RNA–Protein interactions for RNA: YCL036W

GFD2, Transcript of Protein of unknown function, yeast

Gene GFD2, Length 1,701 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
GFD2	YCL036W	YHR020W	P38708	688 aa	Known RBP	11.89	□□□□□ -0.51
GFD2	YCL036W	DBP8	P38719	431 aa		11.89	□□□□□ -0.51
GFD2	YCL036W	HSE1	P38753	452 aa		11.89	□□□□□ -0.51
GFD2	YCL036W	FLC3	P53121	802 aa		11.89	□□□□□ -0.51
GFD2	YCL036W	GPI1	P53306	609 aa		11.89	□□□□□ -0.51
GFD2	YCL036W	ASI2	P53895	289 aa		11.89	□□□□□ -0.51
GFD2	YCL036W	YNL033W	P53964	284 aa		11.89	□□□□□ -0.51
GFD2	YCL036W	YNL019C	P53975	284 aa		11.89	□□□□□ -0.51
GFD2	YCL036W	YOL159C	Q08300	171 aa		11.89	□□□□□ -0.51
GFD2	YCL036W	SGO1	Q08490	590 aa		11.89	□□□□□ -0.51
GFD2	YCL036W	PDH1	Q12428	516 aa	Known RBP	11.89	□□□□□ -0.51
GFD2	YCL036W	MSS18	P08593	268 aa		11.88	□□□□□ -0.51
GFD2	YCL036W	RAM1	P22007	431 aa		11.88	□□□□□ -0.51
GFD2	YCL036W	YKL100C	P34248	587 aa		11.88	□□□□□ -0.51
GFD2	YCL036W	ROT2	P38138	954 aa		11.88	□□□□□ -0.51
GFD2	YCL036W	BEM4	P39011	633 aa		11.88	□□□□□ -0.51
GFD2	YCL036W	SSN3	P39073	555 aa		11.88	□□□□□ -0.51
GFD2	YCL036W	ECM10	P39987	644 aa		11.88	□□□□□ -0.51
GFD2	YCL036W	EMP65	P40085	556 aa		11.88	□□□□□ -0.51
GFD2	YCL036W	ECM9	Q02202	377 aa		11.88	□□□□□ -0.51
GFD2	YCL036W	HBT1	Q07653	1046 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
GFD2	YCL036W	ARG81	P05085	880 aa		11.87	□□□□□ -0.51
GFD2	YCL036W	DST1	P07273	309 aa		11.87	□□□□□ -0.51
GFD2	YCL036W	UGA1	P17649	471 aa		11.87	□□□□□ -0.51
GFD2	YCL036W	SLM4	P38247	162 aa		11.87	□□□□□ -0.51
GFD2	YCL036W	PPX1	P38698	397 aa		11.87	□□□□□ -0.51
GFD2	YCL036W	MED6	P38782	295 aa		11.87	□□□□□ -0.51
GFD2	YCL036W	YER034W	P40022	185 aa	Known RBP	11.87	□□□□□ -0.51
GFD2	YCL036W	UTP18	P40362	594 aa	Predicted RBP	11.87	□□□□□ -0.51
GFD2	YCL036W	RSM7	P47150	247 aa		11.87	□□□□□ -0.51
GFD2	YCL036W	YDR124W	Q04608	324 aa		11.87	□□□□□ -0.51
GFD2	YCL036W	BCH1	Q05029	724 aa		11.87	□□□□□ -0.51
GFD2	YCL036W	GMC2	Q06201	188 aa		11.87	□□□□□ -0.51
GFD2	YCL036W	RAD34	Q06665	692 aa		11.87	□□□□□ -0.51
GFD2	YCL036W	HTA2	P04912	132 aa		11.86	□□□□□ -0.51
GFD2	YCL036W	ARG3	P05150	338 aa		11.86	□□□□□ -0.51
GFD2	YCL036W	RVS161	P25343	265 aa	Known RBP	11.86	□□□□□ -0.51
GFD2	YCL036W	CRM1	P30822	1084 aa	Known RBP	11.86	□□□□□ -0.51
GFD2	YCL036W	MRPL17	P36528	281 aa		11.86	□□□□□ -0.51
GFD2	YCL036W	NUP85	P46673	744 aa		11.86	□□□□□ -0.51
GFD2	YCL036W	YGL176C	P46945	554 aa		11.86	□□□□□ -0.51
GFD2	YCL036W	SWC4	P53201	476 aa		11.86	□□□□□ -0.51
GFD2	YCL036W	HST3	P53687	447 aa		11.86	□□□□□ -0.51
GFD2	YCL036W	SKI8	Q02793	397 aa	Predicted RBP	11.86	□□□□□ -0.51
GFD2	YCL036W	IOC2	Q12072	812 aa		11.86	□□□□□ -0.51
GFD2	YCL036W	MCD1	Q12158	566 aa		11.86	□□□□□ -0.51
GFD2	YCL036W	SEM1	O94742	89 aa		11.86	□□□□□ -0.51
GFD2	YCL036W	MSS116	P15424	664 aa	Known RBP	11.86	□□□□□ -0.51
GFD2	YCL036W	FUN30	P31380	1131 aa		11.86	□□□□□ -0.51
GFD2	YCL036W	RPT5	P33297	434 aa	Known RBP	11.86	□□□□□ -0.51
GFD2	YCL036W	CBF5	P33322	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	11.86	□□□□□ -0.51	not detected
GFD2	YCL036W	MRP8	P35719	219 aa		11.86	□□□□□ -0.51
GFD2	YCL036W	FAD1	P38913	306 aa		11.86	□□□□□ -0.51
GFD2	YCL036W	FMP32	P43557	207 aa		11.86	□□□□□ -0.51
GFD2	YCL036W	NNF1	P47149	201 aa		11.86	□□□□□ -0.51
GFD2	YCL036W	GTO1	P48239	356 aa		11.86	□□□□□ -0.51
GFD2	YCL036W	STE6	P12866	1290 aa		11.85	□□□□□ -0.51
GFD2	YCL036W	EPT1	P22140	391 aa		11.85	□□□□□ -0.51
GFD2	YCL036W	YME2	P32843	850 aa		11.85	□□□□□ -0.51
GFD2	YCL036W	UGP1	P32861	499 aa	Known RBP	11.85	□□□□□ -0.51
GFD2	YCL036W	MEP2	P41948	499 aa		11.85	□□□□□ -0.51
GFD2	YCL036W	COG7	P53195	279 aa		11.85	□□□□□ -0.51
GFD2	YCL036W	YDR344C	Q05510	147 aa		11.85	□□□□□ -0.51
GFD2	YCL036W	FLC1	Q08967	793 aa		11.85	□□□□□ -0.51
GFD2	YCL036W	ULA1	Q12059	462 aa		11.85	□□□□□ -0.51
GFD2	YCL036W	ERG6	P25087	383 aa	Known RBP	11.84	□□□□□ -0.51
GFD2	YCL036W	RSC6	P25632	483 aa		11.84	□□□□□ -0.51
GFD2	YCL036W	RMA1	P36001	430 aa	Known RBP	11.84	□□□□□ -0.51
GFD2	YCL036W	YPT52	P36018	234 aa	Known RBP	11.84	□□□□□ -0.51
GFD2	YCL036W	DSS1	P39112	969 aa		11.84	□□□□□ -0.51
GFD2	YCL036W	SER33	P40510	469 aa		11.84	□□□□□ -0.51
GFD2	YCL036W	EAR1	Q03212	550 aa		11.84	□□□□□ -0.51
GFD2	YCL036W	MMT1	Q03218	510 aa		11.84	□□□□□ -0.51
GFD2	YCL036W	YHM2	Q04013	314 aa		11.84	□□□□□ -0.51
GFD2	YCL036W	ECM11	Q04110	302 aa		11.84	□□□□□ -0.51
GFD2	YCL036W	YHC1	Q05900	231 aa	Known RBP	11.84	□□□□□ -0.51
GFD2	YCL036W	CCH1	P50077	2039 aa		11.83	□□□□□ -0.51
GFD2	YCL036W	CPA1	P07258	411 aa	Known RBP	11.83	□□□□□ -0.52
GFD2	YCL036W	BCY1	P07278	416 aa	Known RBP	11.83	□□□□□ -0.52
GFD2	YCL036W	RPS4A	P0CX35	261 aa	Known RBP	11.83	□□□□□ -0.52
GFD2	YCL036W	RPS4B	P0CX36	261 aa	Known RBP	11.83	□□□□□ -0.52
GFD2	YCL036W	RSR1	P13856	272 aa		11.83	□□□□□ -0.52
GFD2	YCL036W	MET8	P15807	274 aa		11.83	□□□□□ -0.52
GFD2	YCL036W	ATP11	P32453	318 aa		11.83	□□□□□ -0.52
GFD2	YCL036W	SOL2	P37262	315 aa		11.83	□□□□□ -0.52
GFD2	YCL036W	AYR1	P40471	297 aa		11.83	□□□□□ -0.52
GFD2	YCL036W	UPF3	P48412	387 aa	Known RBP	11.83	□□□□□ -0.52
GFD2	YCL036W	SDH1	Q00711	640 aa		11.83	□□□□□ -0.52
GFD2	YCL036W	RAD33	Q04231	177 aa		11.83	□□□□□ -0.52
GFD2	YCL036W	RPC11	Q04307	110 aa	Predicted RBP	11.83	□□□□□ -0.52
GFD2	YCL036W	NKP1	Q12493	238 aa		11.83	□□□□□ -0.52
GFD2	YCL036W	THP2	O13539	261 aa	Known RBP	11.83	□□□□□ -0.52
GFD2	YCL036W	SUI3	P09064	285 aa	Known RBP	11.83	□□□□□ -0.52
GFD2	YCL036W	KEX2	P13134	814 aa		11.83	□□□□□ -0.52
GFD2	YCL036W	SPB1	P25582	841 aa	Predicted RBP	11.83	□□□□□ -0.52
GFD2	YCL036W	SPT16	P32558	1035 aa	Known RBP	11.83	□□□□□ -0.52
GFD2	YCL036W	PMT1	P33775	817 aa		11.83	□□□□□ -0.52
GFD2	YCL036W	SKG1	P36169	355 aa		11.83	□□□□□ -0.52
GFD2	YCL036W	IML3	P38265	245 aa		11.83	□□□□□ -0.52
GFD2	YCL036W	UBA4	P38820	440 aa		11.83	□□□□□ -0.52

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