RNA–Protein interactions for RNA: YGL067W

NPY1, Transcript of NADH diphosphatase (pyrophosphatase), yeast

Gene NPY1, Length 1,155 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Peroxisome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NPY1	YGL067W	YBR032W	P38223	100 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NPY1	YGL067W	PFF1	P38244	976 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NPY1	YGL067W	YER186C	P40101	306 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NPY1	YGL067W	DIM1	P41819	318 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
NPY1	YGL067W	IES1	P43579	692 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NPY1	YGL067W	PAN2	P53010	1115 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
NPY1	YGL067W	BRE5	P53741	515 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
NPY1	YGL067W	ARP4	P80428	489 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NPY1	YGL067W	KIN4	Q01919	800 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NPY1	YGL067W	OSH6	Q02201	448 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NPY1	YGL067W	RVB1	Q03940	463 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
NPY1	YGL067W	VPS64	Q03944	604 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NPY1	YGL067W	URC2	Q04411	772 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NPY1	YGL067W	ARP9	Q05123	467 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NPY1	YGL067W	GLO2	Q05584	274 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NPY1	YGL067W	NGL1	Q08213	363 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
NPY1	YGL067W	SSP2	Q08646	371 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NPY1	YGL067W	PGA3	Q12746	312 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
NPY1	YGL067W	TY4B-H	P0C2J7	1802 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NPY1	YGL067W	TY4B-J	P47024	1803 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NPY1	YGL067W	INH1	P01097	85 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NPY1	YGL067W	HMG2	P12684	1045 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NPY1	YGL067W	DAP2	P18962	818 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NPY1	YGL067W	VPS3	P23643	1011 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NPY1	YGL067W	MCM3	P24279	971 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NPY1	YGL067W	LCB1	P25045	558 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NPY1	YGL067W	RPS5	P26783	225 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NPY1	YGL067W	XRS2	P33301	854 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NPY1	YGL067W	TGL1	P34163	548 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NPY1	YGL067W	HES1	P35843	434 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NPY1	YGL067W	APL2	P36000	726 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NPY1	YGL067W	VPS51	P36116	164 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NPY1	YGL067W	GLG1	P36143	616 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NPY1	YGL067W	RCK2	P38623	610 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NPY1	YGL067W	VHR1	P40522	640 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NPY1	YGL067W	AIP1	P46680	615 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NPY1	YGL067W	RPC17	P47076	161 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NPY1	YGL067W	DRN1	P53255	507 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NPY1	YGL067W	IMP4	P53941	290 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NPY1	YGL067W	PRO2	P54885	456 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NPY1	YGL067W	MTD1	Q02046	320 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NPY1	YGL067W	EBS1	Q03466	884 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NPY1	YGL067W	RAD30	Q04049	632 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NPY1	YGL067W	PPN1	Q04119	674 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NPY1	YGL067W	SMP3	Q04174	516 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NPY1	YGL067W	DXO1	Q06349	442 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NPY1	YGL067W	VPS36	Q06696	566 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NPY1	YGL067W	YDL109C	Q12103	647 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NPY1	YGL067W	BAG7	Q12128	409 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NPY1	YGL067W	YPT6	Q99260	215 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NPY1	YGL067W	YLR278C	Q05854	1341 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NPY1	YGL067W	TUB3	P09734	445 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
NPY1	YGL067W	CLN3	P13365	580 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NPY1	YGL067W	POL3	P15436	1097 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NPY1	YGL067W	ACO1	P19414	778 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.88	□□□□□ -1.63	not detected
NPY1	YGL067W	ATP12	P22135	325 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NPY1	YGL067W	ERG4	P25340	473 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NPY1	YGL067W	SPB1	P25582	841 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
NPY1	YGL067W	NTR2	P36118	322 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
NPY1	YGL067W	MRPL36	P36531	177 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NPY1	YGL067W	KTR3	P38130	404 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
NPY1	YGL067W	APM3	P38153	483 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NPY1	YGL067W	RFS1	P38234	210 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
NPY1	YGL067W	SDH8	P38345	138 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NPY1	YGL067W	MTG2	P38860	518 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NPY1	YGL067W	MNT3	P40549	630 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NPY1	YGL067W	BNA3	P47039	444 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
NPY1	YGL067W	MIG2	P53035	382 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NPY1	YGL067W	TAF6	P53040	516 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NPY1	YGL067W	YGR016W	P53209	190 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NPY1	YGL067W	MDM1	Q01846	1127 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NPY1	YGL067W	REC102	Q02721	264 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NPY1	YGL067W	INA17	Q02888	182 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NPY1	YGL067W	ACL4	Q03771	387 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NPY1	YGL067W	SMD2	Q06217	110 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
NPY1	YGL067W	TRM8	Q12009	286 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NPY1	YGL067W	RCN2	Q12044	265 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NPY1	YGL067W	VPS54	Q12071	889 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NPY1	YGL067W	SNU23	Q12368	194 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
NPY1	YGL067W	ZRT2	Q12436	422 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NPY1	YGL067W	YIL002W-A	Q3E7Z5	69 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NPY1	YGL067W	MF(ALPHA)1	P01149	165 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NPY1	YGL067W	MET3	P08536	511 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NPY1	YGL067W	YEL076C-A	P0CX16	216 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NPY1	YGL067W	YLR464W	P0CX17	216 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NPY1	YGL067W	MER1	P16523	270 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NPY1	YGL067W	PRP22	P24384	1145 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NPY1	YGL067W	SWI4	P25302	1093 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NPY1	YGL067W	IMG2	P25642	146 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NPY1	YGL067W	MF(ALPHA)2	P32435	120 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NPY1	YGL067W	HXT4	P32467	576 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NPY1	YGL067W	PET127	P32606	800 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NPY1	YGL067W	RPT3	P33298	428 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NPY1	YGL067W	ETR1	P38071	380 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NPY1	YGL067W	SLX1	P38324	304 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NPY1	YGL067W	SUL1	P38359	859 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NPY1	YGL067W	GOS1	P38736	223 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NPY1	YGL067W	RPP1	P38786	293 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NPY1	YGL067W	SMC2	P38989	1170 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NPY1	YGL067W	CCT3	P39077	534 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 21.3 ms