RNA–Protein interactions for RNA: YHR203C

RPS4B, Transcript of Protein component of the small (40S) ribosomal subunit, yeast

Gene RPS4B, Length 786 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPS4B	YHR203C	CDC34	P14682	295 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	HOP1	P20050	605 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	SEC15	P22224	910 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	NFS1	P25374	497 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	STO1	P34160	861 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	TOM20	P35180	183 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	NNK1	P36003	928 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	POP4	P38336	279 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	LYS1	P38998	373 aa	RIP-Chip data	4.11	□□□□□ -1.75	not detected
RPS4B	YHR203C	EFM4	P40516	257 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	GTS1	P40956	396 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	ERR3	P42222	437 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	TY4A-J	P47023	414 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	ASK10	P48361	1146 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	PEX8	P53248	589 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	ARE2	P53629	642 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	ARP4	P80428	489 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	OSH6	Q02201	448 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	RSF1	Q05043	376 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	YDR278C	Q05612	105 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	YLR030W	Q07967	263 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	AVL9	Q12500	764 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	YLR149C	Q99296	730 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	VPS34	P22543	875 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	CLB1	P24868	471 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	YCL068C	P25593	260 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	MRPL9	P31334	269 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	MKK2	P32491	506 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	SKN1	P33336	771 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	SKT5	P34226	696 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	DEF1	P35732	738 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	YPT52	P36018	234 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	KAE1	P36132	386 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	PCH2	P38126	564 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	YHR182W	P38870	785 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	CWC22	P53333	577 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	PRO2	P54885	456 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	VHS1	Q03785	461 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	RSA3	Q05942	220 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	VAC14	Q06708	880 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	YOL024W	Q08172	172 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	GUP2	Q08929	609 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	DIN7	Q12086	430 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	LEU9	Q12166	604 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	LAG2	Q92325	660 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	HSH49	Q99181	213 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	PRP8	P33334	2413 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	ILS1	P09436	1072 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	IMA3	P0CW40	589 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	IMA4	P0CW41	589 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	NSP1	P14907	823 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	YSR3	P23501	404 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	TSR4	P25040	408 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	RNQ1	P25367	405 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	GID7	P25569	745 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	MGT1	P26188	188 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	MF(ALPHA)2	P32435	120 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	SMI1	P32566	505 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	GDA1	P32621	518 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	SRP101	P32916	621 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	RRP1	P35178	278 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	MSG5	P38590	489 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	GND1	P38720	489 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	HSE1	P38753	452 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	BEM4	P39011	633 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	TIM17	P39515	158 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	SPF1	P39986	1215 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	LRO1	P40345	661 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	SEC9	P40357	651 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	MAD1	P40957	749 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	APT1	P49435	187 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	VPS16	Q03308	798 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	NHX1	Q04121	633 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	RRP45	Q05636	305 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	RSC3	Q06639	885 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	YOL073C	Q08232	322 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	IMA2	Q08295	589 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	TMA46	Q12000	345 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	PFA4	Q12006	378 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	GLE1	Q12315	538 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	FRE7	Q12333	620 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	GPR1	Q12361	961 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	BRR1	Q99177	341 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	TRP3	P00937	484 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RPS4B	YHR203C	BCY1	P07278	416 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
RPS4B	YHR203C	RSR1	P13856	272 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RPS4B	YHR203C	CMP2	P14747	604 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RPS4B	YHR203C	AMD1	P15274	810 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
RPS4B	YHR203C	SPO16	P17122	198 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RPS4B	YHR203C	CLN2	P20438	545 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RPS4B	YHR203C	MSB1	P21339	1137 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
RPS4B	YHR203C	LDB16	P25587	256 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RPS4B	YHR203C	IMG1	P25626	169 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RPS4B	YHR203C	YCR099C	P25657	155 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RPS4B	YHR203C	URA10	P30402	227 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RPS4B	YHR203C	MVD1	P32377	396 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
RPS4B	YHR203C	CYM1	P32898	989 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RPS4B	YHR203C	UBC6	P33296	250 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
RPS4B	YHR203C	SFC1	P33303	322 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RPS4B	YHR203C	STT4	P37297	1900 aa		4.08	□□□□□ -1.76

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