RNA–Protein interactions for RNA: YDR416W

SYF1, Transcript of Member of the NineTeen Complex (NTC), yeast

Gene SYF1, Length 2,580 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYF1	YDR416W	APL1	P27351	700 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	MCM4	P30665	933 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	SSE2	P32590	693 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	YME1	P32795	747 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	MRPL37	P36532	105 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	AFG3	P39925	761 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	YGL242C	P53066	181 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	CGR1	P53188	120 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	SIZ1	Q04195	904 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	ARR3	Q06598	404 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	AEP3	Q12089	606 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	LDB17	Q12342	491 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	GPM1	P00950	247 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	STE3	P06783	470 aa		4.15	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	CDC15	P27636	974 aa		4.15	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	SIC1	P38634	284 aa		4.15	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	TOM71	P38825	639 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	YJL193W	P39542	402 aa		4.15	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	IMD4	P50094	524 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	MCM6	P53091	1017 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	YGL138C	P53122	345 aa		4.15	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	MNT4	P53745	580 aa		4.15	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	PRM1	P53835	661 aa		4.15	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	SKO1	Q02100	647 aa		4.15	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	FRE3	Q08905	711 aa		4.15	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	YVC1	Q12324	675 aa		4.15	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	ECM3	Q99252	613 aa		4.15	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	STE2	D6VTK4	431 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	PDC5	P16467	563 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	EMC1	P25574	760 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	RDS1	P25611	832 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	YCR061W	P25639	631 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	RPL5	P26321	297 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	TUL1	P36096	758 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	TOS1	P38288	455 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	COP1	P53622	1201 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	UTP6	Q02354	440 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	SNZ1	Q03148	297 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	ATC1	Q04005	294 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	YLR455W	Q06188	304 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	BCP1	Q06338	283 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	PRS5	Q12265	496 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	SFG1	Q12507	346 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	YLR415C	O13578	112 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	KIN2	P13186	1147 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	VPS34	P22543	875 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	PET18	P25362	215 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	TIF3	P34167	436 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	RRP1	P35178	278 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	PHO11	P35842	467 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	PHO12	P38693	467 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	YJL107C	P42947	387 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	IRC8	P47046	822 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	PNC1	P53184	216 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	YML133C	Q03099	1374 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	YLL067C	Q07888	1374 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	YLL066C	Q99208	1374 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	AI1	P03875	834 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	CDC37	P06101	506 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	ILV5	P06168	395 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	PRP4	P20053	465 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	VMA16	P23968	213 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	RME1	P32338	300 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	DSS4	P32601	143 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	ALG14	P38242	237 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	MSG5	P38590	489 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	PIH1	P38768	344 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	COS5	P47187	383 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	YDR179W-A	Q03983	463 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	CSI1	Q04368	295 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	HOF1	Q05080	669 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	COS7	Q07788	383 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	AIR2	Q12476	344 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	JIP3	O13555	125 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	SPE1	P08432	466 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	CDC42	P19073	191 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	SEC15	P22224	910 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	BOS1	P25385	244 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	YKL070W	P36087	169 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	MCX1	P38323	520 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	STB2	P46679	850 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	URB2	P47108	1174 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	TRF5	P48561	642 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	IMO32	P53219	342 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	RSM28	Q03430	361 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	RRP45	Q05636	305 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	NDJ1	Q12366	352 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	MF(ALPHA)1	P01149	165 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	PRB1	P09232	635 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	MSS116	P15424	664 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	PPH22	P23595	377 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	STE14	P32584	239 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	PXL1	P36166	706 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	MNN2	P38069	597 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	FAD1	P38913	306 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	GCD14	P46959	383 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	TOM22	P49334	152 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	YLR173W	Q06247	608 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	OPT2	Q06593	877 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	DIA2	Q08496	732 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75

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