Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC40.66■■■■■ 4.1
Pkd2l2Q9JLG4 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
Pkd2l2Q9JLG4 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Pkd2l2Q9JLG4 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Pkd2l2Q9JLG4 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.52
Pkd2l2Q9JLG4 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Pkd2l2Q9JLG4 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
Pkd2l2Q9JLG4 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Pkd2l2Q9JLG4 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC35.57■■■■□ 3.29
Pkd2l2Q9JLG4 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
Pkd2l2Q9JLG4 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Pkd2l2Q9JLG4 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
Pkd2l2Q9JLG4 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
Pkd2l2Q9JLG4 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Pkd2l2Q9JLG4 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Pkd2l2Q9JLG4 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Pkd2l2Q9JLG4 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Pkd2l2Q9JLG4 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Pkd2l2Q9JLG4 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
Pkd2l2Q9JLG4 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Pkd2l2Q9JLG4 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Pkd2l2Q9JLG4 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
Pkd2l2Q9JLG4 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
Pkd2l2Q9JLG4 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Pkd2l2Q9JLG4 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Pkd2l2Q9JLG4 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
Pkd2l2Q9JLG4 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Pkd2l2Q9JLG4 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Pkd2l2Q9JLG4 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Pkd2l2Q9JLG4 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Pkd2l2Q9JLG4 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Pkd2l2Q9JLG4 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Pkd2l2Q9JLG4 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Pkd2l2Q9JLG4 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Pkd2l2Q9JLG4 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Pkd2l2Q9JLG4 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Pkd2l2Q9JLG4 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
Pkd2l2Q9JLG4 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Pkd2l2Q9JLG4 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Pkd2l2Q9JLG4 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Pkd2l2Q9JLG4 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Pkd2l2Q9JLG4 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.84
Pkd2l2Q9JLG4 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
Pkd2l2Q9JLG4 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Pkd2l2Q9JLG4 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Pkd2l2Q9JLG4 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Pkd2l2Q9JLG4 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Pkd2l2Q9JLG4 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Pkd2l2Q9JLG4 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Pkd2l2Q9JLG4 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Pkd2l2Q9JLG4 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Pkd2l2Q9JLG4 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Pkd2l2Q9JLG4 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Pkd2l2Q9JLG4 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Pkd2l2Q9JLG4 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Pkd2l2Q9JLG4 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
Pkd2l2Q9JLG4 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Pkd2l2Q9JLG4 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Pkd2l2Q9JLG4 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.93■■■□□ 2.7
Pkd2l2Q9JLG4 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Pkd2l2Q9JLG4 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Pkd2l2Q9JLG4 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Pkd2l2Q9JLG4 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
Pkd2l2Q9JLG4 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
Pkd2l2Q9JLG4 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
Pkd2l2Q9JLG4 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
Pkd2l2Q9JLG4 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
Pkd2l2Q9JLG4 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
Pkd2l2Q9JLG4 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
Pkd2l2Q9JLG4 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Pkd2l2Q9JLG4 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Pkd2l2Q9JLG4 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Pkd2l2Q9JLG4 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
Pkd2l2Q9JLG4 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Pkd2l2Q9JLG4 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Pkd2l2Q9JLG4 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Pkd2l2Q9JLG4 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Pkd2l2Q9JLG4 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
Pkd2l2Q9JLG4 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Pkd2l2Q9JLG4 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Pkd2l2Q9JLG4 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Pkd2l2Q9JLG4 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Pkd2l2Q9JLG4 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Pkd2l2Q9JLG4 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Pkd2l2Q9JLG4 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Pkd2l2Q9JLG4 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Pkd2l2Q9JLG4 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Pkd2l2Q9JLG4 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
Pkd2l2Q9JLG4 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Pkd2l2Q9JLG4 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Pkd2l2Q9JLG4 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Pkd2l2Q9JLG4 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Pkd2l2Q9JLG4 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Pkd2l2Q9JLG4 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Pkd2l2Q9JLG4 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Pkd2l2Q9JLG4 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Pkd2l2Q9JLG4 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Pkd2l2Q9JLG4 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms