RNA–Protein interactions for RNA: YOL077C

BRX1, Transcript of Nucleolar protein, yeastyeast

Gene BRX1, Length 876 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
BRX1YOL077C YER130CP39959 443 aa3.32□□□□□ -1.88
BRX1YOL077C TMA108P40462 946 aa3.32□□□□□ -1.88
BRX1YOL077C IKS1P47042 667 aa3.32□□□□□ -1.88
BRX1YOL077C YGR126WP53274 230 aa3.32□□□□□ -1.88
BRX1YOL077C RBA50Q04418 439 aa3.32□□□□□ -1.88
BRX1YOL077C RTT103Q05543 409 aa3.32□□□□□ -1.88
BRX1YOL077C YDL057WQ07379 328 aa3.32□□□□□ -1.88
BRX1YOL077C SPE4Q12455 300 aa3.32□□□□□ -1.88
BRX1YOL077C YMR230W-AQ3E7B5 62 aa3.32□□□□□ -1.88
BRX1YOL077C SGS1P35187 1447 aa3.31□□□□□ -1.88
BRX1YOL077C CYB2P00175 591 aa3.31□□□□□ -1.88
BRX1YOL077C EST1P17214 699 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
BRX1YOL077C RPS2P25443 254 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
BRX1YOL077C ECM15P35195 104 aa3.31□□□□□ -1.88
BRX1YOL077C CIN4P39110 191 aa3.31□□□□□ -1.88
BRX1YOL077C VID30P53076 958 aa3.31□□□□□ -1.88
BRX1YOL077C RHO4Q00246 291 aa3.31□□□□□ -1.88
BRX1YOL077C YPL272CQ08984 517 aa3.31□□□□□ -1.88
BRX1YOL077C YDR056CQ12025 205 aa3.31□□□□□ -1.88
BRX1YOL077C GFD2P25370 566 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
BRX1YOL077C PTR2P32901 601 aa3.3□□□□□ -1.88
BRX1YOL077C SEF1P34228 1148 aa3.3□□□□□ -1.88
BRX1YOL077C MDM31P38880 579 aa3.3□□□□□ -1.88
BRX1YOL077C FLC2P39719 783 aa3.3□□□□□ -1.88
BRX1YOL077C NOP16P40007 231 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
BRX1YOL077C ALG5P40350 334 aa3.3□□□□□ -1.88
BRX1YOL077C APT1P49435 187 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
BRX1YOL077C ALT2P52892 507 aa3.3□□□□□ -1.88
BRX1YOL077C DSD1P53095 428 aa3.3□□□□□ -1.88
BRX1YOL077C IPI3P53877 555 aa3.3□□□□□ -1.88
BRX1YOL077C NGL3Q03210 505 aa3.3□□□□□ -1.88
BRX1YOL077C YKU80Q04437 629 aa3.3□□□□□ -1.88
BRX1YOL077C THI20Q08224 551 aa3.3□□□□□ -1.88
BRX1YOL077C PPT2Q12036 173 aa3.3□□□□□ -1.88
BRX1YOL077C SEM1O94742 89 aa3.29□□□□□ -1.88
BRX1YOL077C CAR1P00812 333 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
BRX1YOL077C AAC3P18238 307 aa3.29□□□□□ -1.88
BRX1YOL077C ART10P18634 518 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
BRX1YOL077C SAN1P22470 610 aa3.29□□□□□ -1.88
BRX1YOL077C PEP3P27801 918 aa3.29□□□□□ -1.88
BRX1YOL077C NDC1P32500 655 aa3.29□□□□□ -1.88
BRX1YOL077C NOP4P37838 685 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
BRX1YOL077C CSM2P40465 213 aa3.29□□□□□ -1.88
BRX1YOL077C MSC1Q03104 513 aa3.29□□□□□ -1.88
BRX1YOL077C RCN2Q12044 265 aa3.29□□□□□ -1.88
BRX1YOL077C NMD4Q12129 218 aa3.29□□□□□ -1.88
BRX1YOL077C MRS3P10566 314 aa3.28□□□□□ -1.88
BRX1YOL077C APE1P14904 514 aa3.28□□□□□ -1.88
BRX1YOL077C MTF1P14908 341 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
BRX1YOL077C SIP2P34164 415 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
BRX1YOL077C REG2P38232 338 aa3.28□□□□□ -1.88
BRX1YOL077C DHH1P39517 506 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
BRX1YOL077C YJR154WP47181 346 aa3.28□□□□□ -1.88
BRX1YOL077C RBG2P53295 368 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
BRX1YOL077C BUD32P53323 261 aa3.28□□□□□ -1.88
BRX1YOL077C YEH1Q07804 573 aa3.28□□□□□ -1.88
BRX1YOL077C YPT6Q99260 215 aa3.28□□□□□ -1.88
BRX1YOL077C MRP13P12686 339 aa3.27□□□□□ -1.89
BRX1YOL077C OSH3P38713 996 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
BRX1YOL077C YHR210CP38893 341 aa3.27□□□□□ -1.89
BRX1YOL077C RTT101P47050 842 aa3.27□□□□□ -1.89
BRX1YOL077C YMR087WQ04299 284 aa3.27□□□□□ -1.89
BRX1YOL077C SCW10Q04951 389 aa3.27□□□□□ -1.89
BRX1YOL077C SET6Q12529 373 aa3.27□□□□□ -1.89
BRX1YOL077C YBR298C-AQ8TGK4 73 aa3.27□□□□□ -1.89
BRX1YOL077C HSH49Q99181 213 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
BRX1YOL077C BUD14P27637 709 aa3.26□□□□□ -1.89
BRX1YOL077C PAP1P29468 568 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
BRX1YOL077C TIF3P34167 436 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
BRX1YOL077C CCT6P39079 546 aa3.26□□□□□ -1.89
BRX1YOL077C VPS52P39904 641 aa3.26□□□□□ -1.89
BRX1YOL077C RPH1P39956 796 aa3.26□□□□□ -1.89
BRX1YOL077C ALK1P43633 760 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
BRX1YOL077C IMD4P50094 524 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
BRX1YOL077C YGR066CP53242 292 aa3.26□□□□□ -1.89
BRX1YOL077C TOF2Q02208 771 aa3.26□□□□□ -1.89
BRX1YOL077C RPM2Q02773 1202 aa3.26□□□□□ -1.89
BRX1YOL077C IVY1Q04934 453 aa3.26□□□□□ -1.89
BRX1YOL077C THP1Q08231 455 aa3.26□□□□□ -1.89
BRX1YOL077C CTI6Q08923 506 aa3.26□□□□□ -1.89
BRX1YOL077C YJR112W-AQ3E743 109 aa3.26□□□□□ -1.89
BRX1YOL077C RPL15AP05748 204 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
BRX1YOL077C CBS1P14066 229 aa3.25□□□□□ -1.89
BRX1YOL077C YME1P32795 747 aa3.25□□□□□ -1.89
BRX1YOL077C SHP1P34223 423 aa3.25□□□□□ -1.89
BRX1YOL077C YJL213WP40896 331 aa3.25□□□□□ -1.89
BRX1YOL077C ROK1P45818 564 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
BRX1YOL077C SCD6P45978 349 aaKnown RBP RIP-Chip data3.25□□□□□ -1.89not detected
BRX1YOL077C UPF3P48412 387 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
BRX1YOL077C MRX6P48564 524 aa3.25□□□□□ -1.89
BRX1YOL077C HCR1Q05775 265 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
BRX1YOL077C VPS38Q05919 439 aa3.25□□□□□ -1.89
BRX1YOL077C NCE102Q12207 173 aaRIP-Chip data3.25□□□□□ -1.89not detected
BRX1YOL077C RAD52P06778 471 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
BRX1YOL077C SGV1P23293 657 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
BRX1YOL077C FRE1P32791 686 aa3.24□□□□□ -1.89
BRX1YOL077C TCD2P36101 447 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
BRX1YOL077C BNA4P38169 460 aa3.24□□□□□ -1.89
BRX1YOL077C MSR1P38714 643 aa3.24□□□□□ -1.89
BRX1YOL077C NPR2P39923 615 aa3.24□□□□□ -1.89
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