Protein–RNA interactions for Protein: P01108

Myc, Myc proto-oncogene protein, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MycP01108 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC44.35■■■■■ 4.69
MycP01108 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
MycP01108 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
MycP01108 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC38.84■■■■□ 3.81
MycP01108 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC38.11■■■■□ 3.69
MycP01108 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
MycP01108 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
MycP01108 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
MycP01108 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC37.13■■■■□ 3.53
MycP01108 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
MycP01108 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC36.91■■■■□ 3.5
MycP01108 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
MycP01108 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
MycP01108 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC36.04■■■■□ 3.36
MycP01108 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
MycP01108 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
MycP01108 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
MycP01108 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
MycP01108 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC35.27■■■■□ 3.24
MycP01108 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
MycP01108 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
MycP01108 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
MycP01108 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
MycP01108 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
MycP01108 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
MycP01108 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
MycP01108 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
MycP01108 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
MycP01108 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
MycP01108 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
MycP01108 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
MycP01108 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
MycP01108 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
MycP01108 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
MycP01108 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
MycP01108 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
MycP01108 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
MycP01108 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
MycP01108 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
MycP01108 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
MycP01108 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
MycP01108 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
MycP01108 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
MycP01108 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
MycP01108 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
MycP01108 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
MycP01108 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
MycP01108 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
MycP01108 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
MycP01108 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
MycP01108 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
MycP01108 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
MycP01108 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
MycP01108 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
MycP01108 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
MycP01108 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
MycP01108 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
MycP01108 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
MycP01108 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
MycP01108 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
MycP01108 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC32.6■■■□□ 2.81
MycP01108 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
MycP01108 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
MycP01108 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
MycP01108 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
MycP01108 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
MycP01108 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
MycP01108 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
MycP01108 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
MycP01108 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
MycP01108 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
MycP01108 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
MycP01108 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
MycP01108 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
MycP01108 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
MycP01108 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
MycP01108 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
MycP01108 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
MycP01108 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
MycP01108 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
MycP01108 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
MycP01108 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
MycP01108 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
MycP01108 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
MycP01108 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.67
MycP01108 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
MycP01108 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
MycP01108 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
MycP01108 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
MycP01108 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
MycP01108 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
MycP01108 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
MycP01108 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
MycP01108 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
MycP01108 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
MycP01108 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
MycP01108 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
MycP01108 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
MycP01108 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
MycP01108 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms