RNA–Protein interactions for RNA: YGR088W

CTT1, Transcript of Cytosolic catalase T, yeast

Gene CTT1, Length 1,689 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CTT1	YGR088W	PDR8	Q06149	701 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	YPQ2	Q06328	317 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	YET3	Q07451	203 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	BRE4	Q07660	1125 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	DIA2	Q08496	732 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	YDL109C	Q12103	647 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	FRT1	Q99332	602 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	PMD1	P32634	1753 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	TDH1	P00360	332 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	ATP2	P00830	511 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	BI2	P03873	423 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	RPI1	P23250	407 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	DAL2	P25335	343 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	ADP1	P25371	1049 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	URA7	P28274	579 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	MUD1	P32605	298 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	YSC83	P32792	385 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	PEX2	P32800	271 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	UGA4	P32837	571 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	TGL4	P36165	910 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	SLM4	P38247	162 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	SDH8	P38345	138 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	BSD2	P38356	321 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	YER184C	P39961	794 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	ARG2	P40360	574 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	NIT1	P40447	199 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	RPL34B	P40525	121 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	QRI1	P43123	477 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	POL31	P46957	487 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	YJL181W	P46987	611 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	HLJ1	P48353	224 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	BIO4	P53630	237 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	CNM67	P53865	581 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	RPA49	Q01080	415 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	SWP1	Q02795	286 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	YDR476C	Q03362	224 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	YDR514C	Q04408	483 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	YML083C	Q04526	418 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	BOP2	Q06150	570 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	RRT8	Q08219	342 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	YLR125W	Q12138	136 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	MNL2	Q12205	849 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	RTR2	Q12378	196 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	BI3	Q9ZZW7	517 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	RAP1	P11938	827 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	HAP4	P14064	554 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	GCN3	P14741	305 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	FUR1	P18562	216 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	UTR1	P21373	530 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	RET1	P22276	1149 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	SEC1	P30619	724 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	VMA6	P32366	345 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	SUV3	P32580	737 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	YSC84	P32793	468 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	PDX3	P38075	228 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	APM2	P38700	605 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	NDT80	P38830	627 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	MTG2	P38860	518 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	TAT2	P38967	592 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	NPR2	P39923	615 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	RPN11	P43588	306 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	GUS1	P46655	708 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.56	□□□□□ -1.68	not detected
CTT1	YGR088W	GLG2	P47011	380 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	BNA3	P47039	444 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	YJR141W	P47172	347 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	PUS2	P53167	370 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	YGR125W	P53273	1036 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	TOF2	Q02208	771 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	NOG1	Q02892	647 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	FMP42	Q04991	504 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	ACK1	Q07622	623 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	WHI4	Q07655	649 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	RPN8	Q08723	338 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	DIN7	Q12086	430 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	HRT3	Q12347	344 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	SNU23	Q12368	194 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	GSC2	P40989	1895 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	YLR358C	O13565	187 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	IPP1	P00817	287 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	TUB1	P09733	447 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	TCP1	P12612	559 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	THR1	P17423	357 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	RNR1	P21524	888 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	BUD23	P25627	275 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	CDC20	P26309	610 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	HXT3	P32466	567 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	YKU70	P32807	602 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	MSN4	P33749	630 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	LOT5	P34234	306 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	TPO5	P36029	618 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	GRS1	P38088	690 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	RIM2	P38127	377 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	MMS4	P38257	691 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	MGE1	P38523	228 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	GND1	P38720	489 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	EGD2	P38879	174 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	YDR089W	P38966	869 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	NPT1	P39683	429 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	GIM4	P40005	111 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	KHA1	P40309	873 aa		4.55	□□□□□ -1.68

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