RNA–Protein interactions for RNA: YFL039C

ACT1, Transcript of Actin, yeast

Gene ACT1, Length 1,128 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ACT1	YFL039C	SMF1	P38925	575 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ACT1	YFL039C	STT3	P39007	718 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
ACT1	YFL039C	ULP2	P40537	1034 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
ACT1	YFL039C	SIP4	P46954	829 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ACT1	YFL039C	DSD1	P53095	428 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ACT1	YFL039C	DCP2	P53550	970 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
ACT1	YFL039C	SMA1	Q02651	245 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ACT1	YFL039C	MMR1	Q06324	491 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ACT1	YFL039C	ARR2	Q06597	130 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ACT1	YFL039C	BRX1	Q08235	291 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
ACT1	YFL039C	NMD4	Q12129	218 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ACT1	YFL039C	RPN5	Q12250	445 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
ACT1	YFL039C	CHO2	P05374	869 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
ACT1	YFL039C	RPL6B	P05739	176 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
ACT1	YFL039C	CAR2	P07991	424 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
ACT1	YFL039C	AQY1	P0CD91	305 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ACT1	YFL039C	KGD2	P19262	463 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
ACT1	YFL039C	SIR1	P21691	654 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ACT1	YFL039C	BOS1	P25385	244 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ACT1	YFL039C	YCR051W	P25631	222 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ACT1	YFL039C	RPS7A	P26786	190 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
ACT1	YFL039C	MRPL9	P31334	269 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ACT1	YFL039C	LTV1	P34078	463 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ACT1	YFL039C	LIN1	P38852	340 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
ACT1	YFL039C	MNL1	P38888	796 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ACT1	YFL039C	EXO1	P39875	702 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ACT1	YFL039C	PSP1	P50896	841 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
ACT1	YFL039C	RET3	P53600	189 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ACT1	YFL039C	MNT4	P53745	580 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ACT1	YFL039C	PGA2	P53903	129 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ACT1	YFL039C	RPL6A	Q02326	176 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
ACT1	YFL039C	VPS64	Q03944	604 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ACT1	YFL039C	MRPL1	Q04599	285 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ACT1	YFL039C	THI7	Q05998	598 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ACT1	YFL039C	ECM7	Q06200	448 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ACT1	YFL039C	YLR413W	Q06689	675 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ACT1	YFL039C	IWR1	Q07532	353 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
ACT1	YFL039C	AIM6	Q07716	390 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ACT1	YFL039C	TCO89	Q08921	799 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ACT1	YFL039C	YOL159C-A	Q3E769	90 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ACT1	YFL039C	CMC2	Q3E7A4	109 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ACT1	YFL039C	YOR111W	Q99210	232 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ACT1	YFL039C	PGK1	P00560	416 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
ACT1	YFL039C	GCD2	P12754	651 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
ACT1	YFL039C	FUS3	P16892	353 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
ACT1	YFL039C	AMD2	P22580	549 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ACT1	YFL039C	BUD5	P25300	642 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
ACT1	YFL039C	RDS1	P25611	832 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ACT1	YFL039C	PEP3	P27801	918 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ACT1	YFL039C	GDA1	P32621	518 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ACT1	YFL039C	COT1	P32798	439 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ACT1	YFL039C	YKR015C	P36111	568 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ACT1	YFL039C	MSR1	P38714	643 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ACT1	YFL039C	TOM71	P38825	639 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
ACT1	YFL039C	WSS1	P38838	269 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ACT1	YFL039C	LAS21	P40367	830 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ACT1	YFL039C	CHS6	P40955	746 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ACT1	YFL039C	ROK1	P45818	564 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
ACT1	YFL039C	ALT2	P52892	507 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ACT1	YFL039C	CUE3	P53137	624 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
ACT1	YFL039C	KTR6	P54070	446 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ACT1	YFL039C	YSA1	Q01976	231 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ACT1	YFL039C	ATC1	Q04005	294 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ACT1	YFL039C	NNT1	Q05874	261 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ACT1	YFL039C	FMP45	Q07651	309 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ACT1	YFL039C	LCB4	Q12246	624 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ACT1	YFL039C	Q0010	Q9ZZX9	128 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ACT1	YFL039C	SEC3	P33332	1336 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
ACT1	YFL039C	GPA1	P08539	472 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ACT1	YFL039C	SUI3	P09064	285 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
ACT1	YFL039C	ERG11	P10614	530 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ACT1	YFL039C	EST1	P17214	699 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
ACT1	YFL039C	RPI1	P23250	407 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
ACT1	YFL039C	CDC15	P27636	974 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ACT1	YFL039C	BUD14	P27637	709 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ACT1	YFL039C	PAP1	P29468	568 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
ACT1	YFL039C	MIA40	P36046	403 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ACT1	YFL039C	YBL029W	P38201	376 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ACT1	YFL039C	APD1	P38281	316 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ACT1	YFL039C	PSD1	P39006	500 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ACT1	YFL039C	YRB1	P41920	201 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
ACT1	YFL039C	MPP6	P53725	186 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
ACT1	YFL039C	RIM13	Q03792	727 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ACT1	YFL039C	SKG3	Q06315	1026 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ACT1	YFL039C	ATG26	Q06321	1198 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ACT1	YFL039C	VAC14	Q06708	880 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ACT1	YFL039C	RIM20	Q12033	661 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ACT1	YFL039C	SWT1	Q12104	458 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ACT1	YFL039C	LDB17	Q12342	491 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ACT1	YFL039C	MED4	Q12343	284 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ACT1	YFL039C	AHA1	Q12449	350 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
ACT1	YFL039C	CTF3	Q12748	733 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ACT1	YFL039C	NBL1	Q3E7Y6	73 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ACT1	YFL039C	LAG2	Q92325	660 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ACT1	YFL039C	CBP2	P03874	630 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
ACT1	YFL039C	UNG1	P12887	359 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ACT1	YFL039C	CBS1	P14066	229 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ACT1	YFL039C	TAL1	P15019	335 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
ACT1	YFL039C	CDC42	P19073	191 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ACT1	YFL039C	YCR016W	P25617	290 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65

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