RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000457025.5

CCDC18-AS1-222, CCDC18 antisense RNA 1, human

TSL 5

Gene CCDC18-AS1, Length 413 nt, Biotype antisense RNA.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	WWC2	Q6AWC2	1192 aa		11.59	□□□□□ -0.55
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	RGMB	Q6NW40	437 aa		11.59	□□□□□ -0.55
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	LBX2	Q6XYB7	198 aa		11.59	□□□□□ -0.55
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	HOMER1	Q86YM7	354 aa		11.59	□□□□□ -0.55
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	DAGLB	Q8NCG7	672 aa		11.59	□□□□□ -0.55
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	BBX	Q8WY36	941 aa	Predicted RBP	11.59	□□□□□ -0.55
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	KHSRP	Q92945	711 aa	Known RBP eCLIP	11.59	□□□□□ -0.55	7e-11	■□□□□ 10.4
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	CCDC102A	Q96A19	550 aa		11.59	□□□□□ -0.55
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	KIFC2	Q96AC6	838 aa		11.59	□□□□□ -0.55
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	AIFM3	Q96NN9	605 aa		11.59	□□□□□ -0.55
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	PHF20	Q9BVI0	1012 aa		11.59	□□□□□ -0.55
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	AMN	Q9BXJ7	453 aa		11.59	□□□□□ -0.55
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	CRISPLD2	Q9H0B8	497 aa		11.59	□□□□□ -0.55
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	GLT8D2	Q9H1C3	349 aa		11.59	□□□□□ -0.55
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	ZSCAN16	Q9H4T2	348 aa	Predicted RBP	11.59	□□□□□ -0.55
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	SLC38A10	Q9HBR0	1119 aa		11.59	□□□□□ -0.55
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	FBXO28	Q9NVF7	368 aa		11.59	□□□□□ -0.55
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	ZDHHC9	Q9Y397	364 aa		11.59	□□□□□ -0.55
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	ATP6V1D	Q9Y5K8	247 aa		11.59	□□□□□ -0.55
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	hCG_1642624	A0A1W2PR95	340 aa		11.58	□□□□□ -0.56
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	TESPA1	A2RU30	521 aa	Predicted RBP	11.58	□□□□□ -0.56
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	VPS37C	A5D8V6	355 aa	Predicted RBP	11.58	□□□□□ -0.56
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	STXBP3	O00186	592 aa		11.58	□□□□□ -0.56
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	ATP2A1	O14983	1001 aa		11.58	□□□□□ -0.56
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	DTNB	O60941	627 aa		11.58	□□□□□ -0.56
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	ZBED4	O75132	1171 aa		11.58	□□□□□ -0.56
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	GNA11	P29992	359 aa		11.58	□□□□□ -0.56
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	DSG2	Q14126	1118 aa		11.58	□□□□□ -0.56
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	GADL1	Q6ZQY3	521 aa		11.58	□□□□□ -0.56
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	HEATR3	Q7Z4Q2	680 aa		11.58	□□□□□ -0.56
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	FBXO11	Q86XK2	927 aa		11.58	□□□□□ -0.56
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	RASAL3	Q86YV0	1011 aa		11.58	□□□□□ -0.56
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	MB21D1	Q8N884	522 aa		11.58	□□□□□ -0.56
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	GTF3C2	Q8WUA4	911 aa	Predicted RBP	11.58	□□□□□ -0.56
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	MAF1	Q9H063	256 aa		11.58	□□□□□ -0.56
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	ZMYND12	Q9H0C1	365 aa		11.58	□□□□□ -0.56
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	FOXP1	Q9H334	677 aa	Predicted RBP	11.58	□□□□□ -0.56
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	BRMS1	Q9HCU9	246 aa		11.58	□□□□□ -0.56
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	ZCCHC17	Q9NP64	241 aa	Known RBP	11.58	□□□□□ -0.56
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	VPS54	Q9P1Q0	977 aa		11.58	□□□□□ -0.56
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	MANSC4	A6NHS7	340 aa	Predicted RBP	11.57	□□□□□ -0.56
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	VWA5A	O00534	786 aa		11.57	□□□□□ -0.56
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	PPP1R11	O60927	126 aa	Predicted RBP	11.57	□□□□□ -0.56
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	F13A1	P00488	732 aa		11.57	□□□□□ -0.56
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	ICAM1	P05362	532 aa		11.57	□□□□□ -0.56
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	SLC10A3	P09131	477 aa		11.57	□□□□□ -0.56
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	U2AF2	P26368	475 aa	Known RBP eCLIP	11.57	□□□□□ -0.56	2e-6	■■■■□ 23.2
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	ZNF157	P51786	506 aa	Predicted RBP	11.57	□□□□□ -0.56
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	NAPA	P54920	295 aa		11.57	□□□□□ -0.56
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	INHBE	P58166	350 aa		11.57	□□□□□ -0.56
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	KIF23	Q02241	960 aa	Predicted RBP	11.57	□□□□□ -0.56
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	DGKZ	Q13574	1117 aa		11.57	□□□□□ -0.56
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	PKP1	Q13835	747 aa		11.57	□□□□□ -0.56
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	TREML2	Q5T2D2	321 aa		11.57	□□□□□ -0.56
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	GPAT2	Q6NUI2	795 aa		11.57	□□□□□ -0.56
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	CLEC17A	Q6ZS10	378 aa		11.57	□□□□□ -0.56
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	BRAP	Q7Z569	592 aa		11.57	□□□□□ -0.56
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	ANKRD23	Q86SG2	305 aa		11.57	□□□□□ -0.56
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	PLPP6	Q8IY26	295 aa		11.57	□□□□□ -0.56
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	SAMD3	Q8N6K7	520 aa		11.57	□□□□□ -0.56
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	BICD2	Q8TD16	824 aa		11.57	□□□□□ -0.56
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	PIBF1	Q8WXW3	757 aa		11.57	□□□□□ -0.56
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	SHISA4	Q96DD7	197 aa		11.57	□□□□□ -0.56
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	C6orf50	Q9HD87	102 aa		11.57	□□□□□ -0.56
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	PNMA3	Q9UL41	463 aa		11.57	□□□□□ -0.56
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	ATAD5	Q96QE3	1844 aa		11.56	□□□□□ -0.56
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	CCL15-CCL14	A0A0B4J2E2	113 aa		11.56	□□□□□ -0.56
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	SPDYE16	A6NNV3	312 aa	Predicted RBP	11.56	□□□□□ -0.56
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	OSBP	P22059	807 aa		11.56	□□□□□ -0.56
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	KRT2	P35908	639 aa		11.56	□□□□□ -0.56
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	NLRP5	P59047	1200 aa		11.56	□□□□□ -0.56
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	IRX3	P78415	501 aa	Predicted RBP	11.56	□□□□□ -0.56
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	REST	Q13127	1097 aa		11.56	□□□□□ -0.56
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	NPY5R	Q15761	445 aa		11.56	□□□□□ -0.56
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	CCL15	Q16663	113 aa		11.56	□□□□□ -0.56
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	TKFC	Q3LXA3	575 aa		11.56	□□□□□ -0.56
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	ATL3	Q6DD88	541 aa		11.56	□□□□□ -0.56
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	MCTP2	Q6DN12	878 aa		11.56	□□□□□ -0.56
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	OTUD7B	Q6GQQ9	843 aa		11.56	□□□□□ -0.56
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	TYW1B	Q6NUM6	668 aa		11.56	□□□□□ -0.56
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	DIS3L2	Q8IYB7	885 aa	Known RBP	11.56	□□□□□ -0.56
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	REPS2	Q8NFH8	660 aa		11.56	□□□□□ -0.56
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	BRI3BP	Q8WY22	251 aa		11.56	□□□□□ -0.56
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	GPKOW	Q92917	476 aa	Predicted RBP eCLIP	11.56	□□□□□ -0.56
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	ATG4C	Q96DT6	458 aa		11.56	□□□□□ -0.56
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	ASCC2	Q9H1I8	757 aa	Predicted RBP	11.56	□□□□□ -0.56
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	RIC8A	Q9NPQ8	531 aa		11.56	□□□□□ -0.56
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	PCDHA4	Q9UN74	947 aa		11.56	□□□□□ -0.56
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	MRPL11	Q9Y3B7	192 aa	Known RBP	11.56	□□□□□ -0.56
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	CTDP1	Q9Y5B0	961 aa	Predicted RBP	11.56	□□□□□ -0.56
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	PCDHA1	Q9Y5I3	950 aa		11.56	□□□□□ -0.56
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	MYH4	Q9Y623	1939 aa		11.56	□□□□□ -0.56
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	ABCB11	O95342	1321 aa		11.56	□□□□□ -0.56
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	OTOF	Q9HC10	1997 aa		11.56	□□□□□ -0.56
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	SMCO2	A6NFE2	343 aa		11.55	□□□□□ -0.56
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	APLP1	P51693	650 aa		11.55	□□□□□ -0.56
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	MRPL12	P52815	198 aa	Known RBP	11.55	□□□□□ -0.56
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	GUCY1B3	Q02153	619 aa		11.55	□□□□□ -0.56
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	MCTP1	Q6DN14	999 aa		11.55	□□□□□ -0.56
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	BLID	Q8IZY5	108 aa		11.55	□□□□□ -0.56

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