RNA–Protein interactions for RNA: YBL005W-A

YBL005W-A, Transcript of Retrotransposon TYA Gag gene co-transcribed with TYB Pol, yeastyeast

Gene YBL005W-A, Length 1,323 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YBL005W-AYBL005W-A RSM23Q01163 450 aa3.38□□□□□ -1.87
YBL005W-AYBL005W-A MFB1Q04922 465 aa3.38□□□□□ -1.87
YBL005W-AYBL005W-A YEH1Q07804 573 aa3.38□□□□□ -1.87
YBL005W-AYBL005W-A FMP40Q08968 688 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
YBL005W-AYBL005W-A RCN2Q12044 265 aa3.38□□□□□ -1.87
YBL005W-AYBL005W-A RKR1Q04781 1562 aa3.37□□□□□ -1.87
YBL005W-AYBL005W-A EST1P17214 699 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
YBL005W-AYBL005W-A HNM1P19807 563 aa3.37□□□□□ -1.87
YBL005W-AYBL005W-A BUD5P25300 642 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
YBL005W-AYBL005W-A BOS1P25385 244 aa3.37□□□□□ -1.87
YBL005W-AYBL005W-A SNC1P31109 117 aa3.37□□□□□ -1.87
YBL005W-AYBL005W-A YBL055CP34220 418 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
YBL005W-AYBL005W-A YKL100CP34248 587 aa3.37□□□□□ -1.87
YBL005W-AYBL005W-A MIC60P36112 540 aa3.37□□□□□ -1.87
YBL005W-AYBL005W-A ROT2P38138 954 aa3.37□□□□□ -1.87
YBL005W-AYBL005W-A ICS2P38284 255 aa3.37□□□□□ -1.87
YBL005W-AYBL005W-A ERG7P38604 731 aa3.37□□□□□ -1.87
YBL005W-AYBL005W-A UTP9P38882 575 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
YBL005W-AYBL005W-A CCT6P39079 546 aa3.37□□□□□ -1.87
YBL005W-AYBL005W-A PYK2P52489 506 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
YBL005W-AYBL005W-A MRPL19P53875 158 aa3.37□□□□□ -1.87
YBL005W-AYBL005W-A SMA1Q02651 245 aa3.37□□□□□ -1.87
YBL005W-AYBL005W-A YDR415CQ04033 374 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
YBL005W-AYBL005W-A ARP6Q12509 438 aa3.37□□□□□ -1.87
YBL005W-AYBL005W-A YPT6Q99260 215 aa3.37□□□□□ -1.87
YBL005W-AYBL005W-A SMC4Q12267 1418 aa3.37□□□□□ -1.87
YBL005W-AYBL005W-A CHD1P32657 1468 aa3.36□□□□□ -1.87
YBL005W-AYBL005W-A YOR1P53049 1477 aa3.36□□□□□ -1.87
YBL005W-AYBL005W-A OCA4P25366 362 aa3.36□□□□□ -1.87
YBL005W-AYBL005W-A MTR2P34232 184 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
YBL005W-AYBL005W-A PHD1P36093 366 aa3.36□□□□□ -1.87
YBL005W-AYBL005W-A NUP133P36161 1157 aa3.36□□□□□ -1.87
YBL005W-AYBL005W-A RTT107P38850 1070 aa3.36□□□□□ -1.87
YBL005W-AYBL005W-A YND1P40009 630 aa3.36□□□□□ -1.87
YBL005W-AYBL005W-A ARF3P40994 183 aaRIP-Chip data3.36□□□□□ -1.87not detected
YBL005W-AYBL005W-A MAF1P41910 395 aa3.36□□□□□ -1.87
YBL005W-AYBL005W-A RMD8P43620 662 aa3.36□□□□□ -1.87
YBL005W-AYBL005W-A STB2P46679 850 aa3.36□□□□□ -1.87
YBL005W-AYBL005W-A YMR160WQ03823 816 aa3.36□□□□□ -1.87
YBL005W-AYBL005W-A SPC19Q03954 165 aa3.36□□□□□ -1.87
YBL005W-AYBL005W-A TAF11Q04226 346 aa3.36□□□□□ -1.87
YBL005W-AYBL005W-A SSK1Q07084 712 aa3.36□□□□□ -1.87
YBL005W-AYBL005W-A SCM3Q12334 223 aa3.36□□□□□ -1.87
YBL005W-AYBL005W-A STH1P32597 1359 aa3.35□□□□□ -1.87
YBL005W-AYBL005W-A TRM732Q03496 1420 aa3.35□□□□□ -1.87
YBL005W-AYBL005W-A ARG3P05150 338 aa3.35□□□□□ -1.87
YBL005W-AYBL005W-A MRP13P12686 339 aa3.35□□□□□ -1.87
YBL005W-AYBL005W-A CBS1P14066 229 aa3.35□□□□□ -1.87
YBL005W-AYBL005W-A CDC23P16522 626 aa3.35□□□□□ -1.87
YBL005W-AYBL005W-A MCM4P30665 933 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
YBL005W-AYBL005W-A TIF3P34167 436 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
YBL005W-AYBL005W-A GCS1P35197 352 aa3.35□□□□□ -1.87
YBL005W-AYBL005W-A SPC34P36131 295 aa3.35□□□□□ -1.87
YBL005W-AYBL005W-A RPL32P38061 130 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
YBL005W-AYBL005W-A REG2P38232 338 aa3.35□□□□□ -1.87
YBL005W-AYBL005W-A LAG1P38703 411 aa3.35□□□□□ -1.87
YBL005W-AYBL005W-A YAT2P40017 923 aa3.35□□□□□ -1.87
YBL005W-AYBL005W-A SGN1P40561 250 aaKnown RBP RIP-Chip data3.35□□□□□ -1.87not detected
YBL005W-AYBL005W-A YIR014WP40570 242 aa3.35□□□□□ -1.87
YBL005W-AYBL005W-A MEP2P41948 499 aa3.35□□□□□ -1.87
YBL005W-AYBL005W-A FET5P43561 622 aa3.35□□□□□ -1.87
YBL005W-AYBL005W-A APT1P49435 187 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
YBL005W-AYBL005W-A VID30P53076 958 aa3.35□□□□□ -1.87
YBL005W-AYBL005W-A HOS2P53096 452 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
YBL005W-AYBL005W-A CUL3P53202 744 aa3.35□□□□□ -1.87
YBL005W-AYBL005W-A YGR066CP53242 292 aa3.35□□□□□ -1.87
YBL005W-AYBL005W-A IPI3P53877 555 aa3.35□□□□□ -1.87
YBL005W-AYBL005W-A CDC45Q08032 650 aa3.35□□□□□ -1.87
YBL005W-AYBL005W-A YJR112W-AQ3E743 109 aa3.35□□□□□ -1.87
YBL005W-AYBL005W-A MYO4P32492 1471 aa3.34□□□□□ -1.87
YBL005W-AYBL005W-A MMS22Q06164 1454 aa3.34□□□□□ -1.87
YBL005W-AYBL005W-A BAR1P12630 587 aa3.34□□□□□ -1.87
YBL005W-AYBL005W-A CKA1P15790 372 aa3.34□□□□□ -1.87
YBL005W-AYBL005W-A ART10P18634 518 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
YBL005W-AYBL005W-A PPZ1P26570 692 aa3.34□□□□□ -1.87
YBL005W-AYBL005W-A NPL6P32832 435 aa3.34□□□□□ -1.87
YBL005W-AYBL005W-A TRS65P32893 560 aa3.34□□□□□ -1.87
YBL005W-AYBL005W-A SEF1P34228 1148 aa3.34□□□□□ -1.87
YBL005W-AYBL005W-A RRP3P38712 501 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
YBL005W-AYBL005W-A ALG5P40350 334 aa3.34□□□□□ -1.87
YBL005W-AYBL005W-A SPO22P40511 975 aa3.34□□□□□ -1.87
YBL005W-AYBL005W-A YGL082WP53155 381 aa3.34□□□□□ -1.87
YBL005W-AYBL005W-A DUG3P53871 357 aa3.34□□□□□ -1.87
YBL005W-AYBL005W-A RPT6Q01939 405 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
YBL005W-AYBL005W-A MSC1Q03104 513 aa3.34□□□□□ -1.87
YBL005W-AYBL005W-A YLR287CQ05881 355 aa3.34□□□□□ -1.87
YBL005W-AYBL005W-A BSC1Q12140 328 aa3.34□□□□□ -1.87
YBL005W-AYBL005W-A PAN1P32521 1480 aa3.34□□□□□ -1.88
YBL005W-AYBL005W-A FOB1O13329 566 aa3.33□□□□□ -1.88
YBL005W-AYBL005W-A DFR1P07807 211 aaKnown RBP RIP-Chip data3.33□□□□□ -1.88not detected
YBL005W-AYBL005W-A TYR1P20049 452 aa3.33□□□□□ -1.88
YBL005W-AYBL005W-A SUI2P20459 304 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
YBL005W-AYBL005W-A RGT1P32862 1170 aa3.33□□□□□ -1.88
YBL005W-AYBL005W-A SRO77P38163 1010 aa3.33□□□□□ -1.88
YBL005W-AYBL005W-A CIN4P39110 191 aa3.33□□□□□ -1.88
YBL005W-AYBL005W-A MET28P40573 187 aa3.33□□□□□ -1.88
YBL005W-AYBL005W-A IMD4P50094 524 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
YBL005W-AYBL005W-A SMM1P53720 384 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
YBL005W-AYBL005W-A YVH1Q02256 364 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
YBL005W-AYBL005W-A GIR2Q03768 265 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 30.6 ms