RNA–Protein interactions for RNA: YMR054W

STV1, Transcript of Subunit a of the vacuolar-ATPase V0 domain, yeast

Gene STV1, Length 2,673 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
STV1	YMR054W	ERG27	Q12452	347 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	ERG20	P08524	352 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	SCH9	P11792	824 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	GCD2	P12754	651 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	YCR015C	P25616	317 aa		4.23	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	SSE2	P32590	693 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	YKL070W	P36087	169 aa		4.23	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	MNL1	P38888	796 aa		4.23	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	YMR124W	P39523	943 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	YMR265C	Q03508	461 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	ARR1	Q06596	294 aa		4.23	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	NTO1	Q12311	748 aa		4.23	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	PRP2	P20095	876 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	MGM101	P32787	269 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	TUL1	P36096	758 aa		4.22	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	GLG1	P36143	616 aa		4.22	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	ATP3	P38077	311 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	FAD1	P38913	306 aa		4.22	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	YFR018C	P43599	363 aa		4.22	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	PIB2	P53191	635 aa		4.22	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	CLU1	Q03690	1277 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	YLR297W	Q05899	129 aa		4.22	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	CDC42	P19073	191 aa		4.22	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	SEC62	P21825	274 aa		4.22	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	PPH22	P23595	377 aa		4.22	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	EFB1	P32471	206 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	YNG2	P38806	282 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	BZZ1	P38822	633 aa		4.22	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	YJL206C	P39529	758 aa		4.22	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	MMM1	P41800	426 aa		4.22	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	RPT4	P53549	437 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	UBP2	Q01476	1272 aa		4.22	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	URC2	Q04411	772 aa		4.22	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	FRE3	Q08905	711 aa		4.22	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	RAD61	Q99359	647 aa		4.22	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	YRF1-2	P40105	1681 aa		4.22	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	YLR415C	O13578	112 aa		4.21	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	SAG1	P20840	650 aa		4.21	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	EMC1	P25574	760 aa		4.21	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	RPL5	P26321	297 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	YIM1	P28625	365 aa		4.21	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	NTH1	P32356	751 aa		4.21	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	COT1	P32798	439 aa		4.21	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	AIM20	P40451	204 aa		4.21	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	ASG1	P40467	964 aa		4.21	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	URM1	P40554	99 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	NET1	P47035	1189 aa		4.21	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	YGR149W	P48236	432 aa		4.21	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	RFX1	P48743	811 aa		4.21	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	MPS2	P53159	387 aa		4.21	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	TEX1	P53851	422 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	OPT2	Q06593	877 aa		4.21	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	YFH1	Q07540	174 aa		4.21	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	YOR012W	Q12351	137 aa		4.21	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	NBL1	Q3E7Y6	73 aa		4.21	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	YBT1	P32386	1661 aa		4.21	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	YBR085C-A	O43137	85 aa		4.21	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	RAS1	P01119	309 aa		4.21	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	SPE1	P08432	466 aa		4.21	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	CLC1	P17891	233 aa		4.21	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	SPO7	P18410	259 aa		4.21	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	YCL068C	P25593	260 aa		4.21	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	RDS1	P25611	832 aa		4.21	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	RFA2	P26754	273 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	SKI2	P35207	1287 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.21	□□□□□ -1.74	not detected
STV1	YMR054W	RPC37	P36121	282 aa		4.21	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	ARO9	P38840	513 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	ECM1	P39715	212 aa		4.21	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	YIR014W	P40570	242 aa		4.21	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	YGR054W	P53235	642 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	GIS3	Q12418	502 aa		4.21	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	NUP188	P52593	1655 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	PDA1	P16387	420 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	KIN82	P25341	720 aa		4.2	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	UGP1	P32861	499 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	MRPL37	P36532	105 aa		4.2	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	RFC5	P38251	354 aa		4.2	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	PZF1	P39933	429 aa		4.2	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	STB2	P46679	850 aa		4.2	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	RRP46	P53256	223 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	FHN1	P53279	174 aa		4.2	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	YMR102C	Q03177	834 aa		4.2	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	YMR160W	Q03823	816 aa		4.2	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	FIN1	Q03898	291 aa		4.2	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	YLL007C	Q07799	665 aa		4.2	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	SIL1	Q08199	421 aa		4.2	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	GEP3	Q08622	556 aa		4.2	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	TAF3	Q12297	353 aa		4.2	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	SRP54	P20424	541 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	CLN1	P20437	546 aa		4.2	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	VPS3	P23643	1011 aa		4.2	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	HSP104	P31539	908 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	MSS2	P40990	351 aa		4.2	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	LIA1	P47120	325 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	MCM6	P53091	1017 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	RMD9	P53140	646 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	COX18	P53239	316 aa		4.2	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	RTT102	P53330	157 aa		4.2	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	SPO19	Q03029	223 aa		4.2	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	TY1A-MR1	Q04215	440 aa		4.2	□□□□□ -1.74

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