RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444916.5

SH3BP4-205, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene SH3BP4, Length 570 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-205ENST00000444916 VCANP13611 3396 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 CDC45O75419 566 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 FGD4Q96M96 766 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 FAM161BQ96MY7 647 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 GUCD1Q96NT3 240 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 CNPY2Q9Y2B0 182 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 MYH6P13533 1939 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 LCTP09848 1927 aa16.53■□□□□ 0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 WDR19Q8NEZ3 1342 aa16.53■□□□□ 0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 ERICH2A1L162 156 aa16.53■□□□□ 0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 POTEB2H3BUK9 544 aa16.53■□□□□ 0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 SART3Q15020 963 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 MUM1L1Q5H9M0 696 aa16.53■□□□□ 0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 FAM133AQ8N9E0 248 aa16.53■□□□□ 0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa16.53■□□□□ 0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 SLC27A2O14975 620 aa16.52■□□□□ 0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 CNTN2Q02246 1040 aa16.52■□□□□ 0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 NECTIN1Q15223 517 aa16.52■□□□□ 0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 CREB3L3Q68CJ9 461 aa16.52■□□□□ 0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP16.52■□□□□ 0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 UBA5Q9GZZ9 404 aa16.52■□□□□ 0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 CYP39A1Q9NYL5 469 aa16.52■□□□□ 0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 DNM1LO00429 736 aa16.51■□□□□ 0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP16.51■□□□□ 0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 AKR1A1P14550 325 aa16.51■□□□□ 0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 ANTXR2P58335 489 aa16.51■□□□□ 0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 WTAPQ15007 396 aa16.51■□□□□ 0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 ERICH6BQ5W0A0 696 aa16.51■□□□□ 0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 ANO1Q5XXA6 986 aa16.51■□□□□ 0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 NSMFQ6X4W1 530 aa16.51■□□□□ 0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 CHST3Q7LGC8 479 aa16.51■□□□□ 0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 ADGRF4Q8IZF3 695 aa16.51■□□□□ 0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 CPVLQ9H3G5 476 aa16.51■□□□□ 0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP16.51■□□□□ 0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 NFIBO00712 420 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 RARBP10826 455 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 TMEM67Q5HYA8 995 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 ARMCX2Q7L311 632 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 ARRDC4Q8NCT1 418 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 CLEC4DQ8WXI8 215 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 MTA3Q9BTC8 594 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 PPP4R2Q9NY27 417 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 LRRC37A2A6NM11 1700 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 SOWAHBA6NEL2 793 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 RNF20Q5VTR2 975 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 STAG2Q8N3U4 1231 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 SENP2Q9HC62 589 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 MAD2L2Q9UI95 211 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 ASTN1O14525 1302 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 ASB14A6NK59 587 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 KLRF2D3W0D1 207 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 PRC1O43663 620 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 MCM5P33992 734 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 TROAPQ12815 778 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 ACVR2BQ13705 512 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 GRM4Q14833 912 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 USH1GQ495M9 461 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 KATNBL1Q9H079 304 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 JMJD4Q9H9V9 463 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 FAM184BQ9ULE4 1060 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 PTPDC1A2A3K4 754 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 KBTBD13C9JR72 458 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 LRRC41Q15345 812 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 QRICH1Q2TAL8 776 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 SLC30A10Q6XR72 485 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 RNF207Q6ZRF8 634 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 CATIPQ7Z7H3 387 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 TMEM87BQ96K49 555 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 LY9Q9HBG7 655 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 VAT1LQ9HCJ6 419 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 ABCB11O95342 1321 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 RPS6P62753 249 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 CCDC144BQ3MJ40 725 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 FBXO11Q86XK2 927 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 RGS22Q8NE09 1264 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 MTMR8Q96EF0 704 aa16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.3 ms