding factor D involved in beta-tubulin (Tub2p) folding, yeast

Gene CIN1, Length 3,045 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CIN1	YOR349W	YMR130W	Q04223	302 aa		3.22	□□□□□ -1.89
CIN1	YOR349W	MRI1	Q06489	411 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
CIN1	YOR349W	ARV1	Q06541	321 aa		3.22	□□□□□ -1.89
CIN1	YOR349W	YFH1	Q07540	174 aa		3.22	□□□□□ -1.89
CIN1	YOR349W	MED2	Q12124	431 aa		3.22	□□□□□ -1.89
CIN1	YOR349W	YDL007C-A	Q2V2Q0	85 aa		3.22	□□□□□ -1.89
CIN1	YOR349W	RAD61	Q99359	647 aa		3.22	□□□□□ -1.89
CIN1	YOR349W	ESC1	Q03661	1658 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.89
CIN1	YOR349W	TY3B-G	Q99315	1547 aa		3.21	□□□□□ -1.89
CIN1	YOR349W	COX1	P00401	534 aa		3.21	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	PDE2	P06776	526 aa		3.21	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	MSS1	P32559	526 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	PIM1	P36775	1133 aa		3.21	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	FAD1	P38913	306 aa		3.21	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	PRY1	P47032	299 aa		3.21	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	COS5	P47187	383 aa		3.21	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	PRM1	P53835	661 aa		3.21	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	YDR109C	Q04585	715 aa		3.21	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	YLR413W	Q06689	675 aa		3.21	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	COS7	Q07788	383 aa		3.21	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	AI5_ALPHA	Q9ZZX1	630 aa		3.21	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	GCD2	P12754	651 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	ART10	P18634	518 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	UBA1	P22515	1024 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	CDC5	P32562	705 aa		3.21	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	SOF1	P33750	489 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	ELF1	P36053	145 aa		3.21	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	RPF2	P36160	344 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	AAP1	P37898	856 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	ETP1	P38748	585 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	ICP55	P40051	511 aa		3.21	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	ELP2	P42935	788 aa		3.21	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	RPA34	P47006	233 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	AMA1	P50082	593 aa		3.21	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	KEL2	P50090	882 aa		3.21	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	CAF130	P53280	1122 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	LSC1	P53598	329 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	IST1	P53843	298 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	MSC3	Q05812	728 aa		3.21	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	KAP95	Q06142	861 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	NOP12	Q08208	459 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	GCD1	P09032	578 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	IMG1	P25626	169 aa		3.2	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	FAA1	P30624	700 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	COY1	P34237	679 aa		3.2	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	LHS1	P36016	881 aa		3.2	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	CTP1	P38152	299 aa		3.2	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	CTM1	P38818	585 aa		3.2	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	MEF2	P39677	819 aa		3.2	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	YFR018C	P43599	363 aa		3.2	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	PTR3	P43606	678 aa		3.2	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	DPB11	P47027	764 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	YPL216W	Q08964	1102 aa		3.2	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	CBP2	P03874	630 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	KGD1	P20967	1014 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	YSP3	P25036	478 aa		3.2	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	NDI1	P32340	513 aa		3.2	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	MRP4	P32902	394 aa		3.2	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	CCL1	P37366	393 aa		3.2	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	ARA1	P38115	344 aa		3.2	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	MMS4	P38257	691 aa		3.2	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	ICS2	P38284	255 aa		3.2	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	MSR1	P38714	643 aa		3.2	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	MLH1	P38920	769 aa		3.2	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	UIP3	P39547	235 aa		3.2	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	LIA1	P47120	325 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	NPA3	P47122	385 aa		3.2	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	MSY1	P48527	492 aa		3.2	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	YDR179W-A	Q03983	463 aa		3.2	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	RRB1	Q04225	511 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	ECM18	Q04623	453 aa		3.2	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	RXT3	Q07458	294 aa		3.2	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	RRT8	Q08219	342 aa		3.2	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	INP53	Q12271	1107 aa		3.2	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	GLT1	Q12680	2145 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	ARG81	P05085	880 aa		3.19	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	CBP1	P07252	654 aa		3.19	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	PRP2	P20095	876 aa	Predicted RBP	3.19	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	KAR4	P25583	335 aa		3.19	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	FUB1	P25659	250 aa		3.19	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	HES1	P35843	434 aa		3.19	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	PAN2	P53010	1115 aa	Predicted RBP	3.19	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	VPS62	P53285	467 aa		3.19	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	VPS20	Q04272	221 aa		3.19	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	DCS1	Q06151	350 aa		3.19	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	YSH1	Q06224	779 aa	Predicted RBP	3.19	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	MRPL23	Q12487	163 aa	Predicted RBP	3.19	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	VTH1	P40438	1549 aa		3.19	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	VTH2	P40890	1549 aa		3.19	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	ILV5	P06168	395 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	STE3	P06783	470 aa		3.19	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	YPK1	P12688	680 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	ABF1	P14164	731 aa		3.19	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	PUP3	P25451	205 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	CNE1	P27825	502 aa		3.19	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	YIM1	P28625	365 aa		3.19	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	CAB3	P36076	571 aa		3.19	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	ZTA1	P38230	334 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	MNN9	P39107	395 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	SSO2	P39926	295 aa		3.19	□□□□□ -1.9

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