RNA–Protein interactions for RNA: YFL037W

TUB2, Transcript of Beta-tubulin, yeast

Gene TUB2, Length 1,374 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TUB2	YFL037W	SIN4	P32259	974 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TUB2	YFL037W	SFA1	P32771	386 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TUB2	YFL037W	YKL100C	P34248	587 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TUB2	YFL037W	MRPL15	P36523	253 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TUB2	YFL037W	YRO2	P38079	344 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TUB2	YFL037W	PLB1	P39105	664 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TUB2	YFL037W	NDE1	P40215	560 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TUB2	YFL037W	YJR149W	P47177	404 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TUB2	YFL037W	MDM34	P53083	459 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TUB2	YFL037W	YGR015C	P53208	328 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TUB2	YFL037W	CLD1	P53264	445 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TUB2	YFL037W	ADE12	P80210	433 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
TUB2	YFL037W	NHP10	Q03435	203 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TUB2	YFL037W	HSP42	Q12329	375 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TUB2	YFL037W	YLR111W	Q12528	110 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TUB2	YFL037W	PNO1	Q99216	274 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
TUB2	YFL037W	SEC53	P07283	254 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
TUB2	YFL037W	PRP16	P15938	1071 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
TUB2	YFL037W	YCK2	P23292	546 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
TUB2	YFL037W	VAC17	P25591	423 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TUB2	YFL037W	FTH1	P38310	465 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TUB2	YFL037W	MUP3	P38734	546 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TUB2	YFL037W	YER034W	P40022	185 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
TUB2	YFL037W	YFR020W	P43600	232 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TUB2	YFL037W	GCD14	P46959	383 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
TUB2	YFL037W	MAL13	P53338	473 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TUB2	YFL037W	HST2	P53686	357 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TUB2	YFL037W	SLT2	Q00772	484 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TUB2	YFL037W	SPO20	Q04359	397 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TUB2	YFL037W	BCH1	Q05029	724 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TUB2	YFL037W	UTP13	Q05946	817 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
TUB2	YFL037W	YLR177W	Q06251	628 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TUB2	YFL037W	YDR056C	Q12025	205 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TUB2	YFL037W	ATG29	Q12092	213 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TUB2	YFL037W	UPC2	Q12151	913 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TUB2	YFL037W	YOR114W	Q12219	294 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TUB2	YFL037W	PST1	Q12355	444 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TUB2	YFL037W	RMP1	Q12530	201 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TUB2	YFL037W	CDC8	P00572	216 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TUB2	YFL037W	CDC21	P06785	304 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TUB2	YFL037W	HOM3	P10869	527 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TUB2	YFL037W	TYR1	P20049	452 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TUB2	YFL037W	URA4	P20051	364 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TUB2	YFL037W	RPB4	P20433	221 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
TUB2	YFL037W	MRPL25	P23369	157 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TUB2	YFL037W	PRO1	P32264	428 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TUB2	YFL037W	SRB5	P32585	307 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TUB2	YFL037W	CYM1	P32898	989 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TUB2	YFL037W	SOL2	P37262	315 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TUB2	YFL037W	EHT1	P38295	451 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TUB2	YFL037W	INM1	P38710	295 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TUB2	YFL037W	AXL2	P38928	823 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TUB2	YFL037W	CCT2	P39076	527 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
TUB2	YFL037W	DHH1	P39517	506 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
TUB2	YFL037W	NPT1	P39683	429 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
TUB2	YFL037W	YIL086C	P40503	102 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TUB2	YFL037W	MNT3	P40549	630 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TUB2	YFL037W	YNL320W	P42840	284 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TUB2	YFL037W	ELP2	P42935	788 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TUB2	YFL037W	YJR030C	P47101	745 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TUB2	YFL037W	TRM9	P49957	279 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TUB2	YFL037W	ERG26	P53199	349 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
TUB2	YFL037W	BUD32	P53323	261 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TUB2	YFL037W	KTR5	P53966	522 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
TUB2	YFL037W	SED5	Q01590	340 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TUB2	YFL037W	AAT1	Q01802	451 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TUB2	YFL037W	PEX25	Q02969	394 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TUB2	YFL037W	HAL9	Q12180	1030 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TUB2	YFL037W	IPP1	P00817	287 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
TUB2	YFL037W	STE3	P06783	470 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TUB2	YFL037W	RPS4A	P0CX35	261 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
TUB2	YFL037W	RPS4B	P0CX36	261 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
TUB2	YFL037W	KIN2	P13186	1147 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
TUB2	YFL037W	AMD2	P22580	549 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TUB2	YFL037W	MCM5	P29496	775 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
TUB2	YFL037W	LAS1	P36146	502 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
TUB2	YFL037W	ETR1	P38071	380 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TUB2	YFL037W	GGC1	P38988	300 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TUB2	YFL037W	HOS4	P40480	1083 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TUB2	YFL037W	IBA57	P47158	497 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TUB2	YFL037W	PAN2	P53010	1115 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
TUB2	YFL037W	FHN1	P53279	174 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TUB2	YFL037W	YNR021W	P53723	404 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
TUB2	YFL037W	SHR3	Q02774	210 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TUB2	YFL037W	HPT1	Q04178	221 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
TUB2	YFL037W	CRN1	Q06440	651 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TUB2	YFL037W	GIC2	Q06648	383 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TUB2	YFL037W	YET3	Q07451	203 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TUB2	YFL037W	NUR1	Q12066	484 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TUB2	YFL037W	YPL066W	Q12194	479 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TUB2	YFL037W	UBX3	Q12229	455 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TUB2	YFL037W	RRP42	Q12277	265 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
TUB2	YFL037W	RGT2	Q12300	763 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TUB2	YFL037W	PNS1	Q12412	539 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TUB2	YFL037W	KCS1	Q12494	1050 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TUB2	YFL037W	SLH1	P53327	1967 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
TUB2	YFL037W	YBR056W-A	I2HB52	66 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TUB2	YFL037W	PET111	P08468	800 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TUB2	YFL037W	RPB2	P08518	1224 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
TUB2	YFL037W	ADH4	P10127	382 aa		4.78	□□□□□ -1.64

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