RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561136.1

TMOD3-209, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 803 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-209ENST00000561136 MCOLN1Q9GZU1 580 aa6.74□□□□□ -1.33
TMOD3-209ENST00000561136 RNF208Q9H0X6 261 aa6.74□□□□□ -1.33
TMOD3-209ENST00000561136 RASSF4Q9H2L5 321 aa6.74□□□□□ -1.33
TMOD3-209ENST00000561136 SEC31BQ9NQW1 1179 aa6.74□□□□□ -1.33
TMOD3-209ENST00000561136 DLG5Q8TDM6 1919 aa6.74□□□□□ -1.33
TMOD3-209ENST00000561136 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
TMOD3-209ENST00000561136 HEG1Q9ULI3 1381 aa6.73□□□□□ -1.33
TMOD3-209ENST00000561136 SHTN1A0MZ66 631 aa6.73□□□□□ -1.33
TMOD3-209ENST00000561136 CFAP69A5D8W1 941 aa6.73□□□□□ -1.33
TMOD3-209ENST00000561136 PAPLNO95428 1278 aa6.73□□□□□ -1.33
TMOD3-209ENST00000561136 A1BGP04217 495 aa6.73□□□□□ -1.33
TMOD3-209ENST00000561136 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
TMOD3-209ENST00000561136 SRGNP10124 158 aa6.73□□□□□ -1.33
TMOD3-209ENST00000561136 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
TMOD3-209ENST00000561136 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa6.73□□□□□ -1.33
TMOD3-209ENST00000561136 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa6.73□□□□□ -1.33
TMOD3-209ENST00000561136 MYO19Q96H55 970 aa6.73□□□□□ -1.33
TMOD3-209ENST00000561136 RUSC1Q9BVN2 902 aa6.73□□□□□ -1.33
TMOD3-209ENST00000561136 LRFN2Q9ULH4 789 aa6.73□□□□□ -1.33
TMOD3-209ENST00000561136 LRRC37AA6NMS7 1700 aa6.73□□□□□ -1.33
TMOD3-209ENST00000561136 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa6.72□□□□□ -1.33
TMOD3-209ENST00000561136 BRCA2P51587 3418 aa6.72□□□□□ -1.33
TMOD3-209ENST00000561136 CYP26A1O43174 497 aa6.72□□□□□ -1.33
TMOD3-209ENST00000561136 NLRP12P59046 1061 aa6.72□□□□□ -1.33
TMOD3-209ENST00000561136 HYAL2Q12891 473 aa6.72□□□□□ -1.33
TMOD3-209ENST00000561136 BIRC2Q13490 618 aa6.72□□□□□ -1.33
TMOD3-209ENST00000561136 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
TMOD3-209ENST00000561136 AKAP4Q5JQC9 854 aa6.72□□□□□ -1.33
TMOD3-209ENST00000561136 CST9Q5W186 159 aa6.72□□□□□ -1.33
TMOD3-209ENST00000561136 ICE2Q659A1 982 aa6.72□□□□□ -1.33
TMOD3-209ENST00000561136 SDE2Q6IQ49 451 aa6.72□□□□□ -1.33
TMOD3-209ENST00000561136 PCGF5Q86SE9 256 aa6.72□□□□□ -1.33
TMOD3-209ENST00000561136 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
TMOD3-209ENST00000561136 CNTROBQ8N137 903 aa6.72□□□□□ -1.33
TMOD3-209ENST00000561136 AGBL5Q8NDL9 886 aa6.72□□□□□ -1.33
TMOD3-209ENST00000561136 OR13H1Q8NG92 308 aa6.72□□□□□ -1.33
TMOD3-209ENST00000561136 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa6.72□□□□□ -1.33
TMOD3-209ENST00000561136 HACL1Q9UJ83 578 aa6.72□□□□□ -1.33
TMOD3-209ENST00000561136 EPS15P42566 896 aa6.71□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 LMOD3Q0VAK6 560 aa6.71□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 DPYDQ12882 1025 aa6.71□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 MTA1Q13330 715 aa6.71□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 PKN1Q16512 942 aa6.71□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP6.71□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 DEFB115Q30KQ5 88 aa6.71□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 AMOTQ4VCS5 1084 aa6.71□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 CCDC93Q567U6 631 aa6.71□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 ANKRD23Q86SG2 305 aa6.71□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 BRIP1Q9BX63 1249 aa6.71□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 BRINP2Q9C0B6 783 aa6.71□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP6.71□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 PRDM4Q9UKN5 801 aa6.71□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 RIC1Q4ADV7 1423 aa6.7□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 SCN9AQ15858 1988 aa6.7□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 IQCA1LA6NCM1 817 aa6.7□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 VDRP11473 427 aa6.7□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 VAMP1P23763 118 aa6.7□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP6.7□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 NFKBIBQ15653 356 aa6.7□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 STYK1Q6J9G0 422 aa6.7□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 GIPC2Q8TF65 315 aa6.7□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 LNPKQ9C0E8 428 aa6.7□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 PANK3Q9H999 370 aa6.7□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 ABCF2Q9UG63 623 aa6.7□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 CCDC189A1A4V9 331 aa6.69□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 FZD9O00144 591 aa6.69□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 NPHP1O15259 732 aa6.69□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 PTPRAP18433 802 aa6.69□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 PDE6BP35913 854 aa6.69□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 SCNN1AP37088 669 aa6.69□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 IARSP41252 1262 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 RGS19P49795 217 aa6.69□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 TAF3Q5VWG9 929 aa6.69□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 CIAPIN1Q6FI81 312 aa6.69□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 PDILTQ8N807 584 aa6.69□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 ATL2Q8NHH9 583 aa6.69□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 MASTLQ96GX5 879 aa6.69□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 RPS6KC1Q96S38 1066 aa6.69□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa6.69□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 VRTNQ9H8Y1 702 aa6.69□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 ZNF408Q9H9D4 720 aa6.69□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 NRBP1Q9UHY1 535 aa6.69□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa6.69□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 CENPFP49454 3210 aa6.69□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.9 ms