Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK3

Capn10, Calpain-10, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn10Q9ESK3 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC44.29■■■■■ 4.68
Capn10Q9ESK3 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
Capn10Q9ESK3 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
Capn10Q9ESK3 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC38.73■■■■□ 3.79
Capn10Q9ESK3 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC38■■■■□ 3.67
Capn10Q9ESK3 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Capn10Q9ESK3 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
Capn10Q9ESK3 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Capn10Q9ESK3 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC37.06■■■■□ 3.52
Capn10Q9ESK3 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Capn10Q9ESK3 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC36.89■■■■□ 3.5
Capn10Q9ESK3 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
Capn10Q9ESK3 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
Capn10Q9ESK3 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Capn10Q9ESK3 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC35.95■■■■□ 3.35
Capn10Q9ESK3 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Capn10Q9ESK3 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Capn10Q9ESK3 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Capn10Q9ESK3 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
Capn10Q9ESK3 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC35.25■■■■□ 3.23
Capn10Q9ESK3 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
Capn10Q9ESK3 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Capn10Q9ESK3 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Capn10Q9ESK3 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Capn10Q9ESK3 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Capn10Q9ESK3 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Capn10Q9ESK3 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.09
Capn10Q9ESK3 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Capn10Q9ESK3 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
Capn10Q9ESK3 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.03
Capn10Q9ESK3 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Capn10Q9ESK3 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Capn10Q9ESK3 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Capn10Q9ESK3 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Capn10Q9ESK3 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
Capn10Q9ESK3 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
Capn10Q9ESK3 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Capn10Q9ESK3 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Capn10Q9ESK3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
Capn10Q9ESK3 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
Capn10Q9ESK3 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Capn10Q9ESK3 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Capn10Q9ESK3 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Capn10Q9ESK3 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Capn10Q9ESK3 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Capn10Q9ESK3 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Capn10Q9ESK3 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Capn10Q9ESK3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
Capn10Q9ESK3 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
Capn10Q9ESK3 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
Capn10Q9ESK3 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Capn10Q9ESK3 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
Capn10Q9ESK3 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Capn10Q9ESK3 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Capn10Q9ESK3 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Capn10Q9ESK3 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Capn10Q9ESK3 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Capn10Q9ESK3 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Capn10Q9ESK3 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Capn10Q9ESK3 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Capn10Q9ESK3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Capn10Q9ESK3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Capn10Q9ESK3 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Capn10Q9ESK3 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Capn10Q9ESK3 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Capn10Q9ESK3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Capn10Q9ESK3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Capn10Q9ESK3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Capn10Q9ESK3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Capn10Q9ESK3 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Capn10Q9ESK3 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Capn10Q9ESK3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
Capn10Q9ESK3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
Capn10Q9ESK3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Capn10Q9ESK3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Capn10Q9ESK3 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
Capn10Q9ESK3 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Capn10Q9ESK3 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Capn10Q9ESK3 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
Capn10Q9ESK3 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Capn10Q9ESK3 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
Capn10Q9ESK3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
Capn10Q9ESK3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Capn10Q9ESK3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Capn10Q9ESK3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
Capn10Q9ESK3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Capn10Q9ESK3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
Capn10Q9ESK3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Capn10Q9ESK3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Capn10Q9ESK3 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Capn10Q9ESK3 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Capn10Q9ESK3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Capn10Q9ESK3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Capn10Q9ESK3 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Capn10Q9ESK3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Capn10Q9ESK3 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Capn10Q9ESK3 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
Capn10Q9ESK3 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Capn10Q9ESK3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Capn10Q9ESK3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms