RNA–Protein interactions for RNA: YOL054W

PSH1, Transcript of E3 ubiquitin ligase targeting centromere-binding protein Cse4p, yeast

Gene PSH1, Length 1,221 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PSH1	YOL054W	YLL056C	Q12177	298 aa		5.66	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	HRT3	Q12347	344 aa		5.66	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	MDM20	Q12387	796 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	VPS5	Q92331	675 aa		5.66	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	UBR2	Q07963	1872 aa		5.66	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	ASP3-2	P0CX77	362 aa		5.65	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	ASP3-3	P0CX78	362 aa		5.65	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	ASP3-4	P0CX79	362 aa		5.65	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	ASP3-1	P0CZ17	362 aa		5.65	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	PRP6	P19735	899 aa	Predicted RBP	5.65	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	TKL1	P23254	680 aa	Known RBP	5.65	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	YCR015C	P25616	317 aa		5.65	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	RME1	P32338	300 aa	Known RBP	5.65	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	TFC1	P32367	649 aa		5.65	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	SPR1	P32603	445 aa		5.65	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	UTR4	P32626	227 aa		5.65	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	CTF13	P35203	478 aa		5.65	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	OCT1	P35999	772 aa		5.65	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	NOP4	P37838	685 aa	Known RBP	5.65	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	MMS4	P38257	691 aa		5.65	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	PPE1	P38796	400 aa		5.65	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	YNL195C	P40168	261 aa		5.65	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	YIL054W	P40524	105 aa		5.65	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	IML2	P47031	731 aa		5.65	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	YGL036W	P53185	909 aa	Predicted RBP	5.65	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	YGR016W	P53209	190 aa		5.65	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	YPR003C	P53394	754 aa		5.65	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	ASI1	P54074	624 aa		5.65	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	RCR2	Q03446	210 aa	Known RBP	5.65	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	CTK1	Q03957	528 aa	Known RBP	5.65	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	ARO80	Q04052	950 aa		5.65	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	BLS1	Q06071	122 aa		5.65	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	YSH1	Q06224	779 aa	Predicted RBP	5.65	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	ERP3	Q12403	225 aa		5.65	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	ATG11	Q12527	1178 aa		5.65	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	ATP2	P00830	511 aa	Known RBP	5.64	□□□□□ -1.51
PSH1	YOL054W	PAB1	P04147	577 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.64	□□□□□ -1.51	not detected
PSH1	YOL054W	URA10	P30402	227 aa		5.64	□□□□□ -1.51
PSH1	YOL054W	PUP2	P32379	260 aa		5.64	□□□□□ -1.51
PSH1	YOL054W	DEF1	P35732	738 aa	Known RBP	5.64	□□□□□ -1.51
PSH1	YOL054W	YKR015C	P36111	568 aa		5.64	□□□□□ -1.51
PSH1	YOL054W	APM3	P38153	483 aa		5.64	□□□□□ -1.51
PSH1	YOL054W	REG2	P38232	338 aa		5.64	□□□□□ -1.51
PSH1	YOL054W	YDR089W	P38966	869 aa		5.64	□□□□□ -1.51
PSH1	YOL054W	YJL206C	P39529	758 aa		5.64	□□□□□ -1.51
PSH1	YOL054W	VAB2	P40003	282 aa		5.64	□□□□□ -1.51
PSH1	YOL054W	CHS6	P40955	746 aa		5.64	□□□□□ -1.51
PSH1	YOL054W	IAH1	P41734	238 aa		5.64	□□□□□ -1.51
PSH1	YOL054W	LAM5	P43560	674 aa		5.64	□□□□□ -1.51
PSH1	YOL054W	BIT61	P47041	543 aa		5.64	□□□□□ -1.51
PSH1	YOL054W	YGL108C	P53139	140 aa		5.64	□□□□□ -1.51
PSH1	YOL054W	SLU7	Q02775	382 aa	Known RBP	5.64	□□□□□ -1.51
PSH1	YOL054W	MCH5	Q08777	521 aa		5.64	□□□□□ -1.51
PSH1	YOL054W	TGL5	Q12043	749 aa		5.64	□□□□□ -1.51
PSH1	YOL054W	GCY1	P14065	312 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.63	□□□□□ -1.51	not detected
PSH1	YOL054W	SEC63	P14906	663 aa		5.63	□□□□□ -1.51
PSH1	YOL054W	RIM1	P32445	135 aa	Known RBP	5.63	□□□□□ -1.51
PSH1	YOL054W	BEM3	P32873	1128 aa		5.63	□□□□□ -1.51
PSH1	YOL054W	CYM1	P32898	989 aa		5.63	□□□□□ -1.51
PSH1	YOL054W	SKG6	P32900	734 aa	Predicted RBP	5.63	□□□□□ -1.51
PSH1	YOL054W	VID24	P38263	362 aa		5.63	□□□□□ -1.51
PSH1	YOL054W	OTU2	P38747	307 aa	Known RBP	5.63	□□□□□ -1.51
PSH1	YOL054W	LYS9	P38999	446 aa		5.63	□□□□□ -1.51
PSH1	YOL054W	SWD1	P39706	426 aa		5.63	□□□□□ -1.51
PSH1	YOL054W	CAB2	P40506	365 aa		5.63	□□□□□ -1.51
PSH1	YOL054W	BUD8	P41698	603 aa		5.63	□□□□□ -1.51
PSH1	YOL054W	FKH2	P41813	862 aa		5.63	□□□□□ -1.51
PSH1	YOL054W	CCT7	P42943	550 aa	Known RBP	5.63	□□□□□ -1.51
PSH1	YOL054W	PUS4	P48567	403 aa	Known RBP	5.63	□□□□□ -1.51
PSH1	YOL054W	MNP1	P53163	194 aa	Predicted RBP	5.63	□□□□□ -1.51
PSH1	YOL054W	COG2	P53271	262 aa		5.63	□□□□□ -1.51
PSH1	YOL054W	YTP1	P53584	459 aa		5.63	□□□□□ -1.51
PSH1	YOL054W	TEX1	P53851	422 aa	Known RBP	5.63	□□□□□ -1.51
PSH1	YOL054W	TMA20	P89886	181 aa	Predicted RBP	5.63	□□□□□ -1.51
PSH1	YOL054W	YML131W	Q03102	365 aa		5.63	□□□□□ -1.51
PSH1	YOL054W	TAF11	Q04226	346 aa		5.63	□□□□□ -1.51
PSH1	YOL054W	SHS1	Q07657	551 aa		5.63	□□□□□ -1.51
PSH1	YOL054W	NSE1	Q07913	336 aa		5.63	□□□□□ -1.51
PSH1	YOL054W	VIK1	Q12045	647 aa		5.63	□□□□□ -1.51
PSH1	YOL054W	EMP46	Q12396	444 aa		5.63	□□□□□ -1.51
PSH1	YOL054W	RGS2	Q99188	309 aa		5.63	□□□□□ -1.51
PSH1	YOL054W	IZH4	Q99393	312 aa		5.63	□□□□□ -1.51
PSH1	YOL054W	SOD2	P00447	233 aa		5.62	□□□□□ -1.51
PSH1	YOL054W	ATR1	P13090	542 aa		5.62	□□□□□ -1.51
PSH1	YOL054W	VMA2	P16140	517 aa	Known RBP	5.62	□□□□□ -1.51
PSH1	YOL054W	SAN1	P22470	610 aa		5.62	□□□□□ -1.51
PSH1	YOL054W	HRR25	P29295	494 aa	Known RBP	5.62	□□□□□ -1.51
PSH1	YOL054W	PHA2	P32452	334 aa		5.62	□□□□□ -1.51
PSH1	YOL054W	SRB2	P34162	210 aa		5.62	□□□□□ -1.51
PSH1	YOL054W	AIM3	P38266	947 aa	Known RBP	5.62	□□□□□ -1.51
PSH1	YOL054W	PHO89	P38361	574 aa		5.62	□□□□□ -1.51
PSH1	YOL054W	BZZ1	P38822	633 aa		5.62	□□□□□ -1.51
PSH1	YOL054W	SNL1	P40548	159 aa		5.62	□□□□□ -1.51
PSH1	YOL054W	NOP9	P47077	666 aa	Known RBP	5.62	□□□□□ -1.51
PSH1	YOL054W	RFX1	P48743	811 aa		5.62	□□□□□ -1.51
PSH1	YOL054W	AZR1	P50080	613 aa		5.62	□□□□□ -1.51
PSH1	YOL054W	TEL2	P53038	688 aa		5.62	□□□□□ -1.51
PSH1	YOL054W	MNT2	P53059	558 aa		5.62	□□□□□ -1.51
PSH1	YOL054W	MOT3	P54785	490 aa	Known RBP	5.62	□□□□□ -1.51
PSH1	YOL054W	PRO2	P54885	456 aa	Known RBP	5.62	□□□□□ -1.51

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