Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZB1

Prmt6, Protein arginine N-methyltransferase 6, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prmt6Q6NZB1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC43.87■■■■■ 4.61
Prmt6Q6NZB1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
Prmt6Q6NZB1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
Prmt6Q6NZB1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC38.13■■■■□ 3.69
Prmt6Q6NZB1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC38.05■■■■□ 3.68
Prmt6Q6NZB1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
Prmt6Q6NZB1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Prmt6Q6NZB1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Prmt6Q6NZB1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Prmt6Q6NZB1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC36.57■■■■□ 3.44
Prmt6Q6NZB1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Prmt6Q6NZB1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Prmt6Q6NZB1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Prmt6Q6NZB1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC35.7■■■■□ 3.31
Prmt6Q6NZB1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Prmt6Q6NZB1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC35.39■■■■□ 3.26
Prmt6Q6NZB1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
Prmt6Q6NZB1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
Prmt6Q6NZB1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC35.23■■■■□ 3.23
Prmt6Q6NZB1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Prmt6Q6NZB1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Prmt6Q6NZB1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Prmt6Q6NZB1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Prmt6Q6NZB1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Prmt6Q6NZB1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
Prmt6Q6NZB1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
Prmt6Q6NZB1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Prmt6Q6NZB1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Prmt6Q6NZB1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
Prmt6Q6NZB1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Prmt6Q6NZB1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Prmt6Q6NZB1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Prmt6Q6NZB1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
Prmt6Q6NZB1 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Prmt6Q6NZB1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Prmt6Q6NZB1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Prmt6Q6NZB1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Prmt6Q6NZB1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Prmt6Q6NZB1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Prmt6Q6NZB1 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Prmt6Q6NZB1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Prmt6Q6NZB1 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Prmt6Q6NZB1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
Prmt6Q6NZB1 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
Prmt6Q6NZB1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
Prmt6Q6NZB1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Prmt6Q6NZB1 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Prmt6Q6NZB1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Prmt6Q6NZB1 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Prmt6Q6NZB1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Prmt6Q6NZB1 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
Prmt6Q6NZB1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Prmt6Q6NZB1 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Prmt6Q6NZB1 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
Prmt6Q6NZB1 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Prmt6Q6NZB1 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Prmt6Q6NZB1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Prmt6Q6NZB1 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Prmt6Q6NZB1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Prmt6Q6NZB1 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
Prmt6Q6NZB1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Prmt6Q6NZB1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Prmt6Q6NZB1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Prmt6Q6NZB1 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Prmt6Q6NZB1 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Prmt6Q6NZB1 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Prmt6Q6NZB1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Prmt6Q6NZB1 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
Prmt6Q6NZB1 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Prmt6Q6NZB1 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Prmt6Q6NZB1 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Prmt6Q6NZB1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Prmt6Q6NZB1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Prmt6Q6NZB1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Prmt6Q6NZB1 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Prmt6Q6NZB1 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Prmt6Q6NZB1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Prmt6Q6NZB1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Prmt6Q6NZB1 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Prmt6Q6NZB1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Prmt6Q6NZB1 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Prmt6Q6NZB1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Prmt6Q6NZB1 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Prmt6Q6NZB1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Prmt6Q6NZB1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Prmt6Q6NZB1 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Prmt6Q6NZB1 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
Prmt6Q6NZB1 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Prmt6Q6NZB1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Prmt6Q6NZB1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Prmt6Q6NZB1 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
Prmt6Q6NZB1 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC31.72■■■□□ 2.67
Prmt6Q6NZB1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Prmt6Q6NZB1 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Prmt6Q6NZB1 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
Prmt6Q6NZB1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Prmt6Q6NZB1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Prmt6Q6NZB1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Prmt6Q6NZB1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Prmt6Q6NZB1 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 174 ms