RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492185.5

NELFE-211, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 2

Gene NELFE, Length 1,786 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-211ENST00000492185 CD2APQ9Y5K6 639 aa22.61■■□□□ 1.21
NELFE-211ENST00000492185 A0A1W2PRG0 241 aa22.6■■□□□ 1.21
NELFE-211ENST00000492185 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
NELFE-211ENST00000492185 MED15Q96RN5 788 aa22.6■■□□□ 1.21
NELFE-211ENST00000492185 OFD1O75665 1012 aa22.59■■□□□ 1.21
NELFE-211ENST00000492185 FANCCQ00597 558 aa22.59■■□□□ 1.21
NELFE-211ENST00000492185 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP22.59■■□□□ 1.21
NELFE-211ENST00000492185 KARSQ15046 597 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
NELFE-211ENST00000492185 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
NELFE-211ENST00000492185 PPP4R3AQ6IN85 833 aa22.59■■□□□ 1.21
NELFE-211ENST00000492185 IGSF22Q8N9C0 903 aa22.59■■□□□ 1.21
NELFE-211ENST00000492185 KIAA1524Q8TCG1 905 aa22.59■■□□□ 1.21
NELFE-211ENST00000492185 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
NELFE-211ENST00000492185 SPTLC3Q9NUV7 552 aa22.59■■□□□ 1.21
NELFE-211ENST00000492185 WNT10BO00744 389 aa22.58■■□□□ 1.21
NELFE-211ENST00000492185 ZNF18P17022 549 aa22.58■■□□□ 1.21
NELFE-211ENST00000492185 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
NELFE-211ENST00000492185 CUL4BQ13620 913 aa22.58■■□□□ 1.21
NELFE-211ENST00000492185 PSTPIP2Q9H939 334 aa22.58■■□□□ 1.21
NELFE-211ENST00000492185 IFNKQ9P0W0 207 aa22.58■■□□□ 1.21
NELFE-211ENST00000492185 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa22.58■■□□□ 1.21
NELFE-211ENST00000492185 PP2D1A8MPX8 630 aa22.58■■□□□ 1.2
NELFE-211ENST00000492185 BMP3P12645 472 aa22.58■■□□□ 1.2
NELFE-211ENST00000492185 ATP1A3P13637 1013 aa22.58■■□□□ 1.2
NELFE-211ENST00000492185 RPS12P25398 132 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.2
NELFE-211ENST00000492185 CASP1P29466 404 aa22.58■■□□□ 1.2
NELFE-211ENST00000492185 CDC25AP30304 524 aa22.58■■□□□ 1.2
NELFE-211ENST00000492185 UBA7P41226 1012 aa22.58■■□□□ 1.2
NELFE-211ENST00000492185 TNIP1Q15025 636 aa22.58■■□□□ 1.2
NELFE-211ENST00000492185 SYDE2Q5VT97 1194 aa22.58■■□□□ 1.2
NELFE-211ENST00000492185 JDP2Q8WYK2 163 aa22.58■■□□□ 1.2
NELFE-211ENST00000492185 CUEDC2Q9H467 287 aa22.58■■□□□ 1.2
NELFE-211ENST00000492185 MAGEF1Q9HAY2 307 aa22.58■■□□□ 1.2
NELFE-211ENST00000492185 IMPACTQ9P2X3 320 aa22.58■■□□□ 1.2
NELFE-211ENST00000492185 TMX2Q9Y320 296 aa22.58■■□□□ 1.2
NELFE-211ENST00000492185 MYL1P05976 194 aa22.57■■□□□ 1.2
NELFE-211ENST00000492185 STAT6P42226 847 aa22.57■■□□□ 1.2
NELFE-211ENST00000492185 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP22.57■■□□□ 1.22e-6■■■■□ 25.2
NELFE-211ENST00000492185 SEMA3FQ13275 785 aa22.57■■□□□ 1.2
NELFE-211ENST00000492185 UBE2SQ16763 222 aa22.57■■□□□ 1.2
NELFE-211ENST00000492185 ILDR2Q71H61 639 aa22.57■■□□□ 1.2
NELFE-211ENST00000492185 POTEDQ86YR6 584 aa22.57■■□□□ 1.2
NELFE-211ENST00000492185 MYOZ2Q9NPC6 264 aa22.57■■□□□ 1.2
NELFE-211ENST00000492185 FANCLQ9NW38 375 aa22.57■■□□□ 1.2
NELFE-211ENST00000492185 PYCARDQ9ULZ3 195 aa22.57■■□□□ 1.2
NELFE-211ENST00000492185 ATAD5Q96QE3 1844 aa22.57■■□□□ 1.2
NELFE-211ENST00000492185 RRAGBQ5VZM2 374 aa22.56■■□□□ 1.2
NELFE-211ENST00000492185 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
NELFE-211ENST00000492185 TMEM39BQ9GZU3 492 aa22.56■■□□□ 1.2
NELFE-211ENST00000492185 VEZTQ9HBM0 779 aa22.56■■□□□ 1.2
NELFE-211ENST00000492185 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa22.56■■□□□ 1.2
NELFE-211ENST00000492185 KBTBD4Q9NVX7 518 aa22.56■■□□□ 1.2
NELFE-211ENST00000492185 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa22.56■■□□□ 1.2
NELFE-211ENST00000492185 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa22.55■■□□□ 1.2
NELFE-211ENST00000492185 CD44P16070 742 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
NELFE-211ENST00000492185 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
NELFE-211ENST00000492185 CDAN1Q8IWY9 1227 aa22.55■■□□□ 1.2
NELFE-211ENST00000492185 LRRC15Q8TF66 581 aa22.55■■□□□ 1.2
NELFE-211ENST00000492185 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
NELFE-211ENST00000492185 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
NELFE-211ENST00000492185 SLC37A4O43826 429 aa22.55■■□□□ 1.2
NELFE-211ENST00000492185 TDP2O95551 362 aa22.55■■□□□ 1.2
NELFE-211ENST00000492185 CALCRLQ16602 461 aa22.55■■□□□ 1.2
NELFE-211ENST00000492185 NBPF9Q3BBW0 867 aa22.55■■□□□ 1.2
NELFE-211ENST00000492185 MCTP2Q6DN12 878 aa22.55■■□□□ 1.2
NELFE-211ENST00000492185 CABP7Q86V35 215 aa22.55■■□□□ 1.2
NELFE-211ENST00000492185 TEX2Q8IWB9 1127 aa22.55■■□□□ 1.2
NELFE-211ENST00000492185 AMNQ9BXJ7 453 aa22.55■■□□□ 1.2
NELFE-211ENST00000492185 TNNI2P48788 182 aa22.54■■□□□ 1.2
NELFE-211ENST00000492185 CRYGNQ8WXF5 182 aa22.54■■□□□ 1.2
NELFE-211ENST00000492185 STAMQ92783 540 aa22.54■■□□□ 1.2
NELFE-211ENST00000492185 MBOAT7Q96N66 472 aa22.54■■□□□ 1.2
NELFE-211ENST00000492185 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
NELFE-211ENST00000492185 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa22.54■■□□□ 1.2
NELFE-211ENST00000492185 SHTN1A0MZ66 631 aa22.53■■□□□ 1.2
NELFE-211ENST00000492185 TMEM232C9JQI7 657 aa22.53■■□□□ 1.2
NELFE-211ENST00000492185 CBFA2T2O43439 604 aa22.53■■□□□ 1.2
NELFE-211ENST00000492185 CAP2P40123 477 aa22.53■■□□□ 1.2
NELFE-211ENST00000492185 GSDMDP57764 484 aa22.53■■□□□ 1.2
NELFE-211ENST00000492185 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa22.53■■□□□ 1.2
NELFE-211ENST00000492185 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
NELFE-211ENST00000492185 ACER1Q8TDN7 264 aa22.53■■□□□ 1.2
NELFE-211ENST00000492185 BLZF1Q9H2G9 400 aa22.53■■□□□ 1.2
NELFE-211ENST00000492185 RMND1Q9NWS8 449 aa22.53■■□□□ 1.2
NELFE-211ENST00000492185 MEIS2O14770 477 aa22.53■■□□□ 1.2
NELFE-211ENST00000492185 RAD21O60216 631 aa22.53■■□□□ 1.2
NELFE-211ENST00000492185 PLA2G6O60733 806 aa22.53■■□□□ 1.2
NELFE-211ENST00000492185 RPN1P04843 607 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
NELFE-211ENST00000492185 ECE1P42892 770 aa22.53■■□□□ 1.2
NELFE-211ENST00000492185 PTGER2P43116 358 aa22.53■■□□□ 1.2
NELFE-211ENST00000492185 LRMPQ12912 555 aa22.53■■□□□ 1.2
NELFE-211ENST00000492185 AP3B2Q13367 1082 aa22.53■■□□□ 1.2
NELFE-211ENST00000492185 PDIA5Q14554 519 aa22.53■■□□□ 1.2
NELFE-211ENST00000492185 KCNB1Q14721 858 aa22.53■■□□□ 1.2
NELFE-211ENST00000492185 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP22.53■■□□□ 1.2
NELFE-211ENST00000492185 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
NELFE-211ENST00000492185 FBXO11Q86XK2 927 aa22.53■■□□□ 1.2
NELFE-211ENST00000492185 LRRC8AQ8IWT6 810 aa22.53■■□□□ 1.2
NELFE-211ENST00000492185 GOPCQ9HD26 462 aa22.53■■□□□ 1.2
NELFE-211ENST00000492185 SMCHD1A6NHR9 2005 aa22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.9 ms