RNA–Protein interactions for RNA: YNR061C

YNR061C, Transcript of Protein of unknown function, yeast

Gene YNR061C, Length 660 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNR061C	YNR061C	SPE4	Q12455	300 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YNR061C	YNR061C	COX1	P00401	534 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNR061C	YNR061C	AMD2	P22580	549 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNR061C	YNR061C	VMA16	P23968	213 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNR061C	YNR061C	ECM32	P32644	1121 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YNR061C	YNR061C	HES1	P35843	434 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNR061C	YNR061C	PTK1	P36002	662 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YNR061C	YNR061C	GMH1	P36125	273 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNR061C	YNR061C	YPT10	P38146	199 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNR061C	YNR061C	VID24	P38263	362 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNR061C	YNR061C	CBR1	P38626	284 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YNR061C	YNR061C	AFG3	P39925	761 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNR061C	YNR061C	NDC80	P40460	691 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNR061C	YNR061C	HYR1	P40581	163 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YNR061C	YNR061C	PMT6	P42934	759 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNR061C	YNR061C	STR3	P53101	465 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YNR061C	YNR061C	LCL3	P53153	274 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNR061C	YNR061C	JJJ1	P53863	590 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNR061C	YNR061C	CIK1	Q01649	594 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNR061C	YNR061C	YML119W	Q03208	357 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNR061C	YNR061C	GFD1	Q04839	188 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YNR061C	YNR061C	SWA2	Q06677	668 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNR061C	YNR061C	YPT6	Q99260	215 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNR061C	YNR061C	AI5_ALPHA	Q9ZZX1	630 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNR061C	YNR061C	SES1	P07284	462 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YNR061C	YNR061C	SNF3	P10870	884 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNR061C	YNR061C	ADK2	P26364	225 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNR061C	YNR061C	GPI10	P30777	616 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNR061C	YNR061C	RPS0A	P32905	252 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YNR061C	YNR061C	SKI2	P35207	1287 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.58	□□□□□ -1.68	not detected
YNR061C	YNR061C	ERC1	P38767	581 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNR061C	YNR061C	SSU1	P41930	458 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNR061C	YNR061C	IRC8	P47046	822 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNR061C	YNR061C	MSY1	P48527	492 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNR061C	YNR061C	VID30	P53076	958 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNR061C	YNR061C	COG2	P53271	262 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNR061C	YNR061C	OGG1	P53397	376 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YNR061C	YNR061C	HST1	P53685	503 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNR061C	YNR061C	YNL092W	P53934	400 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNR061C	YNR061C	SMX3	P54999	86 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YNR061C	YNR061C	LGE1	Q02796	332 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YNR061C	YNR061C	YDR179W-A	Q03983	463 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNR061C	YNR061C	YDR109C	Q04585	715 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNR061C	YNR061C	ARG7	Q04728	441 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNR061C	YNR061C	BUD7	Q08754	746 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNR061C	YNR061C	YPL150W	Q12152	901 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNR061C	YNR061C	ARD1	P07347	238 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YNR061C	YNR061C	ILS1	P09436	1072 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YNR061C	YNR061C	MATALPHA2	P0CY08	210 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YNR061C	YNR061C	HMLALPHA2	P0CY09	210 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YNR061C	YNR061C	WHI2	P12611	486 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YNR061C	YNR061C	TPM1	P17536	199 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YNR061C	YNR061C	REC107	P21651	314 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YNR061C	YNR061C	YSP3	P25036	478 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YNR061C	YNR061C	ICL1	P28240	557 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YNR061C	YNR061C	LAC1	P28496	418 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YNR061C	YNR061C	CUE2	P36075	443 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YNR061C	YNR061C	NTR2	P36118	322 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YNR061C	YNR061C	GLG1	P36143	616 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YNR061C	YNR061C	OTU2	P38747	307 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YNR061C	YNR061C	PCL5	P38794	229 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YNR061C	YNR061C	SEC31	P38968	1273 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YNR061C	YNR061C	SWP82	P43554	623 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YNR061C	YNR061C	COQ6	P53318	479 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YNR061C	YNR061C	AAT1	Q01802	451 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YNR061C	YNR061C	PRP42	Q03776	544 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YNR061C	YNR061C	YML053C	Q04978	212 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YNR061C	YNR061C	VPS38	Q05919	439 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YNR061C	YNR061C	ECM22	Q05958	814 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YNR061C	YNR061C	YPL191C	Q08930	360 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YNR061C	YNR061C	YPL272C	Q08984	517 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YNR061C	YNR061C	ZPS1	Q12512	249 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YNR061C	YNR061C	YOL159C-A	Q3E769	90 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YNR061C	YNR061C	RNR3	P21672	869 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YNR061C	YNR061C	MRPL9	P31334	269 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YNR061C	YNR061C	SOF1	P33750	489 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YNR061C	YNR061C	SAS3	P34218	831 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YNR061C	YNR061C	MYO3	P36006	1272 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YNR061C	YNR061C	CST26	P38226	397 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YNR061C	YNR061C	YHL017W	P38745	532 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YNR061C	YNR061C	CCT6	P39079	546 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YNR061C	YNR061C	PHM8	P40025	321 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YNR061C	YNR061C	MRX1	P40050	688 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YNR061C	YNR061C	BUR6	P40096	142 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YNR061C	YNR061C	LTP1	P40347	161 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YNR061C	YNR061C	CTK2	P46962	323 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YNR061C	YNR061C	SGF73	P53165	657 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YNR061C	YNR061C	ARP5	P53946	755 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YNR061C	YNR061C	UBX2	Q04228	584 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YNR061C	YNR061C	ERB1	Q04660	807 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YNR061C	YNR061C	YLR345W	Q06137	509 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YNR061C	YNR061C	MRN1	Q08925	612 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.56	□□□□□ -1.68	not detected
YNR061C	YNR061C	FMP40	Q08968	688 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YNR061C	YNR061C	ATG29	Q12092	213 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YNR061C	YNR061C	LCB4	Q12246	624 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YNR061C	YNR061C	AVL9	Q12500	764 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YNR061C	YNR061C	CPA2	P03965	1118 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
YNR061C	YNR061C	HXK2	P04807	486 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
YNR061C	YNR061C	STE50	P25344	346 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YNR061C	YNR061C	ADH7	P25377	361 aa		4.55	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 50.2 ms