RNA–Protein interactions for RNA: YBL048W

RRT1, Transcript of Protein of unknown function, yeast

Gene RRT1, Length 312 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RRT1	YBL048W	YNG2	P38806	282 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
RRT1	YBL048W	ARC35	P53731	342 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
RRT1	YBL048W	MRPL51	Q06090	140 aa	Predicted RBP	2.75	□□□□□ -1.97
RRT1	YBL048W	ECM30	Q06673	1274 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RRT1	YBL048W	ETT1	Q08421	412 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
RRT1	YBL048W	HHF1	P02309	103 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
RRT1	YBL048W	MTF2	P10849	440 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RRT1	YBL048W	UBC1	P21734	215 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
RRT1	YBL048W	BUR6	P40096	142 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RRT1	YBL048W	REE1	P40893	198 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RRT1	YBL048W	SCD6	P45978	349 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.74	□□□□□ -1.97	not detected
RRT1	YBL048W	SNG1	P46950	547 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RRT1	YBL048W	ARK1	P53974	638 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RRT1	YBL048W	CIA1	Q05583	330 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RRT1	YBL048W	PBA1	Q05778	276 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RRT1	YBL048W	NUS1	Q12063	375 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RRT1	YBL048W	RBD2	Q12270	262 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RRT1	YBL048W	NUC1	P08466	329 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RRT1	YBL048W	PEP5	P12868	1029 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RRT1	YBL048W	CPR1	P14832	162 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
RRT1	YBL048W	IFA38	P38286	347 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RRT1	YBL048W	MUB1	Q03162	620 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RRT1	YBL048W	VPS74	Q06385	345 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RRT1	YBL048W	LEU9	Q12166	604 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
RRT1	YBL048W	BUD5	P25300	642 aa	Predicted RBP	2.72	□□□□□ -1.97
RRT1	YBL048W	MRPL13	Q02204	264 aa		2.72	□□□□□ -1.97
RRT1	YBL048W	SLD5	Q03406	294 aa		2.72	□□□□□ -1.97
RRT1	YBL048W	ADH2	P00331	348 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
RRT1	YBL048W	YCR007C	P25354	239 aa		2.71	□□□□□ -1.98
RRT1	YBL048W	RAD16	P31244	790 aa		2.71	□□□□□ -1.98
RRT1	YBL048W	PDB1	P32473	366 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
RRT1	YBL048W	FRE1	P32791	686 aa		2.71	□□□□□ -1.98
RRT1	YBL048W	MRP4	P32902	394 aa		2.71	□□□□□ -1.98
RRT1	YBL048W	SIM1	P40472	476 aa		2.71	□□□□□ -1.98
RRT1	YBL048W	YIL067C	P40514	678 aa		2.71	□□□□□ -1.98
RRT1	YBL048W	PIL1	P53252	339 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
RRT1	YBL048W	SHR3	Q02774	210 aa		2.71	□□□□□ -1.98
RRT1	YBL048W	MRPL35	Q06678	367 aa		2.71	□□□□□ -1.98
RRT1	YBL048W	TEN1	Q07921	160 aa		2.71	□□□□□ -1.98
RRT1	YBL048W	HEM15	P16622	393 aa		2.7	□□□□□ -1.98
RRT1	YBL048W	BUD32	P53323	261 aa		2.7	□□□□□ -1.98
RRT1	YBL048W	IRC15	Q02733	499 aa		2.7	□□□□□ -1.98
RRT1	YBL048W	HIP1	P06775	603 aa		2.69	□□□□□ -1.98
RRT1	YBL048W	MSM1	P22438	575 aa		2.69	□□□□□ -1.98
RRT1	YBL048W	YKL100C	P34248	587 aa		2.69	□□□□□ -1.98
RRT1	YBL048W	ACA1	P39970	489 aa		2.69	□□□□□ -1.98
RRT1	YBL048W	SLZ1	P40167	298 aa		2.69	□□□□□ -1.98
RRT1	YBL048W	YJR154W	P47181	346 aa		2.69	□□□□□ -1.98
RRT1	YBL048W	RNY1	Q02933	434 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
RRT1	YBL048W	TSA2	Q04120	196 aa		2.69	□□□□□ -1.98
RRT1	YBL048W	SKG3	Q06315	1026 aa		2.69	□□□□□ -1.98
RRT1	YBL048W	RPB2	P08518	1224 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
RRT1	YBL048W	PHO81	P17442	1178 aa		2.68	□□□□□ -1.98
RRT1	YBL048W	PWP1	P21304	576 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
RRT1	YBL048W	DIA3	P52290	468 aa		2.68	□□□□□ -1.98
RRT1	YBL048W	SHY1	P53266	389 aa		2.68	□□□□□ -1.98
RRT1	YBL048W	DUG3	P53871	357 aa		2.68	□□□□□ -1.98
RRT1	YBL048W	ESA1	Q08649	445 aa		2.68	□□□□□ -1.98
RRT1	YBL048W	NCE102	Q12207	173 aa	RIP-Chip data	2.68	□□□□□ -1.98	not detected
RRT1	YBL048W	ADH7	P25377	361 aa		2.67	□□□□□ -1.98
RRT1	YBL048W	CDC60	P26637	1090 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
RRT1	YBL048W	YKL023W	P36103	277 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
RRT1	YBL048W	RPS7B	P48164	190 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
RRT1	YBL048W	RRT6	P53117	311 aa	Predicted RBP	2.67	□□□□□ -1.98
RRT1	YBL048W	DRN1	P53255	507 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
RRT1	YBL048W	PAP2	P53632	584 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
RRT1	YBL048W	YMR027W	Q04371	470 aa		2.67	□□□□□ -1.98
RRT1	YBL048W	RCO1	Q04779	684 aa		2.67	□□□□□ -1.98
RRT1	YBL048W	SUC2	P00724	532 aa		2.66	□□□□□ -1.98
RRT1	YBL048W	ATP4	P05626	244 aa		2.66	□□□□□ -1.98
RRT1	YBL048W	CHS1	P08004	1131 aa		2.66	□□□□□ -1.98
RRT1	YBL048W	RVS161	P25343	265 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
RRT1	YBL048W	SGF29	P25554	259 aa		2.66	□□□□□ -1.98
RRT1	YBL048W	SYN8	P31377	255 aa		2.66	□□□□□ -1.98
RRT1	YBL048W	GWT1	P47026	490 aa		2.66	□□□□□ -1.98
RRT1	YBL048W	MSC1	Q03104	513 aa		2.66	□□□□□ -1.98
RRT1	YBL048W	YOR365C	Q08844	703 aa		2.66	□□□□□ -1.98
RRT1	YBL048W	LSP1	Q12230	341 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
RRT1	YBL048W	YLR302C	O13544	120 aa		2.65	□□□□□ -1.99
RRT1	YBL048W	RIC1	P40395	1056 aa		2.65	□□□□□ -1.99
RRT1	YBL048W	PSR1	Q07800	427 aa		2.65	□□□□□ -1.99
RRT1	YBL048W	EXO70	P19658	623 aa		2.64	□□□□□ -1.99
RRT1	YBL048W	UTR4	P32626	227 aa		2.64	□□□□□ -1.99
RRT1	YBL048W	UTH1	P36135	365 aa		2.64	□□□□□ -1.99
RRT1	YBL048W	GRX7	P38068	203 aa		2.64	□□□□□ -1.99
RRT1	YBL048W	MRP21	P38175	177 aa		2.64	□□□□□ -1.99
RRT1	YBL048W	YFL067W	P43537	175 aa		2.64	□□□□□ -1.99
RRT1	YBL048W	DSD1	P53095	428 aa		2.64	□□□□□ -1.99
RRT1	YBL048W	IVY1	Q04934	453 aa		2.64	□□□□□ -1.99
RRT1	YBL048W	CPR4	P25334	318 aa		2.63	□□□□□ -1.99
RRT1	YBL048W	XRS2	P33301	854 aa		2.63	□□□□□ -1.99
RRT1	YBL048W	SDH3	P33421	198 aa		2.63	□□□□□ -1.99
RRT1	YBL048W	TEF4	P36008	412 aa	Known RBP	2.63	□□□□□ -1.99
RRT1	YBL048W	ALY1	P36117	915 aa		2.63	□□□□□ -1.99
RRT1	YBL048W	NUP133	P36161	1157 aa		2.63	□□□□□ -1.99
RRT1	YBL048W	YHR210C	P38893	341 aa		2.63	□□□□□ -1.99
RRT1	YBL048W	CAF40	P53829	373 aa		2.63	□□□□□ -1.99
RRT1	YBL048W	PFK2	P16862	959 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.62	□□□□□ -1.99	not detected
RRT1	YBL048W	PUP3	P25451	205 aa	Known RBP	2.62	□□□□□ -1.99
RRT1	YBL048W	MRP20	P32387	263 aa		2.62	□□□□□ -1.99

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