Protein–RNA interactions for Protein: Q5XKE0

Mybpc2, Myosin-binding protein C, fast-type, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mybpc2Q5XKE0 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC43.83■■■■■ 4.61
Mybpc2Q5XKE0 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
Mybpc2Q5XKE0 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
Mybpc2Q5XKE0 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC38.08■■■■□ 3.69
Mybpc2Q5XKE0 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC38.04■■■■□ 3.68
Mybpc2Q5XKE0 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC37.15■■■■□ 3.54
Mybpc2Q5XKE0 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Mybpc2Q5XKE0 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
Mybpc2Q5XKE0 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Mybpc2Q5XKE0 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
Mybpc2Q5XKE0 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Mybpc2Q5XKE0 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Mybpc2Q5XKE0 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Mybpc2Q5XKE0 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
Mybpc2Q5XKE0 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Mybpc2Q5XKE0 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC35.34■■■■□ 3.25
Mybpc2Q5XKE0 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
Mybpc2Q5XKE0 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC35.18■■■■□ 3.22
Mybpc2Q5XKE0 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Mybpc2Q5XKE0 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
Mybpc2Q5XKE0 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Mybpc2Q5XKE0 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Mybpc2Q5XKE0 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Mybpc2Q5XKE0 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Mybpc2Q5XKE0 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
Mybpc2Q5XKE0 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
Mybpc2Q5XKE0 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
Mybpc2Q5XKE0 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Mybpc2Q5XKE0 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Mybpc2Q5XKE0 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Mybpc2Q5XKE0 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Mybpc2Q5XKE0 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Mybpc2Q5XKE0 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Mybpc2Q5XKE0 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
Mybpc2Q5XKE0 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Mybpc2Q5XKE0 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Mybpc2Q5XKE0 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Mybpc2Q5XKE0 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Mybpc2Q5XKE0 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Mybpc2Q5XKE0 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Mybpc2Q5XKE0 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Mybpc2Q5XKE0 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Mybpc2Q5XKE0 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Mybpc2Q5XKE0 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
Mybpc2Q5XKE0 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
Mybpc2Q5XKE0 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
Mybpc2Q5XKE0 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Mybpc2Q5XKE0 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Mybpc2Q5XKE0 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Mybpc2Q5XKE0 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Mybpc2Q5XKE0 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Mybpc2Q5XKE0 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
Mybpc2Q5XKE0 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
Mybpc2Q5XKE0 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Mybpc2Q5XKE0 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Mybpc2Q5XKE0 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Mybpc2Q5XKE0 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Mybpc2Q5XKE0 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.82
Mybpc2Q5XKE0 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Mybpc2Q5XKE0 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Mybpc2Q5XKE0 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
Mybpc2Q5XKE0 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Mybpc2Q5XKE0 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Mybpc2Q5XKE0 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Mybpc2Q5XKE0 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Mybpc2Q5XKE0 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Mybpc2Q5XKE0 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Mybpc2Q5XKE0 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
Mybpc2Q5XKE0 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Mybpc2Q5XKE0 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Mybpc2Q5XKE0 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Mybpc2Q5XKE0 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Mybpc2Q5XKE0 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Mybpc2Q5XKE0 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Mybpc2Q5XKE0 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Mybpc2Q5XKE0 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Mybpc2Q5XKE0 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Mybpc2Q5XKE0 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Mybpc2Q5XKE0 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Mybpc2Q5XKE0 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Mybpc2Q5XKE0 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Mybpc2Q5XKE0 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Mybpc2Q5XKE0 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Mybpc2Q5XKE0 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Mybpc2Q5XKE0 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Mybpc2Q5XKE0 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Mybpc2Q5XKE0 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.86■■■□□ 2.69
Mybpc2Q5XKE0 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Mybpc2Q5XKE0 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
Mybpc2Q5XKE0 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Mybpc2Q5XKE0 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
Mybpc2Q5XKE0 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.67
Mybpc2Q5XKE0 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.65
Mybpc2Q5XKE0 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Mybpc2Q5XKE0 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Mybpc2Q5XKE0 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Mybpc2Q5XKE0 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Mybpc2Q5XKE0 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Mybpc2Q5XKE0 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Mybpc2Q5XKE0 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms