RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477743.1

MFSD1-212, Transcript of major facilitator superfamily domain containing 1, humanhuman

TSL 3

Gene MFSD1, Length 581 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD1-212ENST00000477743 RMND1Q9NWS8 449 aa6.7□□□□□ -1.34
MFSD1-212ENST00000477743 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
MFSD1-212ENST00000477743 GGA1Q9UJY5 639 aa6.7□□□□□ -1.34
MFSD1-212ENST00000477743 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa6.7□□□□□ -1.34
MFSD1-212ENST00000477743 TACC3Q9Y6A5 838 aa6.7□□□□□ -1.34
MFSD1-212ENST00000477743 PLCH1Q4KWH8 1693 aa6.7□□□□□ -1.34
MFSD1-212ENST00000477743 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa6.7□□□□□ -1.34
MFSD1-212ENST00000477743 LRP5O75197 1615 aa6.69□□□□□ -1.34
MFSD1-212ENST00000477743 PRDM1O75626 825 aa6.69□□□□□ -1.34
MFSD1-212ENST00000477743 MYL1P05976 194 aa6.69□□□□□ -1.34
MFSD1-212ENST00000477743 TPM1P09493 284 aa6.69□□□□□ -1.34
MFSD1-212ENST00000477743 TSPY3P0CV98 308 aa6.69□□□□□ -1.34
MFSD1-212ENST00000477743 TSPY8P0CW00 308 aa6.69□□□□□ -1.34
MFSD1-212ENST00000477743 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
MFSD1-212ENST00000477743 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
MFSD1-212ENST00000477743 PLCD1P51178 756 aa6.69□□□□□ -1.34
MFSD1-212ENST00000477743 LRMPQ12912 555 aa6.69□□□□□ -1.34
MFSD1-212ENST00000477743 NR5A1Q13285 461 aa6.69□□□□□ -1.34
MFSD1-212ENST00000477743 CCDC144BQ3MJ40 725 aa6.69□□□□□ -1.34
MFSD1-212ENST00000477743 OXLD1Q5BKU9 147 aa6.69□□□□□ -1.34
MFSD1-212ENST00000477743 SPATA1Q5VX52 437 aa6.69□□□□□ -1.34
MFSD1-212ENST00000477743 TRAF7Q6Q0C0 670 aa6.69□□□□□ -1.34
MFSD1-212ENST00000477743 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
MFSD1-212ENST00000477743 BLIDQ8IZY5 108 aa6.69□□□□□ -1.34
MFSD1-212ENST00000477743 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
MFSD1-212ENST00000477743 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
MFSD1-212ENST00000477743 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
MFSD1-212ENST00000477743 SPATA20Q8TB22 786 aa6.69□□□□□ -1.34
MFSD1-212ENST00000477743 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
MFSD1-212ENST00000477743 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
MFSD1-212ENST00000477743 CRAMP1Q96RY5 1269 aa6.69□□□□□ -1.34
MFSD1-212ENST00000477743 CSRNP2Q9H175 543 aa6.69□□□□□ -1.34
MFSD1-212ENST00000477743 VPS54Q9P1Q0 977 aa6.69□□□□□ -1.34
MFSD1-212ENST00000477743 SERTAD1Q9UHV2 236 aa6.69□□□□□ -1.34
MFSD1-212ENST00000477743 MAN1B1Q9UKM7 699 aa6.69□□□□□ -1.34
MFSD1-212ENST00000477743 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa6.69□□□□□ -1.34
MFSD1-212ENST00000477743 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa6.68□□□□□ -1.34
MFSD1-212ENST00000477743 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa6.68□□□□□ -1.34
MFSD1-212ENST00000477743 hCG_1984214I3L0E3 225 aa6.68□□□□□ -1.34
MFSD1-212ENST00000477743 CTIFO43310 598 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
MFSD1-212ENST00000477743 IL1R1P14778 569 aa6.68□□□□□ -1.34
MFSD1-212ENST00000477743 GNA11P29992 359 aa6.68□□□□□ -1.34
MFSD1-212ENST00000477743 PRDX5P30044 214 aa6.68□□□□□ -1.34
MFSD1-212ENST00000477743 PPP1R2P41236 205 aa6.68□□□□□ -1.34
MFSD1-212ENST00000477743 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
MFSD1-212ENST00000477743 SPAG1Q07617 926 aa6.68□□□□□ -1.34
MFSD1-212ENST00000477743 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
MFSD1-212ENST00000477743 GRM4Q14833 912 aa6.68□□□□□ -1.34
MFSD1-212ENST00000477743 NFIXQ14938 502 aa6.68□□□□□ -1.34
MFSD1-212ENST00000477743 ZNF174Q15697 407 aa6.68□□□□□ -1.34
MFSD1-212ENST00000477743 FAM47AQ5JRC9 791 aa6.68□□□□□ -1.34
MFSD1-212ENST00000477743 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
MFSD1-212ENST00000477743 ISM2Q6H9L7 571 aa6.68□□□□□ -1.34
MFSD1-212ENST00000477743 DTHD1Q6ZMT9 781 aa6.68□□□□□ -1.34
MFSD1-212ENST00000477743 FAM196AQ6ZSG2 479 aa6.68□□□□□ -1.34
MFSD1-212ENST00000477743 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
MFSD1-212ENST00000477743 VSTM4Q8IW00 320 aa6.68□□□□□ -1.34
MFSD1-212ENST00000477743 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
MFSD1-212ENST00000477743 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
MFSD1-212ENST00000477743 RETREG2Q8NC44 543 aa6.68□□□□□ -1.34
MFSD1-212ENST00000477743 DAGLBQ8NCG7 672 aa6.68□□□□□ -1.34
MFSD1-212ENST00000477743 ZNF384Q8TF68 577 aa6.68□□□□□ -1.34
MFSD1-212ENST00000477743 PAGE5Q96GU1 130 aa6.68□□□□□ -1.34
MFSD1-212ENST00000477743 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
MFSD1-212ENST00000477743 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
MFSD1-212ENST00000477743 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
MFSD1-212ENST00000477743 VRTNQ9H8Y1 702 aa6.68□□□□□ -1.34
MFSD1-212ENST00000477743 MAGEF1Q9HAY2 307 aa6.68□□□□□ -1.34
MFSD1-212ENST00000477743 CD209Q9NNX6 404 aa6.68□□□□□ -1.34
MFSD1-212ENST00000477743 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa6.68□□□□□ -1.34
MFSD1-212ENST00000477743 FANCLQ9NW38 375 aa6.68□□□□□ -1.34
MFSD1-212ENST00000477743 PODXL2Q9NZ53 605 aa6.68□□□□□ -1.34
MFSD1-212ENST00000477743 PKD2L1Q9P0L9 805 aa6.68□□□□□ -1.34
MFSD1-212ENST00000477743 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
MFSD1-212ENST00000477743 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
MFSD1-212ENST00000477743 PCDHA4Q9UN74 947 aa6.68□□□□□ -1.34
MFSD1-212ENST00000477743 DOLKQ9UPQ8 538 aa6.68□□□□□ -1.34
MFSD1-212ENST00000477743 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa6.68□□□□□ -1.34
MFSD1-212ENST00000477743 ITGB4P16144 1822 aa6.68□□□□□ -1.34
MFSD1-212ENST00000477743 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa6.67□□□□□ -1.34
MFSD1-212ENST00000477743 ERVH48-1M5A8F1 160 aa6.67□□□□□ -1.34
MFSD1-212ENST00000477743 WNT7AO00755 349 aa6.67□□□□□ -1.34
MFSD1-212ENST00000477743 ARHGAP6O43182 974 aa6.67□□□□□ -1.34
MFSD1-212ENST00000477743 STX10O60499 249 aa6.67□□□□□ -1.34
MFSD1-212ENST00000477743 PLEKHA8P1O95397 391 aa6.67□□□□□ -1.34
MFSD1-212ENST00000477743 SERPINB2P05120 415 aa6.67□□□□□ -1.34
MFSD1-212ENST00000477743 FSHRP23945 695 aa6.67□□□□□ -1.34
MFSD1-212ENST00000477743 GRM5P41594 1212 aa6.67□□□□□ -1.34
MFSD1-212ENST00000477743 KCNQ4P56696 695 aa6.67□□□□□ -1.34
MFSD1-212ENST00000477743 TUBB4BP68371 445 aa6.67□□□□□ -1.34
MFSD1-212ENST00000477743 CCZ1BP86790 482 aa6.67□□□□□ -1.34
MFSD1-212ENST00000477743 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
MFSD1-212ENST00000477743 RBM10P98175 930 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
MFSD1-212ENST00000477743 AMPD3Q01432 767 aa6.67□□□□□ -1.34
MFSD1-212ENST00000477743 STIM1Q13586 685 aa6.67□□□□□ -1.34
MFSD1-212ENST00000477743 NBPF20Q3BBV1 942 aa6.67□□□□□ -1.34
MFSD1-212ENST00000477743 CRY2Q49AN0 593 aa6.67□□□□□ -1.34
MFSD1-212ENST00000477743 SOGA3Q5TF21 947 aa6.67□□□□□ -1.34
MFSD1-212ENST00000477743 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa6.67□□□□□ -1.34
MFSD1-212ENST00000477743 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa6.67□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.9 ms