RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000026390.7

Rabgef1-201, Transcript of Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Rabgef1, Length 2,828 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ccdc191J3QQ27 883 aa11.49□□□□□ -0.57
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Parp1P11103 1013 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 EmbP21995 330 aa11.49□□□□□ -0.57
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Sap30bpQ02614 308 aa11.49□□□□□ -0.57
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Foxn3Q499D0 457 aa11.49□□□□□ -0.57
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Slc10a5Q5PT54 434 aa11.49□□□□□ -0.57
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Txndc16Q7TN22 820 aa11.49□□□□□ -0.57
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Atxn7Q8R4I1 867 aa11.49□□□□□ -0.57
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Galntl5Q9D4M9 431 aa11.49□□□□□ -0.57
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tmem191cQ9JJB1 302 aa11.49□□□□□ -0.57
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Mkrn1Q9QXP6 481 aa11.49□□□□□ -0.57
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Map7d1A2AJI0 846 aa11.49□□□□□ -0.57
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Rsbn1lD3Z0K6 821 aa11.49□□□□□ -0.57
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Kif23E9Q5G3 953 aa11.49□□□□□ -0.57
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tpm1P58771 284 aa11.49□□□□□ -0.57
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Fbln1Q08879 705 aa11.49□□□□□ -0.57
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Rasa3Q60790 834 aa11.49□□□□□ -0.57
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Kiaa0754Q69ZZ9 979 aa11.49□□□□□ -0.57
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ddx31Q6NZQ2 687 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 CenpqQ9CPQ5 267 aa11.49□□□□□ -0.57
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Desi2Q9D291 194 aa11.49□□□□□ -0.57
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tube1Q9D6T1 475 aa11.49□□□□□ -0.57
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Frmpd3A0A140LIW3 1774 aa11.49□□□□□ -0.57
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Lbhd1A0A087WPA0 259 aa11.48□□□□□ -0.57
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Dnai2A2AC93 623 aa11.48□□□□□ -0.57
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Dync1i1O88485 628 aa11.48□□□□□ -0.57
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Oxr1Q4KMM3 866 aa11.48□□□□□ -0.57
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 CtcfQ61164 736 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Mrps31Q61733 384 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tcp11l2Q8K1H7 517 aa11.48□□□□□ -0.57
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Styxl1Q9DAR2 321 aa11.48□□□□□ -0.57
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Sertad1Q9JL10 236 aa11.48□□□□□ -0.57
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 GsdmeQ9Z2D3 512 aa11.48□□□□□ -0.57
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Lrrc32G3XA59 663 aa11.48□□□□□ -0.57
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Krt18P05784 423 aa11.48□□□□□ -0.57
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 PpardP35396 440 aa11.48□□□□□ -0.57
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Spata18Q0P557 537 aa11.48□□□□□ -0.57
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Klrg2Q3UM83 387 aa11.48□□□□□ -0.57
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 PigsQ6PD26 555 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ift74Q8BKE9 600 aa11.48□□□□□ -0.57
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gpcpd1Q8C0L9 675 aa11.48□□□□□ -0.57
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Mical1Q8VDP3 1048 aa11.48□□□□□ -0.57
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm5580A0A0N4SVP8 411 aa11.47□□□□□ -0.57
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Bpifb4A2BGH0 617 aa11.47□□□□□ -0.57
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Scgb2b19J3QM75 112 aa11.47□□□□□ -0.57
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Mx1P09922 631 aa11.47□□□□□ -0.57
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Akap4Q60662 849 aa11.47□□□□□ -0.57
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Fkbp3Q62446 224 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 CbarpQ66L44 698 aa11.47□□□□□ -0.57
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gpr101Q80T62 511 aa11.47□□□□□ -0.57
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tango6Q8C3S2 1079 aa11.47□□□□□ -0.57
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 EhhadhQ9DBM2 718 aa11.47□□□□□ -0.57
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Pkd2l2Q9JLG4 621 aa11.47□□□□□ -0.57
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Adamtsl1Q8BLI0 1745 aa11.47□□□□□ -0.57
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm5934D3Z4U6 212 aa11.47□□□□□ -0.57
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 SarsP26638 512 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Nedd1P33215 660 aa11.47□□□□□ -0.57
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Npr3P70180 536 aa11.47□□□□□ -0.57
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ptger2Q62053 362 aa11.47□□□□□ -0.57
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Igdcc3Q8BQC3 813 aa11.47□□□□□ -0.57
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 MslnlQ8C160 685 aa11.47□□□□□ -0.57
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Rhobtb3Q9CTN4 611 aa11.47□□□□□ -0.57
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 SmapQ9R0P4 181 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Slc26a4Q9R155 780 aa11.47□□□□□ -0.57
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Nfatc2ipO09130 412 aa11.46□□□□□ -0.57
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Copb2O55029 905 aa11.46□□□□□ -0.57
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Cyp2e1Q05421 493 aa11.46□□□□□ -0.57
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Pnma5Q5DTT8 618 aa11.46□□□□□ -0.57
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tbc1d9bQ5SVR0 1263 aa11.46□□□□□ -0.57
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Krt82Q99M74 516 aa11.46□□□□□ -0.57
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Cul5Q9D5V5 780 aa11.46□□□□□ -0.57
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Plcb1Q9Z1B3 1216 aa11.46□□□□□ -0.57
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 PfasQ5SUR0 1337 aa11.46□□□□□ -0.57
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 GabreA2AMW3 916 aa11.46□□□□□ -0.58
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Sept2P42208 361 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.58
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Mcm6P97311 821 aa11.46□□□□□ -0.58
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Qrich1Q3UA37 777 aa11.46□□□□□ -0.58
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Lrrc55Q3UY51 311 aa11.46□□□□□ -0.58
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Stxbp3Q60770 592 aa11.46□□□□□ -0.58
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Kdm1aQ6ZQ88 853 aa11.46□□□□□ -0.58
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Dnph1Q80VJ3 173 aa11.46□□□□□ -0.58
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Bbs9Q811G0 885 aa11.46□□□□□ -0.58
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Kremen1Q99N43 473 aa11.46□□□□□ -0.58
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 AmfrQ9R049 643 aa11.46□□□□□ -0.58
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 ArcQ9WV31 396 aa11.46□□□□□ -0.58
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm5737A0A140LI11 423 aa11.45□□□□□ -0.58
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tpp1O89023 562 aa11.45□□□□□ -0.58
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 EporP14753 507 aa11.45□□□□□ -0.58
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Mybl2P48972 704 aa11.45□□□□□ -0.58
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tigd5Q499M4 642 aa11.45□□□□□ -0.58
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Large2Q5XPT3 690 aa11.45□□□□□ -0.58
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Asic1Q6NXK8 526 aa11.45□□□□□ -0.58
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ccdc189Q6NZQ0 333 aa11.45□□□□□ -0.58
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Camsap3Q80VC9 1252 aa11.45□□□□□ -0.58
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Prpf40bQ80W14 870 aa11.45□□□□□ -0.58
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Scfd1Q8BRF7 639 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ano2Q8CFW1 1002 aa11.45□□□□□ -0.58
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Rab3il1Q8VDV3 383 aa11.45□□□□□ -0.58
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Efhd1Q9D4J1 240 aa11.45□□□□□ -0.58
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Uso1Q9Z1Z0 959 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 30.2 ms