RNA–Protein interactions for RNA: YJL034W

KAR2, Transcript of ATPase involved in protein import into the ER, yeast

Gene KAR2, Length 2,049 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
KAR2	YJL034W	YLR422W	Q06409	1932 aa		4.69	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	COR1	P07256	457 aa		4.69	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	STE6	P12866	1290 aa		4.69	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	MIH1	P23748	554 aa		4.69	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	DCC1	P25559	380 aa		4.69	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	CCR4	P31384	837 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	MET22	P32179	357 aa		4.69	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	GUT2	P32191	649 aa		4.69	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	TFB1	P32776	642 aa		4.69	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	SGE1	P33335	543 aa		4.69	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	PTC1	P35182	281 aa		4.69	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	ATG14	P38270	344 aa		4.69	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	RIM11	P38615	370 aa		4.69	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	SSZ1	P38788	538 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	SFB3	P38810	929 aa		4.69	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	YEN1	P40028	759 aa		4.69	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	BTT1	P40314	149 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	MET18	P40469	1032 aa		4.69	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	HPM1	P40481	377 aa		4.69	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	KTR7	P40504	517 aa		4.69	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	IBD2	P53892	351 aa		4.69	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	YPL034W	Q03083	165 aa		4.69	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	YDR239C	Q03780	787 aa		4.69	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	YDR131C	Q03899	556 aa		4.69	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	BLS1	Q06071	122 aa		4.69	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	MCP2	Q06567	569 aa		4.69	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	ECM30	Q06673	1274 aa		4.69	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	YEH2	Q07950	538 aa		4.69	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	SCM3	Q12334	223 aa		4.69	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	SEC53	P07283	254 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	SEC2	P17065	759 aa		4.68	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	ART10	P18634	518 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	EMC1	P25574	760 aa		4.68	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	YCR099C	P25657	155 aa		4.68	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	PHO91	P27514	894 aa		4.68	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	MAE1	P36013	669 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	APM3	P38153	483 aa		4.68	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	RFS1	P38234	210 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	YLF2	P38746	405 aa		4.68	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	ACO2	P39533	789 aa		4.68	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	DLD3	P39976	496 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	MMF1	P40185	145 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	HAM1	P47119	197 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	GET1	P53192	235 aa		4.68	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	EFM5	P53200	248 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	YNR063W	P53749	607 aa		4.68	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	BNI4	P53858	892 aa		4.68	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	RAD30	Q04049	632 aa		4.68	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	FMP42	Q04991	504 aa		4.68	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	NUT2	Q06213	157 aa		4.68	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	RKM1	Q08961	583 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	SAS5	Q99314	248 aa		4.68	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	ATP6	P00854	259 aa		4.68	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	TRP3	P00937	484 aa		4.68	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	REP1	P03871	373 aa		4.68	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	SPE1	P08432	466 aa		4.68	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	SCH9	P11792	824 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	AMD1	P15274	810 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	MRPL8	P22353	238 aa		4.68	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	PHO3	P24031	467 aa		4.68	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	DBR1	P24309	405 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	MF(ALPHA)2	P32435	120 aa		4.68	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	PTM1	P32857	523 aa		4.68	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	SKT5	P34226	696 aa		4.68	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	YBR139W	P38109	508 aa		4.68	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	POL12	P38121	705 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	KTR4	P38131	464 aa		4.68	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	MSC7	P38694	644 aa		4.68	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	YHR112C	P38716	378 aa		4.68	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	VMA13	P41807	478 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	YJL055W	P47044	245 aa		4.68	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	EMC2	P47133	292 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	MRK1	P50873	501 aa		4.68	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	SAP4	P53036	818 aa		4.68	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	RMR1	P53060	241 aa		4.68	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	HXT15	P54854	567 aa		4.68	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	REG1	Q00816	1014 aa		4.68	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	SED5	Q01590	340 aa		4.68	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	NAN1	Q02931	896 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	YML131W	Q03102	365 aa		4.68	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	RPN4	Q03465	531 aa		4.68	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	TAF12	Q03761	539 aa		4.68	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	SPO20	Q04359	397 aa		4.68	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	YLR413W	Q06689	675 aa		4.68	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	TRE2	Q08693	809 aa		4.68	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	MRH1	Q12117	320 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	AHA1	Q12449	350 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	YLR149C	Q99296	730 aa		4.68	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	RPN13	O13563	156 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	TPK2	P06245	380 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	IDI1	P15496	288 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	GBP2	P25555	427 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.67	□□□□□ -1.66	not detected
KAR2	YJL034W	YCR016W	P25617	290 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	BUB2	P26448	306 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	PTP2	P29461	750 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	STB6	P36085	766 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	YBL029W	P38201	376 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	GDH3	P39708	457 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	FCY21	P40039	528 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	UBP7	P40453	1071 aa		4.67	□□□□□ -1.66

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