RNA–Protein interactions for RNA: YHL009W-B

YHL009W-B, Transcript of Retrotransposon TYA Gag and TYB Pol genes, yeastyeast

Gene YHL009W-B, Length 5,409 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHL009W-BYHL009W-B VTH1P40438 1549 aa-0.59□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B VTH2P40890 1549 aa-0.59□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B STE2D6VTK4 431 aa-0.59□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B RAP1P11938 827 aa-0.59□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B MRC1P25588 1096 aa-0.59□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B IME2P32581 645 aa-0.59□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B STE13P33894 931 aa-0.59□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B EXO5P38289 585 aa-0.59□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B DBP8P38719 431 aa-0.59□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B PIH1P38768 344 aa-0.59□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B GIC1P38785 314 aa-0.59□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B RVS167P39743 482 aaKnown RBP-0.59□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B SHO1P40073 367 aa-0.59□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B YIL029CP40538 142 aa-0.59□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B LCB3P47013 409 aa-0.59□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B YJR030CP47101 745 aa-0.59□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B YMR155WQ03795 547 aa-0.59□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B GEP3Q08622 556 aa-0.59□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B RKI1Q12189 258 aa-0.59□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B IMP1P28627 190 aa-0.59□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B DSS4P32601 143 aa-0.59□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B SOF1P33750 489 aaKnown RBP-0.59□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B MMS21P38632 267 aa-0.59□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B FPR3P38911 411 aaKnown RBP-0.59□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B END3P39013 349 aa-0.59□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B EMP65P40085 556 aa-0.59□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B APL6P46682 809 aa-0.59□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B PIP2P52960 996 aa-0.59□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B MEC3Q02574 474 aa-0.59□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B UME1Q03010 460 aa-0.59□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B CCE1Q03702 353 aa-0.59□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B AIM33Q04516 312 aa-0.59□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B IVY1Q04934 453 aa-0.59□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B FMP42Q04991 504 aa-0.59□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B PHO92Q06390 306 aa-0.59□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B ATG33Q06485 197 aa-0.59□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B RIX7Q07844 837 aaKnown RBP-0.59□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B YOR378WQ08902 515 aa-0.59□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B SRO7Q12038 1033 aa-0.59□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B THP3Q12049 470 aaKnown RBP-0.59□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B HFI1Q12060 488 aa-0.59□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B TRP1P00912 224 aa-0.6□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B SES1P07284 462 aaKnown RBP-0.6□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B TY2A-FP0CX61 438 aa-0.6□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B TY2A-GR2P0CX62 438 aa-0.6□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B THR1P17423 357 aaKnown RBP-0.6□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B MCK1P21965 375 aaKnown RBP-0.6□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B TY2A-CP25383 438 aa-0.6□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B CIN8P27895 1000 aa-0.6□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B ARP2P32381 391 aaKnown RBP-0.6□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B SKN1P33336 771 aa-0.6□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B HOT13P36078 116 aa-0.6□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B TFA1P36100 482 aa-0.6□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B ESL2P36168 1195 aa-0.6□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B YBL029WP38201 376 aa-0.6□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B SPL2P38839 148 aa-0.6□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B NDE1P40215 560 aa-0.6□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B ARG2P40360 574 aa-0.6□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B SSU1P41930 458 aa-0.6□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B ECO1P43605 281 aa-0.6□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B MTC3P53077 123 aa-0.6□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B SNF12P53628 566 aa-0.6□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B TRM112P53738 135 aaPredicted RBP-0.6□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B BRE5P53741 515 aaKnown RBP-0.6□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B CEG1Q01159 459 aaPredicted RBP-0.6□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B MSC1Q03104 513 aa-0.6□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B ADI1Q03677 179 aa-0.6□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B PBP4Q07362 185 aaKnown RBP-0.6□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B REX4Q08237 289 aa-0.6□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B MUM3Q08750 479 aa-0.6□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B TY3A-GQ12173 290 aa-0.6□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B YPR011CQ12251 326 aa-0.6□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B ZPS1Q12512 249 aa-0.6□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B URA3P03962 267 aa-0.6□□□□□ -2.51
YHL009W-BYHL009W-B ECM25P32525 599 aa-0.6□□□□□ -2.51
YHL009W-BYHL009W-B CSE2P33308 149 aa-0.6□□□□□ -2.51
YHL009W-BYHL009W-B PFF1P38244 976 aa-0.6□□□□□ -2.51
YHL009W-BYHL009W-B YMR262WP38430 313 aa-0.6□□□□□ -2.51
YHL009W-BYHL009W-B MND2P40577 368 aa-0.6□□□□□ -2.51
YHL009W-BYHL009W-B PRM10P42946 383 aa-0.6□□□□□ -2.51
YHL009W-BYHL009W-B TAF4P50105 388 aa-0.6□□□□□ -2.51
YHL009W-BYHL009W-B ASE1P50275 885 aa-0.6□□□□□ -2.51
YHL009W-BYHL009W-B DIA3P52290 468 aa-0.6□□□□□ -2.51
YHL009W-BYHL009W-B YGL118CP53132 145 aa-0.6□□□□□ -2.51
YHL009W-BYHL009W-B SPO1P53541 631 aa-0.6□□□□□ -2.51
YHL009W-BYHL009W-B MRPS16Q02608 121 aa-0.6□□□□□ -2.51
YHL009W-BYHL009W-B SHR3Q02774 210 aa-0.6□□□□□ -2.51
YHL009W-BYHL009W-B SNO4Q04902 237 aa-0.6□□□□□ -2.51
YHL009W-BYHL009W-B PHM6Q05637 104 aa-0.6□□□□□ -2.51
YHL009W-BYHL009W-B YLR455WQ06188 304 aa-0.6□□□□□ -2.51
YHL009W-BYHL009W-B YFT2Q06676 274 aa-0.6□□□□□ -2.51
YHL009W-BYHL009W-B ASA1Q06822 443 aa-0.6□□□□□ -2.51
YHL009W-BYHL009W-B MLH2Q07980 695 aa-0.6□□□□□ -2.51
YHL009W-BYHL009W-B HSP33Q08914 237 aaKnown RBP-0.6□□□□□ -2.51
YHL009W-BYHL009W-B HSP32Q08992 237 aa-0.6□□□□□ -2.51
YHL009W-BYHL009W-B SMF3Q12078 473 aaPredicted RBP-0.6□□□□□ -2.51
YHL009W-BYHL009W-B BEM1P29366 551 aa-0.6□□□□□ -2.51
YHL009W-BYHL009W-B YJR061WP40355 935 aa-0.6□□□□□ -2.51
YHL009W-BYHL009W-B FIP1P45976 327 aa-0.6□□□□□ -2.51
YHL009W-BYHL009W-B BAT2P47176 376 aaKnown RBP-0.6□□□□□ -2.51
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 17.5 ms