RNA–Protein interactions for RNA: YHR039C-A

VMA10, Transcript of Subunit G of the V1 peripheral membrane domain of V-ATPase, yeast

Gene VMA10, Length 345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VMA10	YHR039C-A	AVL9	Q12500	764 aa		3.23	□□□□□ -1.89
VMA10	YHR039C-A	YOL159C-A	Q3E769	90 aa		3.23	□□□□□ -1.89
VMA10	YHR039C-A	SGS1	P35187	1447 aa		3.22	□□□□□ -1.89
VMA10	YHR039C-A	GAL80	P04387	435 aa		3.22	□□□□□ -1.89
VMA10	YHR039C-A	YER190C-B	P0CX94	160 aa		3.22	□□□□□ -1.89
VMA10	YHR039C-A	YEL077W-A	P0CX95	160 aa		3.22	□□□□□ -1.89
VMA10	YHR039C-A	YGR296C-B	P0CX96	160 aa		3.22	□□□□□ -1.89
VMA10	YHR039C-A	YPL283W-B	P0CX97	160 aa		3.22	□□□□□ -1.89
VMA10	YHR039C-A	YPR204C-A	P0CX98	160 aa		3.22	□□□□□ -1.89
VMA10	YHR039C-A	PDA1	P16387	420 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
VMA10	YHR039C-A	PRD1	P25375	712 aa		3.22	□□□□□ -1.89
VMA10	YHR039C-A	RPC53	P25441	422 aa		3.22	□□□□□ -1.89
VMA10	YHR039C-A	IMG1	P25626	169 aa		3.22	□□□□□ -1.89
VMA10	YHR039C-A	GPI10	P30777	616 aa		3.22	□□□□□ -1.89
VMA10	YHR039C-A	WBP1	P33767	430 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
VMA10	YHR039C-A	YBL055C	P34220	418 aa	Predicted RBP	3.22	□□□□□ -1.89
VMA10	YHR039C-A	SEF1	P34228	1148 aa		3.22	□□□□□ -1.89
VMA10	YHR039C-A	FLO5	P38894	1075 aa		3.22	□□□□□ -1.89
VMA10	YHR039C-A	ALG5	P40350	334 aa		3.22	□□□□□ -1.89
VMA10	YHR039C-A	DOT5	P40553	215 aa		3.22	□□□□□ -1.89
VMA10	YHR039C-A	AXL1	P40851	1208 aa		3.22	□□□□□ -1.89
VMA10	YHR039C-A	GPD2	P41911	440 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
VMA10	YHR039C-A	LYS20	P48570	428 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
VMA10	YHR039C-A	IMD4	P50094	524 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
VMA10	YHR039C-A	ERG26	P53199	349 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
VMA10	YHR039C-A	YGR127W	P53275	312 aa		3.22	□□□□□ -1.89
VMA10	YHR039C-A	SEC5	P89102	971 aa		3.22	□□□□□ -1.89
VMA10	YHR039C-A	FIN1	Q03898	291 aa		3.22	□□□□□ -1.89
VMA10	YHR039C-A	ADE13	Q05911	482 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
VMA10	YHR039C-A	MRD1	Q06106	887 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
VMA10	YHR039C-A	GRC3	Q07845	632 aa		3.22	□□□□□ -1.89
VMA10	YHR039C-A	TEN1	Q07921	160 aa		3.22	□□□□□ -1.89
VMA10	YHR039C-A	RPS10A	Q08745	105 aa	Predicted RBP	3.22	□□□□□ -1.89
VMA10	YHR039C-A	FRE3	Q08905	711 aa		3.22	□□□□□ -1.89
VMA10	YHR039C-A	RLM1	Q12224	676 aa		3.22	□□□□□ -1.89
VMA10	YHR039C-A	YPR089W	O13585	888 aa		3.21	□□□□□ -1.9
VMA10	YHR039C-A	PDX1	P16451	410 aa		3.21	□□□□□ -1.9
VMA10	YHR039C-A	ART10	P18634	518 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
VMA10	YHR039C-A	BUD5	P25300	642 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
VMA10	YHR039C-A	BOS1	P25385	244 aa		3.21	□□□□□ -1.9
VMA10	YHR039C-A	GAC1	P28006	793 aa		3.21	□□□□□ -1.9
VMA10	YHR039C-A	MIA40	P36046	403 aa		3.21	□□□□□ -1.9
VMA10	YHR039C-A	MUM2	P38236	366 aa		3.21	□□□□□ -1.9
VMA10	YHR039C-A	ANS1	P38832	159 aa		3.21	□□□□□ -1.9
VMA10	YHR039C-A	RPS10B	P46784	105 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
VMA10	YHR039C-A	PET130	P47065	347 aa		3.21	□□□□□ -1.9
VMA10	YHR039C-A	TWF1	P53250	332 aa		3.21	□□□□□ -1.9
VMA10	YHR039C-A	IPI3	P53877	555 aa		3.21	□□□□□ -1.9
VMA10	YHR039C-A	MSC1	Q03104	513 aa		3.21	□□□□□ -1.9
VMA10	YHR039C-A	YDR131C	Q03899	556 aa		3.21	□□□□□ -1.9
VMA10	YHR039C-A	EMI2	Q04409	500 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
VMA10	YHR039C-A	SWF1	Q04629	336 aa		3.21	□□□□□ -1.9
VMA10	YHR039C-A	ECM22	Q05958	814 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
VMA10	YHR039C-A	ATG29	Q12092	213 aa		3.21	□□□□□ -1.9
VMA10	YHR039C-A	CNA1	P23287	553 aa		3.2	□□□□□ -1.9
VMA10	YHR039C-A	SEC66	P33754	206 aa		3.2	□□□□□ -1.9
VMA10	YHR039C-A	CMC1	P36064	111 aa		3.2	□□□□□ -1.9
VMA10	YHR039C-A	DBP8	P38719	431 aa		3.2	□□□□□ -1.9
VMA10	YHR039C-A	PTR3	P43606	678 aa		3.2	□□□□□ -1.9
VMA10	YHR039C-A	UBP8	P50102	471 aa		3.2	□□□□□ -1.9
VMA10	YHR039C-A	MPS1	P54199	764 aa		3.2	□□□□□ -1.9
VMA10	YHR039C-A	YDR239C	Q03780	787 aa		3.2	□□□□□ -1.9
VMA10	YHR039C-A	RQC1	Q05468	723 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
VMA10	YHR039C-A	ATG26	Q06321	1198 aa		3.2	□□□□□ -1.9
VMA10	YHR039C-A	HER1	Q12276	1246 aa		3.2	□□□□□ -1.9
VMA10	YHR039C-A	SEC39	Q12745	709 aa		3.2	□□□□□ -1.9
VMA10	YHR039C-A	ARG81	P05085	880 aa		3.19	□□□□□ -1.9
VMA10	YHR039C-A	PUT2	P07275	575 aa		3.19	□□□□□ -1.9
VMA10	YHR039C-A	HOM3	P10869	527 aa		3.19	□□□□□ -1.9
VMA10	YHR039C-A	ELO2	P25358	347 aa		3.19	□□□□□ -1.9
VMA10	YHR039C-A	VMA8	P32610	256 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
VMA10	YHR039C-A	PMT1	P33775	817 aa		3.19	□□□□□ -1.9
VMA10	YHR039C-A	SAS3	P34218	831 aa		3.19	□□□□□ -1.9
VMA10	YHR039C-A	MTR2	P34232	184 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
VMA10	YHR039C-A	RPL32	P38061	130 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
VMA10	YHR039C-A	ICS2	P38284	255 aa		3.19	□□□□□ -1.9
VMA10	YHR039C-A	LEU5	P38702	357 aa		3.19	□□□□□ -1.9
VMA10	YHR039C-A	UBA4	P38820	440 aa		3.19	□□□□□ -1.9
VMA10	YHR039C-A	PCI8	P40512	444 aa		3.19	□□□□□ -1.9
VMA10	YHR039C-A	HXT9	P40885	567 aa		3.19	□□□□□ -1.9
VMA10	YHR039C-A	PYK2	P52489	506 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
VMA10	YHR039C-A	YNL144C	P53907	740 aa		3.19	□□□□□ -1.9
VMA10	YHR039C-A	RPL15B	P54780	204 aa	Predicted RBP	3.19	□□□□□ -1.9
VMA10	YHR039C-A	RSM23	Q01163	450 aa		3.19	□□□□□ -1.9
VMA10	YHR039C-A	CAC2	Q04199	468 aa		3.19	□□□□□ -1.9
VMA10	YHR039C-A	ECM30	Q06673	1274 aa		3.19	□□□□□ -1.9
VMA10	YHR039C-A	RRI1	Q12468	440 aa		3.19	□□□□□ -1.9
VMA10	YHR039C-A	YPT1	P01123	206 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
VMA10	YHR039C-A	PMS1	P14242	873 aa		3.18	□□□□□ -1.9
VMA10	YHR039C-A	AIM17	P23180	465 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
VMA10	YHR039C-A	ADK2	P26364	225 aa		3.18	□□□□□ -1.9
VMA10	YHR039C-A	MGM1	P32266	881 aa		3.18	□□□□□ -1.9
VMA10	YHR039C-A	YKL100C	P34248	587 aa		3.18	□□□□□ -1.9
VMA10	YHR039C-A	ASK1	P35734	292 aa		3.18	□□□□□ -1.9
VMA10	YHR039C-A	RFC1	P38630	861 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
VMA10	YHR039C-A	MSR1	P38714	643 aa		3.18	□□□□□ -1.9
VMA10	YHR039C-A	SPC97	P38863	823 aa		3.18	□□□□□ -1.9
VMA10	YHR039C-A	CIN4	P39110	191 aa		3.18	□□□□□ -1.9
VMA10	YHR039C-A	YMR124W	P39523	943 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
VMA10	YHR039C-A	YIL060W	P40519	144 aa		3.18	□□□□□ -1.9

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