RNA–Protein interactions for RNA: YLR224W

YLR224W, Transcript of F-box protein and component of SCF ubiquitin ligase complexes, yeast

Gene YLR224W, Length 1,110 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YLR224W	YLR224W	PHD1	P36093	366 aa		2.97	□□□□□ -1.93
YLR224W	YLR224W	AUR1	P36107	401 aa	Predicted RBP	2.97	□□□□□ -1.93
YLR224W	YLR224W	MIC60	P36112	540 aa		2.97	□□□□□ -1.93
YLR224W	YLR224W	ERG7	P38604	731 aa		2.97	□□□□□ -1.93
YLR224W	YLR224W	RPS10B	P46784	105 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
YLR224W	YLR224W	ATG27	P46989	271 aa		2.97	□□□□□ -1.93
YLR224W	YLR224W	PYK2	P52489	506 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
YLR224W	YLR224W	DUO1	P53168	247 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
YLR224W	YLR224W	EFM6	P53970	246 aa		2.97	□□□□□ -1.93
YLR224W	YLR224W	BUD22	Q04347	519 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
YLR224W	YLR224W	ECM30	Q06673	1274 aa		2.97	□□□□□ -1.93
YLR224W	YLR224W	TEN1	Q07921	160 aa		2.97	□□□□□ -1.93
YLR224W	YLR224W	RPS10A	Q08745	105 aa	Predicted RBP	2.97	□□□□□ -1.93
YLR224W	YLR224W	YPL272C	Q08984	517 aa		2.97	□□□□□ -1.93
YLR224W	YLR224W	YDR056C	Q12025	205 aa		2.97	□□□□□ -1.93
YLR224W	YLR224W	MF(ALPHA)1	P01149	165 aa		2.96	□□□□□ -1.94
YLR224W	YLR224W	TOP1	P04786	769 aa		2.96	□□□□□ -1.94
YLR224W	YLR224W	SNF3	P10870	884 aa		2.96	□□□□□ -1.94
YLR224W	YLR224W	BAR1	P12630	587 aa		2.96	□□□□□ -1.94
YLR224W	YLR224W	YCK1	P23291	538 aa		2.96	□□□□□ -1.94
YLR224W	YLR224W	BUD5	P25300	642 aa	Predicted RBP	2.96	□□□□□ -1.94
YLR224W	YLR224W	BOS1	P25385	244 aa		2.96	□□□□□ -1.94
YLR224W	YLR224W	PUP3	P25451	205 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
YLR224W	YLR224W	PPZ1	P26570	692 aa		2.96	□□□□□ -1.94
YLR224W	YLR224W	SNC1	P31109	117 aa		2.96	□□□□□ -1.94
YLR224W	YLR224W	YBL055C	P34220	418 aa	Predicted RBP	2.96	□□□□□ -1.94
YLR224W	YLR224W	YKL100C	P34248	587 aa		2.96	□□□□□ -1.94
YLR224W	YLR224W	RTT107	P38850	1070 aa		2.96	□□□□□ -1.94
YLR224W	YLR224W	NOP16	P40007	231 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
YLR224W	YLR224W	YIR014W	P40570	242 aa		2.96	□□□□□ -1.94
YLR224W	YLR224W	PTR3	P43606	678 aa		2.96	□□□□□ -1.94
YLR224W	YLR224W	CUL3	P53202	744 aa		2.96	□□□□□ -1.94
YLR224W	YLR224W	RSM23	Q01163	450 aa		2.96	□□□□□ -1.94
YLR224W	YLR224W	SMA1	Q02651	245 aa		2.96	□□□□□ -1.94
YLR224W	YLR224W	YMR160W	Q03823	816 aa		2.96	□□□□□ -1.94
YLR224W	YLR224W	YTH1	Q06102	208 aa	Predicted RBP	2.96	□□□□□ -1.94
YLR224W	YLR224W	BSC1	Q12140	328 aa		2.96	□□□□□ -1.94
YLR224W	YLR224W	ARP6	Q12509	438 aa		2.96	□□□□□ -1.94
YLR224W	YLR224W	ENT1	Q12518	454 aa		2.96	□□□□□ -1.94
YLR224W	YLR224W	NOP1	P15646	327 aa	Known RBP	2.95	□□□□□ -1.94
YLR224W	YLR224W	TYR1	P20049	452 aa		2.95	□□□□□ -1.94
YLR224W	YLR224W	POL4	P25615	582 aa		2.95	□□□□□ -1.94
YLR224W	YLR224W	IMG1	P25626	169 aa		2.95	□□□□□ -1.94
YLR224W	YLR224W	CMK1	P27466	446 aa	Known RBP	2.95	□□□□□ -1.94
YLR224W	YLR224W	SYN8	P31377	255 aa		2.95	□□□□□ -1.94
YLR224W	YLR224W	SPC34	P36131	295 aa		2.95	□□□□□ -1.94
YLR224W	YLR224W	NUP133	P36161	1157 aa		2.95	□□□□□ -1.94
YLR224W	YLR224W	NOP4	P37838	685 aa	Known RBP	2.95	□□□□□ -1.94
YLR224W	YLR224W	LAG1	P38703	411 aa		2.95	□□□□□ -1.94
YLR224W	YLR224W	RRP3	P38712	501 aa	Known RBP	2.95	□□□□□ -1.94
YLR224W	YLR224W	FLC2	P39719	783 aa		2.95	□□□□□ -1.94
YLR224W	YLR224W	AFG3	P39925	761 aa		2.95	□□□□□ -1.94
YLR224W	YLR224W	TMA108	P40462	946 aa		2.95	□□□□□ -1.94
YLR224W	YLR224W	AZF1	P41696	914 aa		2.95	□□□□□ -1.94
YLR224W	YLR224W	APT1	P49435	187 aa	Known RBP	2.95	□□□□□ -1.94
YLR224W	YLR224W	SSK1	Q07084	712 aa		2.95	□□□□□ -1.94
YLR224W	YLR224W	LUC7	Q07508	261 aa	Predicted RBP	2.95	□□□□□ -1.94
YLR224W	YLR224W	YDL121C	Q07541	149 aa		2.95	□□□□□ -1.94
YLR224W	YLR224W	FMP40	Q08968	688 aa	Predicted RBP	2.95	□□□□□ -1.94
YLR224W	YLR224W	NMD4	Q12129	218 aa		2.95	□□□□□ -1.94
YLR224W	YLR224W	SPE4	Q12455	300 aa		2.95	□□□□□ -1.94
YLR224W	YLR224W	SEC53	P07283	254 aa	Known RBP	2.94	□□□□□ -1.94
YLR224W	YLR224W	CDC23	P16522	626 aa		2.94	□□□□□ -1.94
YLR224W	YLR224W	AAC3	P18238	307 aa		2.94	□□□□□ -1.94
YLR224W	YLR224W	SUI2	P20459	304 aa	Known RBP	2.94	□□□□□ -1.94
YLR224W	YLR224W	KGD1	P20967	1014 aa	Known RBP	2.94	□□□□□ -1.94
YLR224W	YLR224W	SAN1	P22470	610 aa		2.94	□□□□□ -1.94
YLR224W	YLR224W	GFD2	P25370	566 aa	Known RBP	2.94	□□□□□ -1.94
YLR224W	YLR224W	ERG1	P32476	496 aa	Known RBP	2.94	□□□□□ -1.94
YLR224W	YLR224W	SSE2	P32590	693 aa	Known RBP	2.94	□□□□□ -1.94
YLR224W	YLR224W	TRS65	P32893	560 aa		2.94	□□□□□ -1.94
YLR224W	YLR224W	ROT2	P38138	954 aa		2.94	□□□□□ -1.94
YLR224W	YLR224W	ICS2	P38284	255 aa		2.94	□□□□□ -1.94
YLR224W	YLR224W	GUF1	P46943	645 aa		2.94	□□□□□ -1.94
YLR224W	YLR224W	UPF3	P48412	387 aa	Known RBP	2.94	□□□□□ -1.94
YLR224W	YLR224W	HOS2	P53096	452 aa	Predicted RBP	2.94	□□□□□ -1.94
YLR224W	YLR224W	YVH1	Q02256	364 aa	Known RBP	2.94	□□□□□ -1.94
YLR224W	YLR224W	NGL3	Q03210	505 aa		2.94	□□□□□ -1.94
YLR224W	YLR224W	MSS11	Q03825	758 aa		2.94	□□□□□ -1.94
YLR224W	YLR224W	TMA64	Q04600	565 aa	Known RBP	2.94	□□□□□ -1.94
YLR224W	YLR224W	SDH5	Q08230	162 aa		2.94	□□□□□ -1.94
YLR224W	YLR224W	CSR2	Q12734	1121 aa		2.94	□□□□□ -1.94
YLR224W	YLR224W	YMR230W-A	Q3E7B5	62 aa		2.94	□□□□□ -1.94
YLR224W	YLR224W	GLN3	P18494	730 aa		2.93	□□□□□ -1.94
YLR224W	YLR224W	SEC1	P30619	724 aa	Known RBP	2.93	□□□□□ -1.94
YLR224W	YLR224W	MTR2	P34232	184 aa	Known RBP	2.93	□□□□□ -1.94
YLR224W	YLR224W	RIM2	P38127	377 aa		2.93	□□□□□ -1.94
YLR224W	YLR224W	CCT6	P39079	546 aa		2.93	□□□□□ -1.94
YLR224W	YLR224W	CIN4	P39110	191 aa		2.93	□□□□□ -1.94
YLR224W	YLR224W	YJL070C	P40361	888 aa		2.93	□□□□□ -1.94
YLR224W	YLR224W	AXL1	P40851	1208 aa		2.93	□□□□□ -1.94
YLR224W	YLR224W	VID30	P53076	958 aa		2.93	□□□□□ -1.94
YLR224W	YLR224W	LCL3	P53153	274 aa		2.93	□□□□□ -1.94
YLR224W	YLR224W	YGL082W	P53155	381 aa		2.93	□□□□□ -1.94
YLR224W	YLR224W	SMM1	P53720	384 aa	Known RBP	2.93	□□□□□ -1.94
YLR224W	YLR224W	DUG3	P53871	357 aa		2.93	□□□□□ -1.94
YLR224W	YLR224W	FMP45	Q07651	309 aa		2.93	□□□□□ -1.94
YLR224W	YLR224W	RCN2	Q12044	265 aa		2.93	□□□□□ -1.94
YLR224W	YLR224W	SGF29	P25554	259 aa		2.92	□□□□□ -1.94
YLR224W	YLR224W	ACH1	P32316	526 aa		2.92	□□□□□ -1.94

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 13.5 ms