RNA–Protein interactions for RNA: YMR001C-A

YMR001C-A, Transcript of Putative protein of unknown function, yeastyeast

Gene YMR001C-A, Length 231 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YMR001C-AYMR001C-A RRT6P53117 311 aaPredicted RBP2.57□□□□□ -2
YMR001C-AYMR001C-A WSC2P53832 503 aa2.57□□□□□ -2
YMR001C-AYMR001C-A ZDS2P54786 942 aa2.57□□□□□ -2
YMR001C-AYMR001C-A MRPL13Q02204 264 aa2.57□□□□□ -2
YMR001C-AYMR001C-A RLI1Q03195 608 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
YMR001C-AYMR001C-A YCL021W-AQ96VH3 125 aa2.57□□□□□ -2
YMR001C-AYMR001C-A SPE2P21182 396 aa2.56□□□□□ -2
YMR001C-AYMR001C-A UBC1P21734 215 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
YMR001C-AYMR001C-A GRX7P38068 203 aa2.56□□□□□ -2
YMR001C-AYMR001C-A YBP1P38315 674 aa2.56□□□□□ -2
YMR001C-AYMR001C-A LAG1P38703 411 aa2.56□□□□□ -2
YMR001C-AYMR001C-A BUR6P40096 142 aa2.56□□□□□ -2
YMR001C-AYMR001C-A TFC6Q06339 672 aa2.56□□□□□ -2
YMR001C-AYMR001C-A YBR085C-AO43137 85 aa2.55□□□□□ -2
YMR001C-AYMR001C-A PUT2P07275 575 aa2.55□□□□□ -2
YMR001C-AYMR001C-A YEF3P16521 1044 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
YMR001C-AYMR001C-A MSM1P22438 575 aa2.55□□□□□ -2
YMR001C-AYMR001C-A YEL045CP32616 141 aa2.55□□□□□ -2
YMR001C-AYMR001C-A TSC10P38342 320 aa2.55□□□□□ -2
YMR001C-AYMR001C-A MTC6P38849 526 aa2.55□□□□□ -2
YMR001C-AYMR001C-A NPR2P39923 615 aa2.55□□□□□ -2
YMR001C-AYMR001C-A ACA1P39970 489 aa2.55□□□□□ -2
YMR001C-AYMR001C-A YVH1Q02256 364 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
YMR001C-AYMR001C-A YMR160WQ03823 816 aa2.55□□□□□ -2
YMR001C-AYMR001C-A NYV1Q12255 253 aa2.55□□□□□ -2
YMR001C-AYMR001C-A ARG81P05085 880 aa2.54□□□□□ -2
YMR001C-AYMR001C-A MTF2P10849 440 aa2.54□□□□□ -2
YMR001C-AYMR001C-A RER1P25560 188 aa2.54□□□□□ -2
YMR001C-AYMR001C-A DBP8P38719 431 aa2.54□□□□□ -2
YMR001C-AYMR001C-A UIP3P39547 235 aa2.54□□□□□ -2
YMR001C-AYMR001C-A RPS7BP48164 190 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
YMR001C-AYMR001C-A SMM1P53720 384 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
YMR001C-AYMR001C-A RSM23Q01163 450 aa2.54□□□□□ -2
YMR001C-AYMR001C-A ECM30Q06673 1274 aa2.54□□□□□ -2
YMR001C-AYMR001C-A PMR1P13586 950 aa2.53□□□□□ -2
YMR001C-AYMR001C-A PMU1P36069 295 aa2.53□□□□□ -2
YMR001C-AYMR001C-A TUL1P36096 758 aa2.53□□□□□ -2
YMR001C-AYMR001C-A PTH1P38876 190 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
YMR001C-AYMR001C-A ELO1P39540 310 aa2.53□□□□□ -2
YMR001C-AYMR001C-A SMK1P41808 388 aa2.53□□□□□ -2
YMR001C-AYMR001C-A VPS4P52917 437 aa2.53□□□□□ -2
YMR001C-AYMR001C-A INN1P53901 409 aa2.53□□□□□ -2
YMR001C-AYMR001C-A GLO2Q05584 274 aa2.53□□□□□ -2
YMR001C-AYMR001C-A YLR302CO13544 120 aa2.52□□□□□ -2.01
YMR001C-AYMR001C-A ATP4P05626 244 aa2.52□□□□□ -2.01
YMR001C-AYMR001C-A APE1P14904 514 aa2.52□□□□□ -2.01
YMR001C-AYMR001C-A SAC6P32599 642 aaKnown RBP2.52□□□□□ -2.01
YMR001C-AYMR001C-A RFS1P38234 210 aaKnown RBP2.52□□□□□ -2.01
YMR001C-AYMR001C-A DIA4P38705 446 aaPredicted RBP2.52□□□□□ -2.01
YMR001C-AYMR001C-A OSH3P38713 996 aaKnown RBP2.52□□□□□ -2.01
YMR001C-AYMR001C-A CSM2P40465 213 aa2.52□□□□□ -2.01
YMR001C-AYMR001C-A SGM1P47166 707 aa2.52□□□□□ -2.01
YMR001C-AYMR001C-A RHO4Q00246 291 aa2.52□□□□□ -2.01
YMR001C-AYMR001C-A TMC1Q08422 150 aaPredicted RBP2.52□□□□□ -2.01
YMR001C-AYMR001C-A HNT3Q08702 217 aa2.52□□□□□ -2.01
YMR001C-AYMR001C-A NUS1Q12063 375 aa2.52□□□□□ -2.01
YMR001C-AYMR001C-A YER078W-AQ3E7A2 54 aa2.52□□□□□ -2.01
YMR001C-AYMR001C-A AMD1P15274 810 aaKnown RBP2.51□□□□□ -2.01
YMR001C-AYMR001C-A HXT1P32465 570 aa2.51□□□□□ -2.01
YMR001C-AYMR001C-A MTR2P34232 184 aaKnown RBP2.51□□□□□ -2.01
YMR001C-AYMR001C-A ERG26P53199 349 aaKnown RBP2.51□□□□□ -2.01
YMR001C-AYMR001C-A PIL1P53252 339 aaKnown RBP2.51□□□□□ -2.01
YMR001C-AYMR001C-A BLS1Q06071 122 aa2.51□□□□□ -2.01
YMR001C-AYMR001C-A SYO1Q07395 620 aa2.51□□□□□ -2.01
YMR001C-AYMR001C-A RTT109Q07794 436 aa2.51□□□□□ -2.01
YMR001C-AYMR001C-A TEN1Q07921 160 aa2.51□□□□□ -2.01
YMR001C-AYMR001C-A YOR387CQ08910 206 aa2.51□□□□□ -2.01
YMR001C-AYMR001C-A TRM8Q12009 286 aa2.51□□□□□ -2.01
YMR001C-AYMR001C-A NKP1Q12493 238 aa2.51□□□□□ -2.01
YMR001C-AYMR001C-A CAR1P00812 333 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
YMR001C-AYMR001C-A PFK2P16862 959 aaKnown RBP RIP-Chip data2.5□□□□□ -2.01not detected
YMR001C-AYMR001C-A NAM9P27929 486 aa2.5□□□□□ -2.01
YMR001C-AYMR001C-A FUN19P28003 413 aaPredicted RBP2.5□□□□□ -2.01
YMR001C-AYMR001C-A TEF4P36008 412 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
YMR001C-AYMR001C-A SHO1P40073 367 aa2.5□□□□□ -2.01
YMR001C-AYMR001C-A BUD32P53323 261 aa2.5□□□□□ -2.01
YMR001C-AYMR001C-A DUG3P53871 357 aa2.5□□□□□ -2.01
YMR001C-AYMR001C-A PAL1Q05518 499 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
YMR001C-AYMR001C-A SKG3Q06315 1026 aa2.5□□□□□ -2.01
YMR001C-AYMR001C-A TOM20P35180 183 aa2.49□□□□□ -2.01
YMR001C-AYMR001C-A ALY1P36117 915 aa2.49□□□□□ -2.01
YMR001C-AYMR001C-A KTR3P38130 404 aaPredicted RBP2.49□□□□□ -2.01
YMR001C-AYMR001C-A SLZ1P40167 298 aa2.49□□□□□ -2.01
YMR001C-AYMR001C-A RIC1P40395 1056 aa2.49□□□□□ -2.01
YMR001C-AYMR001C-A BNA1P47096 177 aa2.49□□□□□ -2.01
YMR001C-AYMR001C-A TIS11P47977 285 aa2.49□□□□□ -2.01
YMR001C-AYMR001C-A MSO1P53604 210 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
YMR001C-AYMR001C-A APJ1P53940 528 aa2.49□□□□□ -2.01
YMR001C-AYMR001C-A INA17Q02888 182 aa2.49□□□□□ -2.01
YMR001C-AYMR001C-A MUB1Q03162 620 aa2.49□□□□□ -2.01
YMR001C-AYMR001C-A YDL009CQ12210 107 aa2.49□□□□□ -2.01
YMR001C-AYMR001C-A ATR1P13090 542 aa2.48□□□□□ -2.01
YMR001C-AYMR001C-A PWP1P21304 576 aaKnown RBP2.48□□□□□ -2.01
YMR001C-AYMR001C-A FRE1P32791 686 aa2.48□□□□□ -2.01
YMR001C-AYMR001C-A CNS1P33313 385 aa2.48□□□□□ -2.01
YMR001C-AYMR001C-A SCD6P45978 349 aaKnown RBP RIP-Chip data2.48□□□□□ -2.01not detected
YMR001C-AYMR001C-A DIA3P52290 468 aa2.48□□□□□ -2.01
YMR001C-AYMR001C-A LEU9Q12166 604 aaKnown RBP2.48□□□□□ -2.01
YMR001C-AYMR001C-A RPB2P08518 1224 aaKnown RBP2.47□□□□□ -2.01
YMR001C-AYMR001C-A YIM1P28625 365 aa2.47□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 12 ms