RNA–Protein interactions for RNA: YLR107W

REX3, Transcript of RNA exonuclease, yeast

Gene REX3, Length 1,215 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
REX3	YLR107W	IMH1	Q06704	911 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
REX3	YLR107W	THI20	Q08224	551 aa		4.94	□□□□□ -1.62
REX3	YLR107W	BUD21	Q08492	214 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
REX3	YLR107W	CTI6	Q08923	506 aa		4.94	□□□□□ -1.62
REX3	YLR107W	RCN2	Q12044	265 aa		4.94	□□□□□ -1.62
REX3	YLR107W	NCE102	Q12207	173 aa	RIP-Chip data	4.94	□□□□□ -1.62	not detected
REX3	YLR107W	SGS1	P35187	1447 aa		4.94	□□□□□ -1.62
REX3	YLR107W	MRP13	P12686	339 aa		4.93	□□□□□ -1.62
REX3	YLR107W	UBP11	P36026	717 aa		4.93	□□□□□ -1.62
REX3	YLR107W	YKL023W	P36103	277 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
REX3	YLR107W	RRP3	P38712	501 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
REX3	YLR107W	YTA12	P40341	825 aa		4.93	□□□□□ -1.62
REX3	YLR107W	DIM1	P41819	318 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
REX3	YLR107W	SNG1	P46950	547 aa		4.93	□□□□□ -1.62
REX3	YLR107W	VID30	P53076	958 aa		4.93	□□□□□ -1.62
REX3	YLR107W	SDH5	Q08230	162 aa		4.93	□□□□□ -1.62
REX3	YLR107W	PMS1	P14242	873 aa		4.92	□□□□□ -1.62
REX3	YLR107W	ART10	P18634	518 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
REX3	YLR107W	YGR126W	P53274	230 aa		4.92	□□□□□ -1.62
REX3	YLR107W	SAM50	P53969	484 aa		4.92	□□□□□ -1.62
REX3	YLR107W	RBA50	Q04418	439 aa		4.92	□□□□□ -1.62
REX3	YLR107W	YEH2	Q07950	538 aa		4.92	□□□□□ -1.62
REX3	YLR107W	DAP1	Q12091	152 aa		4.92	□□□□□ -1.62
REX3	YLR107W	RRI2	Q12348	645 aa		4.92	□□□□□ -1.62
REX3	YLR107W	PDH1	Q12428	516 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
REX3	YLR107W	YJR112W-A	Q3E743	109 aa		4.92	□□□□□ -1.62
REX3	YLR107W	PEP5	P12868	1029 aa		4.91	□□□□□ -1.62
REX3	YLR107W	EST1	P17214	699 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
REX3	YLR107W	SUI2	P20459	304 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
REX3	YLR107W	SEF1	P34228	1148 aa		4.91	□□□□□ -1.62
REX3	YLR107W	ECM15	P35195	104 aa		4.91	□□□□□ -1.62
REX3	YLR107W	YJL068C	P40363	299 aa		4.91	□□□□□ -1.62
REX3	YLR107W	DRN1	P53255	507 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
REX3	YLR107W	BUD32	P53323	261 aa		4.91	□□□□□ -1.62
REX3	YLR107W	VPS75	P53853	264 aa		4.91	□□□□□ -1.62
REX3	YLR107W	SHR3	Q02774	210 aa		4.91	□□□□□ -1.62
REX3	YLR107W	CDC45	Q08032	650 aa		4.91	□□□□□ -1.62
REX3	YLR107W	YOR365C	Q08844	703 aa		4.91	□□□□□ -1.62
REX3	YLR107W	MET8	P15807	274 aa		4.9	□□□□□ -1.63
REX3	YLR107W	VPS17	P32913	551 aa		4.9	□□□□□ -1.63
REX3	YLR107W	FMP46	P36141	133 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
REX3	YLR107W	YHR210C	P38893	341 aa		4.9	□□□□□ -1.63
REX3	YLR107W	ALG5	P40350	334 aa		4.9	□□□□□ -1.63
REX3	YLR107W	IMD4	P50094	524 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
REX3	YLR107W	ALT2	P52892	507 aa		4.9	□□□□□ -1.63
REX3	YLR107W	YGL260W	P53056	76 aa		4.9	□□□□□ -1.63
REX3	YLR107W	YMR087W	Q04299	284 aa		4.9	□□□□□ -1.63
REX3	YLR107W	PEP4	P07267	405 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
REX3	YLR107W	MRS3	P10566	314 aa		4.89	□□□□□ -1.63
REX3	YLR107W	CBS1	P14066	229 aa		4.89	□□□□□ -1.63
REX3	YLR107W	TCD2	P36101	447 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
REX3	YLR107W	YJR154W	P47181	346 aa		4.89	□□□□□ -1.63
REX3	YLR107W	YGL082W	P53155	381 aa		4.89	□□□□□ -1.63
REX3	YLR107W	YGR066C	P53242	292 aa		4.89	□□□□□ -1.63
REX3	YLR107W	IPI3	P53877	555 aa		4.89	□□□□□ -1.63
REX3	YLR107W	CRZ1	P53968	678 aa		4.89	□□□□□ -1.63
REX3	YLR107W	RPM2	Q02773	1202 aa		4.89	□□□□□ -1.63
REX3	YLR107W	RPC11	Q04307	110 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
REX3	YLR107W	HCR1	Q05775	265 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
REX3	YLR107W	COQ9	Q05779	260 aa		4.89	□□□□□ -1.63
REX3	YLR107W	YDL057W	Q07379	328 aa		4.89	□□□□□ -1.63
REX3	YLR107W	GCN4	P03069	281 aa		4.88	□□□□□ -1.63
REX3	YLR107W	YML002W	P0CF17	737 aa		4.88	□□□□□ -1.63
REX3	YLR107W	ELO2	P25358	347 aa		4.88	□□□□□ -1.63
REX3	YLR107W	REG2	P38232	338 aa		4.88	□□□□□ -1.63
REX3	YLR107W	YBR225W	P38321	900 aa		4.88	□□□□□ -1.63
REX3	YLR107W	CSM2	P40465	213 aa		4.88	□□□□□ -1.63
REX3	YLR107W	SGN1	P40561	250 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.88	□□□□□ -1.63	not detected
REX3	YLR107W	ARE2	P53629	642 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
REX3	YLR107W	RLM1	Q12224	676 aa		4.88	□□□□□ -1.63
REX3	YLR107W	YMR230W-A	Q3E7B5	62 aa		4.88	□□□□□ -1.63
REX3	YLR107W	SEC62	P21825	274 aa		4.87	□□□□□ -1.63
REX3	YLR107W	SWE1	P32944	819 aa		4.87	□□□□□ -1.63
REX3	YLR107W	IKS1	P47042	667 aa		4.87	□□□□□ -1.63
REX3	YLR107W	FIN1	Q03898	291 aa		4.87	□□□□□ -1.63
REX3	YLR107W	GLO2	Q05584	274 aa		4.87	□□□□□ -1.63
REX3	YLR107W	MED1	Q12321	566 aa		4.87	□□□□□ -1.63
REX3	YLR107W	HSH49	Q99181	213 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
REX3	YLR107W	RAD52	P06778	471 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
REX3	YLR107W	PHO2	P07269	559 aa		4.86	□□□□□ -1.63
REX3	YLR107W	DFR1	P07807	211 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.86	□□□□□ -1.63	not detected
REX3	YLR107W	APE1	P14904	514 aa		4.86	□□□□□ -1.63
REX3	YLR107W	PDA1	P16387	420 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
REX3	YLR107W	PRD1	P25375	712 aa		4.86	□□□□□ -1.63
REX3	YLR107W	PEP3	P27801	918 aa		4.86	□□□□□ -1.63
REX3	YLR107W	YNK1	P36010	153 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
REX3	YLR107W	SRO77	P38163	1010 aa		4.86	□□□□□ -1.63
REX3	YLR107W	NPR2	P39923	615 aa		4.86	□□□□□ -1.63
REX3	YLR107W	ALK1	P43633	760 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
REX3	YLR107W	AIM22	P47051	409 aa		4.86	□□□□□ -1.63
REX3	YLR107W	SUB1	P54000	292 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
REX3	YLR107W	VPS38	Q05919	439 aa		4.86	□□□□□ -1.63
REX3	YLR107W	TIP41	Q12199	356 aa		4.86	□□□□□ -1.63
REX3	YLR107W	AVL9	Q12500	764 aa		4.86	□□□□□ -1.63
REX3	YLR107W	AMD1	P15274	810 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
REX3	YLR107W	WBP1	P33767	430 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
REX3	YLR107W	SIP2	P34164	415 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
REX3	YLR107W	MUM2	P38236	366 aa		4.85	□□□□□ -1.63
REX3	YLR107W	OSH3	P38713	996 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
REX3	YLR107W	MSR1	P38714	643 aa		4.85	□□□□□ -1.63

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