RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000021380.9

Trappc6b-201, Transcript of Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trappc6b, Length 1,255 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cntnap2Q9CPW0 1332 aa26.3■■□□□ 1.8
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Dennd4aE9Q8V6 1869 aa26.3■■□□□ 1.8
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Pdzrn4E9PUZ9 1014 aa26.29■■□□□ 1.8
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Lpar1P61793 364 aa26.29■■□□□ 1.8
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Rasip1Q3U0S6 961 aa26.29■■□□□ 1.8
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ppp2r5bQ6PD28 497 aa26.29■■□□□ 1.8
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Kif1bpQ6ZPU9 617 aa26.29■■□□□ 1.8
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Onecut3Q8K557 490 aa26.29■■□□□ 1.8
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Mrpl58Q8R035 206 aa26.29■■□□□ 1.8
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ubac1Q8VDI7 409 aa26.29■■□□□ 1.8
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Snx29Q9D3S3 818 aa26.29■■□□□ 1.8
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Q9D9S1 216 aa26.29■■□□□ 1.8
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tbx20Q9ES03 445 aa26.29■■□□□ 1.8
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gpaa1Q9WTK3 621 aa26.29■■□□□ 1.8
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ccdc183A2AJB1 534 aa26.28■■□□□ 1.8
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cspp1B2RX88 1205 aa26.28■■□□□ 1.8
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gjb2Q00977 226 aa26.28■■□□□ 1.8
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Fbln1Q08879 705 aa26.28■■□□□ 1.8
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Esyt1Q3U7R1 1092 aaKnown RBP26.28■■□□□ 1.8
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Pramel7Q810Y8 479 aa26.28■■□□□ 1.8
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Bola3Q8CEI1 110 aa26.28■■□□□ 1.8
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tmem191cQ9JJB1 302 aa26.28■■□□□ 1.8
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Dclk1Q9JLM8 756 aa26.28■■□□□ 1.8
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 AW822073A0A0N4SUK1 652 aa26.27■■□□□ 1.8
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 A0A1Y7VML8 143 aa26.27■■□□□ 1.8
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Metap2O08663 478 aaKnown RBP26.27■■□□□ 1.8
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Parp1P11103 1013 aaKnown RBP26.27■■□□□ 1.8
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Irs1P35569 1233 aa26.27■■□□□ 1.8
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cln3Q61124 438 aa26.27■■□□□ 1.8
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tti2Q8BGV4 512 aa26.27■■□□□ 1.8
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Plcd3Q8K2J0 785 aa26.27■■□□□ 1.8
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Vmn1r203Q8R273 311 aa26.27■■□□□ 1.8
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Map3k20Q9ESL4 802 aaKnown RBP26.27■■□□□ 1.8
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Zkscan16A2ALW2 728 aa26.26■■□□□ 1.79
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 MycP01108 439 aa26.26■■□□□ 1.79
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 EporP14753 507 aa26.26■■□□□ 1.79
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 RarbP22605 482 aa26.26■■□□□ 1.79
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 F2rP30558 430 aa26.26■■□□□ 1.79
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Rbp3P49194 1234 aa26.26■■□□□ 1.79
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 StamP70297 548 aa26.26■■□□□ 1.79
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gdf10P97737 476 aa26.26■■□□□ 1.79
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tdp1Q8BJ37 609 aa26.26■■□□□ 1.79
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 PdgfcQ8CI19 345 aa26.26■■□□□ 1.79
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Galntl5Q9D4M9 431 aa26.26■■□□□ 1.79
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gm42715A0A087WP63 3095 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.79
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Naaladl2A0A0N4SUJ3 795 aa26.25■■□□□ 1.79
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 E030030I06RikJ3QML9 246 aa26.25■■□□□ 1.79
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cyp2e1Q05421 493 aa26.25■■□□□ 1.79
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 B230104I21RikQ3USW4 141 aa26.25■■□□□ 1.79
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ckap2Q3V1H1 664 aa26.25■■□□□ 1.79
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Rgl1Q60695 768 aa26.25■■□□□ 1.79
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Wdr43Q6ZQL4 677 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ep400Q8CHI8 3072 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Vwa3bJ9JI28 736 aa26.24■■□□□ 1.79
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Pkp1P97350 728 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Rhpn1Q61085 643 aa26.24■■□□□ 1.79
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Fam126bQ8C729 530 aa26.24■■□□□ 1.79
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Nup88Q8CEC0 753 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Kdm4bQ91VY5 1086 aa26.24■■□□□ 1.79
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 GraspQ9JJA9 392 aa26.24■■□□□ 1.79
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Kntc1Q8C3Y4 2207 aa26.23■■□□□ 1.79
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Brd9Q3UQU0 596 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Prmt6Q6NZB1 378 aa26.23■■□□□ 1.79
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 C2cd5Q7TPS5 1016 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tpcn2Q8BWC0 731 aa26.23■■□□□ 1.79
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gprc5cQ8K3J9 440 aa26.23■■□□□ 1.79
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Kiaa1024Q8K3V7 917 aa26.23■■□□□ 1.79
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 BrapQ99MP8 591 aa26.23■■□□□ 1.79
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 MthfslL7N466 203 aa26.22■■□□□ 1.79
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Guca2bO09051 106 aa26.22■■□□□ 1.79
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Limch1Q3UH68 1057 aa26.22■■□□□ 1.79
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Mybpc2Q5XKE0 1136 aa26.22■■□□□ 1.79
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Moxd2Q7TT41 619 aa26.22■■□□□ 1.79
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ttc7aQ8BGB2 858 aa26.22■■□□□ 1.79
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Plxnb3Q9QY40 1902 aa26.22■■□□□ 1.79
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gcnt4E9Q649 455 aa26.21■■□□□ 1.79
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Lnx1O70263 728 aa26.21■■□□□ 1.79
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Eif3j2Q66JS6 263 aa26.21■■□□□ 1.79
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Usp6nlQ80XC3 819 aa26.21■■□□□ 1.79
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tbc1d5Q80XQ2 815 aa26.21■■□□□ 1.79
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Phtf2Q8CB19 747 aa26.21■■□□□ 1.79
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Rtn1Q8K0T0 780 aa26.21■■□□□ 1.79
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Adgrf4Q9D2L6 698 aa26.21■■□□□ 1.79
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Slx4ipQ9D7Y9 413 aa26.21■■□□□ 1.79
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Capn10Q9ESK3 666 aa26.21■■□□□ 1.79
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Trap1aP19473 224 aa26.2■■□□□ 1.78
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ppp4r2Q0VGB7 417 aa26.2■■□□□ 1.78
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Jakmip3Q5DTN8 844 aa26.2■■□□□ 1.78
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Mcph1Q7TT79 822 aa26.2■■□□□ 1.78
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gpc2Q8BKV1 579 aa26.2■■□□□ 1.78
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cep89Q9CZX2 791 aa26.2■■□□□ 1.78
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cul5Q9D5V5 780 aa26.2■■□□□ 1.78
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ftsj3Q9DBE9 838 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.78
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Psmd10Q9Z2X2 231 aa26.2■■□□□ 1.78
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Wdr19Q3UGF1 1341 aa26.19■■□□□ 1.78
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Hoxa13Q62424 386 aa26.19■■□□□ 1.78
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Btbd7Q8CFE5 1130 aa26.19■■□□□ 1.78
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Rcan1Q9JHG6 198 aa26.19■■□□□ 1.78
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Msgn1Q9JK54 188 aa26.19■■□□□ 1.78
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Phactr2B1AVP0 632 aa26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 14.3 ms