RNA–Protein interactions for RNA: YGL196W

DSD1, Transcript of D-serine dehydratase (aka D-serine ammonia-lyase), yeast

Gene DSD1, Length 1,287 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DSD1	YGL196W	YME2	P32843	850 aa		4.8	□□□□□ -1.64
DSD1	YGL196W	ARP1	P38696	384 aa		4.8	□□□□□ -1.64
DSD1	YGL196W	SEC28	P40509	296 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
DSD1	YGL196W	YJL055W	P47044	245 aa		4.8	□□□□□ -1.64
DSD1	YGL196W	URB2	P47108	1174 aa		4.8	□□□□□ -1.64
DSD1	YGL196W	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
DSD1	YGL196W	FMS1	P50264	508 aa		4.8	□□□□□ -1.64
DSD1	YGL196W	YTP1	P53584	459 aa		4.8	□□□□□ -1.64
DSD1	YGL196W	SNU56	Q03782	492 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
DSD1	YGL196W	FMP45	Q07651	309 aa		4.8	□□□□□ -1.64
DSD1	YGL196W	RPS10A	Q08745	105 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
DSD1	YGL196W	YML133C	Q03099	1374 aa		4.79	□□□□□ -1.64
DSD1	YGL196W	YLL067C	Q07888	1374 aa		4.79	□□□□□ -1.64
DSD1	YGL196W	YLL066C	Q99208	1374 aa		4.79	□□□□□ -1.64
DSD1	YGL196W	YER145C-A	A0A023PYF4	145 aa		4.79	□□□□□ -1.64
DSD1	YGL196W	CBP1	P07252	654 aa		4.79	□□□□□ -1.64
DSD1	YGL196W	RPL3	P14126	387 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
DSD1	YGL196W	TPM1	P17536	199 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
DSD1	YGL196W	ELO2	P25358	347 aa		4.79	□□□□□ -1.64
DSD1	YGL196W	ERV1	P27882	189 aa		4.79	□□□□□ -1.64
DSD1	YGL196W	ANP1	P32629	500 aa		4.79	□□□□□ -1.64
DSD1	YGL196W	HOT13	P36078	116 aa		4.79	□□□□□ -1.64
DSD1	YGL196W	UBA4	P38820	440 aa		4.79	□□□□□ -1.64
DSD1	YGL196W	ANS1	P38832	159 aa		4.79	□□□□□ -1.64
DSD1	YGL196W	ULP2	P40537	1034 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
DSD1	YGL196W	RPS10B	P46784	105 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
DSD1	YGL196W	PYK2	P52489	506 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
DSD1	YGL196W	YGR126W	P53274	230 aa		4.79	□□□□□ -1.64
DSD1	YGL196W	RSM23	Q01163	450 aa		4.79	□□□□□ -1.64
DSD1	YGL196W	PEX25	Q02969	394 aa		4.79	□□□□□ -1.64
DSD1	YGL196W	COQ9	Q05779	260 aa		4.79	□□□□□ -1.64
DSD1	YGL196W	ADE13	Q05911	482 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
DSD1	YGL196W	TPO3	Q06451	622 aa		4.79	□□□□□ -1.64
DSD1	YGL196W	IRC3	Q06683	689 aa		4.79	□□□□□ -1.64
DSD1	YGL196W	FRE3	Q08905	711 aa		4.79	□□□□□ -1.64
DSD1	YGL196W	BRR1	Q99177	341 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
DSD1	YGL196W	SPS4	P09937	338 aa		4.78	□□□□□ -1.64
DSD1	YGL196W	NAT1	P12945	854 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
DSD1	YGL196W	NUP1	P20676	1076 aa		4.78	□□□□□ -1.64
DSD1	YGL196W	KRR1	P25586	316 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
DSD1	YGL196W	RAD14	P28519	371 aa		4.78	□□□□□ -1.64
DSD1	YGL196W	RPS0A	P32905	252 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
DSD1	YGL196W	LTV1	P34078	463 aa		4.78	□□□□□ -1.64
DSD1	YGL196W	SHP1	P34223	423 aa		4.78	□□□□□ -1.64
DSD1	YGL196W	TUL1	P36096	758 aa		4.78	□□□□□ -1.64
DSD1	YGL196W	NTC20	P38302	140 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
DSD1	YGL196W	VPS41	P38959	992 aa		4.78	□□□□□ -1.64
DSD1	YGL196W	ATF1	P40353	525 aa		4.78	□□□□□ -1.64
DSD1	YGL196W	LCB2	P40970	561 aa		4.78	□□□□□ -1.64
DSD1	YGL196W	IRC7	P43623	340 aa		4.78	□□□□□ -1.64
DSD1	YGL196W	ATG27	P46989	271 aa		4.78	□□□□□ -1.64
DSD1	YGL196W	NET1	P47035	1189 aa		4.78	□□□□□ -1.64
DSD1	YGL196W	SKO1	Q02100	647 aa		4.78	□□□□□ -1.64
DSD1	YGL196W	HOT1	Q03213	719 aa		4.78	□□□□□ -1.64
DSD1	YGL196W	YMR160W	Q03823	816 aa		4.78	□□□□□ -1.64
DSD1	YGL196W	RRP45	Q05636	305 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
DSD1	YGL196W	SKS1	Q12505	502 aa		4.78	□□□□□ -1.64
DSD1	YGL196W	PEP4	P07267	405 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
DSD1	YGL196W	MGM1	P32266	881 aa		4.77	□□□□□ -1.65
DSD1	YGL196W	RIX1	P38883	763 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
DSD1	YGL196W	TAX4	P47030	604 aa		4.77	□□□□□ -1.65
DSD1	YGL196W	AIM22	P47051	409 aa		4.77	□□□□□ -1.65
DSD1	YGL196W	COS5	P47187	383 aa		4.77	□□□□□ -1.65
DSD1	YGL196W	YGR111W	P53265	400 aa		4.77	□□□□□ -1.65
DSD1	YGL196W	CAF130	P53280	1122 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
DSD1	YGL196W	YNL144C	P53907	740 aa		4.77	□□□□□ -1.65
DSD1	YGL196W	SLG1	P54867	378 aa		4.77	□□□□□ -1.65
DSD1	YGL196W	GYL1	Q04322	720 aa		4.77	□□□□□ -1.65
DSD1	YGL196W	ARP10	Q04549	284 aa		4.77	□□□□□ -1.65
DSD1	YGL196W	COS7	Q07788	383 aa		4.77	□□□□□ -1.65
DSD1	YGL196W	SPE3	Q12074	293 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
DSD1	YGL196W	NCE102	Q12207	173 aa	RIP-Chip data	4.77	□□□□□ -1.65	not detected
DSD1	YGL196W	GPM3	Q12326	303 aa		4.77	□□□□□ -1.65
DSD1	YGL196W	RHO2	P06781	192 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DSD1	YGL196W	SPB1	P25582	841 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
DSD1	YGL196W	YKL023W	P36103	277 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
DSD1	YGL196W	RRT2	P38332	387 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DSD1	YGL196W	YHR210C	P38893	341 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DSD1	YGL196W	PHO90	P39535	881 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DSD1	YGL196W	YGL138C	P53122	345 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DSD1	YGL196W	PUF2	Q12221	1075 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.76	□□□□□ -1.65	not detected
DSD1	YGL196W	CTF3	Q12748	733 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DSD1	YGL196W	GPH1	P06738	902 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
DSD1	YGL196W	PPH22	P23595	377 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DSD1	YGL196W	RRP7	P25368	297 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
DSD1	YGL196W	RPN2	P32565	945 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
DSD1	YGL196W	SWH1	P35845	1188 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DSD1	YGL196W	MBB1	P39534	108 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DSD1	YGL196W	RPT4	P53549	437 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
DSD1	YGL196W	HEF3	P53978	1044 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
DSD1	YGL196W	VTC3	Q02725	835 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DSD1	YGL196W	LGE1	Q02796	332 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
DSD1	YGL196W	CAC2	Q04199	468 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DSD1	YGL196W	YOR365C	Q08844	703 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DSD1	YGL196W	MED2	Q12124	431 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DSD1	YGL196W	HIP1	P06775	603 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DSD1	YGL196W	COR1	P07256	457 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DSD1	YGL196W	TUB1	P09733	447 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
DSD1	YGL196W	SNF3	P10870	884 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DSD1	YGL196W	RPB8	P20436	146 aa		4.74	□□□□□ -1.65

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