RNA–Protein interactions for RNA: YPR179C

HDA3, Transcript of Subunit of the HDA1 histone deacetylase complex, yeastyeast

Gene HDA3, Length 1,968 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HDA3YPR179C UPF3P48412 387 aaKnown RBP1.9□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C LYS4P49367 693 aaPredicted RBP1.9□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C DUO1P53168 247 aaKnown RBP1.9□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C RPM2Q02773 1202 aa1.9□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C HUA2Q12134 243 aa1.9□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C TIP41Q12199 356 aa1.9□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C INP53Q12271 1107 aa1.9□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C SEM1O94742 89 aa1.9□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C RPB8P20436 146 aa1.9□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C PWP1P21304 576 aaKnown RBP1.9□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C VMA16P23968 213 aa1.9□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C CPR3P25719 182 aa1.9□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C SNU114P36048 1008 aaKnown RBP1.9□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C AUR1P36107 401 aaPredicted RBP1.9□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C ERG7P38604 731 aa1.9□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C DIA4P38705 446 aaPredicted RBP1.9□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C UIP3P39547 235 aa1.9□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C SMC3P47037 1230 aa1.9□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C ZDS2P54786 942 aa1.9□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C TMA64Q04600 565 aaKnown RBP1.9□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C ADE13Q05911 482 aaKnown RBP1.9□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C YDL218WQ07629 317 aa1.9□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C PDA1P16387 420 aaKnown RBP1.89□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C KAR3P17119 729 aa1.89□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C SPE2P21182 396 aa1.89□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C LCB1P25045 558 aaKnown RBP1.89□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C POL4P25615 582 aa1.89□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C TRS65P32893 560 aa1.89□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C YKL050CP35736 922 aa1.89□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C AGP2P38090 596 aa1.89□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C YHR218WP38899 603 aa1.89□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C NAB3P38996 802 aaKnown RBP RIP-Chip data1.89□□□□□ -2.11not detected
HDA3YPR179C DIA3P52290 468 aa1.89□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C BOR1P53838 576 aa1.89□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C VPS72Q03388 795 aa1.89□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C SMA2Q04658 369 aa1.89□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C ATG26Q06321 1198 aa1.89□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C APL4Q12028 832 aa1.89□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C RRI2Q12348 645 aa1.89□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C CSR2Q12734 1121 aa1.89□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C SEC53P07283 254 aaKnown RBP1.89□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C IMP2'P32351 346 aa1.89□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C ERG1P32476 496 aaKnown RBP1.89□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C SAC6P32599 642 aaKnown RBP1.89□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C UBA4P38820 440 aa1.89□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C ANS1P38832 159 aa1.89□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C AZF1P41696 914 aa1.89□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C STR3P53101 465 aaKnown RBP1.89□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C LCL3P53153 274 aa1.89□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C NGL3Q03210 505 aa1.89□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C YML037CQ03703 340 aa1.89□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C RSA1Q08932 381 aa1.89□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C PPT2Q12036 173 aa1.89□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C SPE4Q12455 300 aa1.89□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C NOP58Q12499 511 aaKnown RBP1.89□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C ARD1P07347 238 aaPredicted RBP1.88□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C ADH7P25377 361 aa1.88□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C PGS1P25578 521 aa1.88□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C PHD1P36093 366 aa1.88□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C MIC60P36112 540 aa1.88□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C STV1P37296 890 aa1.88□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C AVT5P38176 459 aa1.88□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C ELO1P39540 310 aa1.88□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C DSD1P53095 428 aa1.88□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C SOL4P53315 255 aa1.88□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C BUD22Q04347 519 aaKnown RBP1.88□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C EMI2Q04409 500 aaKnown RBP1.88□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C DPB4Q04603 196 aaKnown RBP1.88□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C YPL272CQ08984 517 aa1.88□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C LEU9Q12166 604 aaKnown RBP1.88□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C MED1Q12321 566 aa1.88□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C SGF29P25554 259 aa1.87□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C YIH1P25637 258 aa1.87□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C BUD14P27637 709 aa1.87□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C NOP4P37838 685 aaKnown RBP1.87□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C TSC10P38342 320 aa1.87□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C MDM31P38880 579 aa1.87□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C FLC2P39719 783 aa1.87□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C AFG3P39925 761 aa1.87□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C SGM1P47166 707 aa1.87□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C YDL186WP48568 277 aa1.87□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C COS10P52924 374 aa1.87□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C EFM6P53970 246 aa1.87□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C YDR415CQ04033 374 aaPredicted RBP1.87□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C ERP1Q05359 219 aaKnown RBP1.87□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C IMH1Q06704 911 aaKnown RBP1.87□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C LUC7Q07508 261 aaPredicted RBP1.87□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C GRC3Q07845 632 aa1.87□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C TEN1Q07921 160 aa1.87□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C NMD4Q12129 218 aa1.87□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C ARP6Q12509 438 aa1.87□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C MF(ALPHA)1P01149 165 aa1.87□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C RPL15AP05748 204 aaKnown RBP1.87□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C CBS2P14905 389 aa1.87□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C MET8P15807 274 aa1.87□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C KGD1P20967 1014 aaKnown RBP1.87□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C OLE1P21147 510 aaKnown RBP1.87□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C PRO3P32263 286 aaKnown RBP1.87□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C RPN12P32496 274 aa1.87□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C DBP8P38719 431 aa1.87□□□□□ -2.11
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