RNA–Protein interactions for RNA: YJL036W

SNX4, Transcript of Sorting nexin, yeastyeast

Gene SNX4, Length 1,272 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SNX4YJL036W CPR2P23285 205 aa3.51□□□□□ -1.85
SNX4YJL036W BOS1P25385 244 aa3.51□□□□□ -1.85
SNX4YJL036W KRR1P25586 316 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
SNX4YJL036W ERV1P27882 189 aa3.51□□□□□ -1.85
SNX4YJL036W YJU2P28320 278 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
SNX4YJL036W MGM1P32266 881 aa3.51□□□□□ -1.85
SNX4YJL036W RPN2P32565 945 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
SNX4YJL036W SEC66P33754 206 aa3.51□□□□□ -1.85
SNX4YJL036W HCS1P34243 683 aa3.51□□□□□ -1.85
SNX4YJL036W NUP133P36161 1157 aa3.51□□□□□ -1.85
SNX4YJL036W DBP8P38719 431 aa3.51□□□□□ -1.85
SNX4YJL036W TDA10P42938 290 aa3.51□□□□□ -1.85
SNX4YJL036W SMC3P47037 1230 aa3.51□□□□□ -1.85
SNX4YJL036W APT1P49435 187 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
SNX4YJL036W CUL3P53202 744 aa3.51□□□□□ -1.85
SNX4YJL036W PFA5Q03289 374 aa3.51□□□□□ -1.85
SNX4YJL036W THI3Q07471 609 aa3.51□□□□□ -1.85
SNX4YJL036W YOL159CQ08300 171 aa3.51□□□□□ -1.85
SNX4YJL036W PGC1Q08959 321 aa3.51□□□□□ -1.85
SNX4YJL036W YLR049CQ12110 428 aa3.51□□□□□ -1.85
SNX4YJL036W CRC1Q12289 327 aa3.51□□□□□ -1.85
SNX4YJL036W CTF3Q12748 733 aa3.51□□□□□ -1.85
SNX4YJL036W YPR089WO13585 888 aa3.5□□□□□ -1.85
SNX4YJL036W BUD14P27637 709 aa3.5□□□□□ -1.85
SNX4YJL036W PUP2P32379 260 aa3.5□□□□□ -1.85
SNX4YJL036W HXT3P32466 567 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
SNX4YJL036W MSR1P38714 643 aa3.5□□□□□ -1.85
SNX4YJL036W POP2P39008 433 aa3.5□□□□□ -1.85
SNX4YJL036W CAF130P53280 1122 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
SNX4YJL036W YPR003CP53394 754 aa3.5□□□□□ -1.85
SNX4YJL036W YNL058CP53947 316 aa3.5□□□□□ -1.85
SNX4YJL036W RSF1Q05043 376 aa3.5□□□□□ -1.85
SNX4YJL036W RBS1Q05672 457 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
SNX4YJL036W RAD34Q06665 692 aa3.5□□□□□ -1.85
SNX4YJL036W CUE5Q08412 411 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
SNX4YJL036W SPE3Q12074 293 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
SNX4YJL036W YDL007C-AQ2V2Q0 85 aa3.5□□□□□ -1.85
SNX4YJL036W YAP1P19880 650 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
SNX4YJL036W PPH22P23595 377 aa3.49□□□□□ -1.85
SNX4YJL036W RRP7P25368 297 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
SNX4YJL036W MSS51P32335 436 aa3.49□□□□□ -1.85
SNX4YJL036W YME2P32843 850 aa3.49□□□□□ -1.85
SNX4YJL036W RPL32P38061 130 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
SNX4YJL036W RRT2P38332 387 aa3.49□□□□□ -1.85
SNX4YJL036W TSC10P38342 320 aa3.49□□□□□ -1.85
SNX4YJL036W YHR054CP38780 354 aa3.49□□□□□ -1.85
SNX4YJL036W EFM4P40516 257 aa3.49□□□□□ -1.85
SNX4YJL036W YMR178WQ03219 274 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
SNX4YJL036W NUP53Q03790 475 aa3.49□□□□□ -1.85
SNX4YJL036W EMI2Q04409 500 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
SNX4YJL036W MRPL1Q04599 285 aa3.49□□□□□ -1.85
SNX4YJL036W SOV1Q04748 898 aa3.49□□□□□ -1.85
SNX4YJL036W DON1Q05610 365 aa3.49□□□□□ -1.85
SNX4YJL036W ECM30Q06673 1274 aa3.49□□□□□ -1.85
SNX4YJL036W ETT1Q08421 412 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
SNX4YJL036W NFI1Q12216 726 aa3.49□□□□□ -1.85
SNX4YJL036W FRE6Q12473 712 aa3.49□□□□□ -1.85
SNX4YJL036W YLR111WQ12528 110 aa3.49□□□□□ -1.85
SNX4YJL036W CYB2P00175 591 aa3.48□□□□□ -1.85
SNX4YJL036W ARG81P05085 880 aa3.48□□□□□ -1.85
SNX4YJL036W SRV2P17555 526 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
SNX4YJL036W YCR006CP25350 157 aa3.48□□□□□ -1.85
SNX4YJL036W RML2P32611 393 aa3.48□□□□□ -1.85
SNX4YJL036W SWH1P35845 1188 aa3.48□□□□□ -1.85
SNX4YJL036W TUL1P36096 758 aa3.48□□□□□ -1.85
SNX4YJL036W NTC20P38302 140 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
SNX4YJL036W FTH1P38310 465 aa3.48□□□□□ -1.85
SNX4YJL036W ANS1P38832 159 aa3.48□□□□□ -1.85
SNX4YJL036W CCT4P39078 528 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
SNX4YJL036W CIN4P39110 191 aa3.48□□□□□ -1.85
SNX4YJL036W ERG26P53199 349 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
SNX4YJL036W YGR111WP53265 400 aa3.48□□□□□ -1.85
SNX4YJL036W EOS1P53938 366 aa3.48□□□□□ -1.85
SNX4YJL036W YPL107WQ02873 248 aa3.48□□□□□ -1.85
SNX4YJL036W HEL2Q05580 639 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
SNX4YJL036W RRP45Q05636 305 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
SNX4YJL036W COQ9Q05779 260 aa3.48□□□□□ -1.85
SNX4YJL036W RTT109Q07794 436 aa3.48□□□□□ -1.85
SNX4YJL036W DCI1Q08558 271 aa3.48□□□□□ -1.85
SNX4YJL036W FRE3Q08905 711 aa3.48□□□□□ -1.85
SNX4YJL036W VPS54Q12071 889 aa3.48□□□□□ -1.85
SNX4YJL036W CFT2Q12102 859 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
SNX4YJL036W RPN5Q12250 445 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
SNX4YJL036W RPL31BP0C2H9 113 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
SNX4YJL036W TRX1P22217 103 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
SNX4YJL036W TKL1P23254 680 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
SNX4YJL036W GAC1P28006 793 aa3.47□□□□□ -1.85
SNX4YJL036W SAC1P32368 623 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
SNX4YJL036W NIP100P33420 868 aa3.47□□□□□ -1.85
SNX4YJL036W LTV1P34078 463 aa3.47□□□□□ -1.85
SNX4YJL036W THI2P38141 450 aa3.47□□□□□ -1.85
SNX4YJL036W SLM4P38247 162 aa3.47□□□□□ -1.85
SNX4YJL036W YGR149WP48236 432 aa3.47□□□□□ -1.85
SNX4YJL036W YGL138CP53122 345 aa3.47□□□□□ -1.85
SNX4YJL036W YNL144CP53907 740 aa3.47□□□□□ -1.85
SNX4YJL036W HOT1Q03213 719 aa3.47□□□□□ -1.85
SNX4YJL036W YLR455WQ06188 304 aa3.47□□□□□ -1.85
SNX4YJL036W CDC45Q08032 650 aa3.47□□□□□ -1.85
SNX4YJL036W SIL1Q08199 421 aa3.47□□□□□ -1.85
SNX4YJL036W YER145C-AA0A023PYF4 145 aa3.46□□□□□ -1.86
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