RNA–Protein interactions for RNA: YKR061W

KTR2, Transcript of Mannosyltransferase involved in N-linked protein glycosylation, yeast

Gene KTR2, Length 1,278 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
KTR2	YKR061W	AQR1	P53943	586 aa		4.42	□□□□□ -1.7
KTR2	YKR061W	RCO1	Q04779	684 aa		4.42	□□□□□ -1.7
KTR2	YKR061W	RSB1	Q08417	382 aa		4.42	□□□□□ -1.7
KTR2	YKR061W	YDL177C	Q12257	170 aa		4.42	□□□□□ -1.7
KTR2	YKR061W	YDR061W	Q12298	539 aa		4.42	□□□□□ -1.7
KTR2	YKR061W	RAD61	Q99359	647 aa		4.42	□□□□□ -1.7
KTR2	YKR061W	RPS9A	O13516	197 aa	Known RBP	4.41	□□□□□ -1.7
KTR2	YKR061W	DIF1	O13577	133 aa		4.41	□□□□□ -1.7
KTR2	YKR061W	CBP2	P03874	630 aa	Predicted RBP	4.41	□□□□□ -1.7
KTR2	YKR061W	CHO2	P05374	869 aa	Known RBP	4.41	□□□□□ -1.7
KTR2	YKR061W	YEL076C-A	P0CX16	216 aa		4.41	□□□□□ -1.7
KTR2	YKR061W	YLR464W	P0CX17	216 aa		4.41	□□□□□ -1.7
KTR2	YKR061W	RPL1A	P0CX43	217 aa	Known RBP	4.41	□□□□□ -1.7
KTR2	YKR061W	RPL1B	P0CX44	217 aa	Known RBP	4.41	□□□□□ -1.7
KTR2	YKR061W	PMA2	P19657	947 aa		4.41	□□□□□ -1.7
KTR2	YKR061W	SUA5	P32579	426 aa		4.41	□□□□□ -1.7
KTR2	YKR061W	KKQ8	P36004	724 aa		4.41	□□□□□ -1.7
KTR2	YKR061W	YKR015C	P36111	568 aa		4.41	□□□□□ -1.7
KTR2	YKR061W	MRPL37	P36532	105 aa		4.41	□□□□□ -1.7
KTR2	YKR061W	SRO77	P38163	1010 aa		4.41	□□□□□ -1.7
KTR2	YKR061W	ALG3	P38179	458 aa		4.41	□□□□□ -1.7
KTR2	YKR061W	YHL012W	P38709	493 aa		4.41	□□□□□ -1.7
KTR2	YKR061W	BZZ1	P38822	633 aa		4.41	□□□□□ -1.7
KTR2	YKR061W	MNL1	P38888	796 aa		4.41	□□□□□ -1.7
KTR2	YKR061W	YEL076C	P39971	216 aa		4.41	□□□□□ -1.7
KTR2	YKR061W	IST3	P40565	148 aa	Predicted RBP	4.41	□□□□□ -1.7
KTR2	YKR061W	RLP7	P40693	322 aa	Known RBP	4.41	□□□□□ -1.7
KTR2	YKR061W	SHR5	P41912	237 aa		4.41	□□□□□ -1.7
KTR2	YKR061W	IMA1	P53051	589 aa		4.41	□□□□□ -1.7
KTR2	YKR061W	YGR066C	P53242	292 aa		4.41	□□□□□ -1.7
KTR2	YKR061W	NOG2	P53742	486 aa	Known RBP	4.41	□□□□□ -1.7
KTR2	YKR061W	MUK1	Q02866	612 aa		4.41	□□□□□ -1.7
KTR2	YKR061W	ROY1	Q04847	553 aa		4.41	□□□□□ -1.7
KTR2	YKR061W	PEX19	Q07418	342 aa		4.41	□□□□□ -1.7
KTR2	YKR061W	YOR389W	Q08912	624 aa		4.41	□□□□□ -1.7
KTR2	YKR061W	YPL260W	Q08977	551 aa		4.41	□□□□□ -1.7
KTR2	YKR061W	DIN7	Q12086	430 aa		4.41	□□□□□ -1.7
KTR2	YKR061W	LDB17	Q12342	491 aa		4.41	□□□□□ -1.7
KTR2	YKR061W	MRPL23	Q12487	163 aa	Predicted RBP	4.41	□□□□□ -1.7
KTR2	YKR061W	PTC5	Q12511	572 aa		4.41	□□□□□ -1.7
KTR2	YKR061W	RAD50	P12753	1312 aa		4.41	□□□□□ -1.7
KTR2	YKR061W	DFR1	P07807	211 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.4	□□□□□ -1.71	not detected
KTR2	YKR061W	TY1A-LR4	P0C2I8	440 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	TY1A-DR6	P0CX70	440 aa		4.4	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	TY1A-ER1	P0CX71	440 aa		4.4	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	TY1A-LR2	P0CX72	440 aa		4.4	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	TY1A-PL	P0CX73	440 aa		4.4	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	TY1A-JR1	P0CX74	440 aa		4.4	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	TY1A-LR3	P0CX75	440 aa		4.4	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	TY1A-ML2	P0CX76	440 aa		4.4	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	UNG1	P12887	359 aa		4.4	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	GLN4	P13188	809 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	PRP2	P20095	876 aa	Predicted RBP	4.4	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	RIT1	P23796	513 aa		4.4	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	YCR016W	P25617	290 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	HXT4	P32467	576 aa		4.4	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	TOD6	P34219	525 aa		4.4	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	SEF1	P34228	1148 aa		4.4	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	YKR078W	P36158	585 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	AAP1	P37898	856 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	MNN9	P39107	395 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	YAR028W	P39548	234 aa		4.4	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	RGI2	P40188	164 aa		4.4	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	BST1	P43571	1029 aa		4.4	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	YFR018C	P43599	363 aa		4.4	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	GLO1	P50107	326 aa		4.4	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	KAP120	Q02932	1032 aa		4.4	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	NGL3	Q03210	505 aa		4.4	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	RAD30	Q04049	632 aa		4.4	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	PPM1	Q04081	328 aa		4.4	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	GTO3	Q04806	366 aa		4.4	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	YLR297W	Q05899	129 aa		4.4	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	ENT4	Q07872	247 aa		4.4	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	BRX1	Q08235	291 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	NUS1	Q12063	375 aa		4.4	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	TY1A-GR1	Q12085	440 aa		4.4	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	UBX3	Q12229	455 aa		4.4	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	COX17	Q12287	69 aa		4.4	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	TY1A-PR3	Q6Q5H1	440 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	TY1A-OL	Q92392	440 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	RPS13	P05756	151 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	FBP1	P09201	348 aa		4.39	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	SAM35	P14693	329 aa		4.39	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	KRS1	P15180	591 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	IMG2	P25642	146 aa	Predicted RBP	4.39	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	ERV1	P27882	189 aa		4.39	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	RPC82	P32349	654 aa		4.39	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	MRP20	P32387	263 aa		4.39	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	ERG1	P32476	496 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	BUD2	P33314	1104 aa		4.39	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	KES1	P35844	434 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	TPO5	P36029	618 aa		4.39	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	YKR018C	P36114	725 aa		4.39	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	YKR051W	P36142	418 aa		4.39	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	ATP3	P38077	311 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	CST26	P38226	397 aa		4.39	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	MSR1	P38714	643 aa		4.39	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	PET100	P38958	111 aa		4.39	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	STN1	P38960	494 aa		4.39	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	SSO2	P39926	295 aa		4.39	□□□□□ -1.71

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 16.3 ms