RNA–Protein interactions for RNA: YCL057W

PRD1, Transcript of Zinc metalloendopeptidase, yeast

Gene PRD1, Length 2,139 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PRD1	YCL057W	PHM8	P40025	321 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRD1	YCL057W	RIO2	P40160	425 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PRD1	YCL057W	REG1	Q00816	1014 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRD1	YCL057W	VTC3	Q02725	835 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRD1	YCL057W	MMR1	Q06324	491 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRD1	YCL057W	SPN1	Q06505	410 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PRD1	YCL057W	YOL075C	Q08234	1294 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRD1	YCL057W	KRS1	P15180	591 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PRD1	YCL057W	SEC14	P24280	304 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PRD1	YCL057W	SRB4	P32569	687 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRD1	YCL057W	YSW1	P38280	609 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRD1	YCL057W	SIP3	P38717	1229 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRD1	YCL057W	LYS14	P40971	790 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRD1	YCL057W	AIP1	P46680	615 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PRD1	YCL057W	YKU80	Q04437	629 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRD1	YCL057W	SMC6	Q12749	1114 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRD1	YCL057W	YLR302C	O13544	120 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PRD1	YCL057W	ARG4	P04076	463 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PRD1	YCL057W	MAK32	P23060	363 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PRD1	YCL057W	BMH1	P29311	267 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PRD1	YCL057W	CBF5	P33322	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.85	□□□□□ -1.63	not detected
PRD1	YCL057W	YMR124W	P39523	943 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PRD1	YCL057W	CMS1	Q07897	291 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PRD1	YCL057W	TAH18	Q12181	623 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PRD1	YCL057W	HIS4	P00815	799 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PRD1	YCL057W	SUP35	P05453	685 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PRD1	YCL057W	ARD1	P07347	238 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PRD1	YCL057W	GFD2	P25370	566 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PRD1	YCL057W	YME2	P32843	850 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PRD1	YCL057W	PPZ2	P33329	710 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PRD1	YCL057W	UBP7	P40453	1071 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PRD1	YCL057W	FMP30	Q02883	468 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PRD1	YCL057W	SLK19	Q08581	821 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PRD1	YCL057W	ERG27	Q12452	347 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PRD1	YCL057W	TUB1	P09733	447 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PRD1	YCL057W	COQ1	P18900	473 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PRD1	YCL057W	CKI1	P20485	582 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PRD1	YCL057W	SRB5	P32585	307 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PRD1	YCL057W	BMH2	P34730	273 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PRD1	YCL057W	UBX6	P47049	396 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PRD1	YCL057W	ZPR1	P53303	486 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PRD1	YCL057W	SEC5	P89102	971 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PRD1	YCL057W	ADA2	Q02336	434 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PRD1	YCL057W	URH1	Q04179	340 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PRD1	YCL057W	YMR114C	Q04471	368 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PRD1	YCL057W	YDR109C	Q04585	715 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PRD1	YCL057W	RDL1	Q12305	139 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PRD1	YCL057W	YRF1-3	P0CX14	1859 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PRD1	YCL057W	YRF1-7	P0CX15	1859 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PRD1	YCL057W	YRF1-6	P53819	1859 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PRD1	YCL057W	RAD51	P25454	400 aa		4.84	□□□□□ -1.64
PRD1	YCL057W	DPH5	P32469	300 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.64
PRD1	YCL057W	GSH1	P32477	678 aa		4.84	□□□□□ -1.64
PRD1	YCL057W	LOS1	P33418	1100 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.64
PRD1	YCL057W	LAS1	P36146	502 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.64
PRD1	YCL057W	NOP16	P40007	231 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
PRD1	YCL057W	PCI8	P40512	444 aa		4.84	□□□□□ -1.64
PRD1	YCL057W	YJL043W	P47053	257 aa		4.84	□□□□□ -1.64
PRD1	YCL057W	UPF3	P48412	387 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
PRD1	YCL057W	YNL058C	P53947	316 aa		4.84	□□□□□ -1.64
PRD1	YCL057W	SPO19	Q03029	223 aa		4.84	□□□□□ -1.64
PRD1	YCL057W	NBP2	Q12163	236 aa		4.84	□□□□□ -1.64
PRD1	YCL057W	NBL1	Q3E7Y6	73 aa		4.84	□□□□□ -1.64
PRD1	YCL057W	SAC3	P46674	1301 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PRD1	YCL057W	PTC6	P25646	442 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PRD1	YCL057W	PUP2	P32379	260 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PRD1	YCL057W	ZUO1	P32527	433 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PRD1	YCL057W	PAH1	P32567	862 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PRD1	YCL057W	ERG7	P38604	731 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PRD1	YCL057W	CCT2	P39076	527 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PRD1	YCL057W	YJR061W	P40355	935 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PRD1	YCL057W	PFK26	P40433	827 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PRD1	YCL057W	TMA108	P40462	946 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PRD1	YCL057W	IRC8	P47046	822 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PRD1	YCL057W	YLR177W	Q06251	628 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PRD1	YCL057W	YAP7	Q08182	245 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PRD1	YCL057W	LEA1	Q08963	238 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PRD1	YCL057W	NUS1	Q12063	375 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PRD1	YCL057W	HSC82	P15108	705 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
PRD1	YCL057W	TFC3	P34111	1160 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PRD1	YCL057W	OLA1	P38219	394 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
PRD1	YCL057W	ARC1	P46672	376 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
PRD1	YCL057W	TAX4	P47030	604 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PRD1	YCL057W	ILM1	P47155	203 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PRD1	YCL057W	BSC5	P53755	489 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PRD1	YCL057W	RPT6	Q01939	405 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
PRD1	YCL057W	UBX2	Q04228	584 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PRD1	YCL057W	VTI1	Q04338	217 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PRD1	YCL057W	OSW1	Q08692	278 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PRD1	YCL057W	LYS21	Q12122	440 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
PRD1	YCL057W	RXT2	P38255	430 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PRD1	YCL057W	APD1	P38281	316 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PRD1	YCL057W	SPP381	P38282	291 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
PRD1	YCL057W	SWP82	P43554	623 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PRD1	YCL057W	NNF2	P53253	936 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PRD1	YCL057W	DCP2	P53550	970 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
PRD1	YCL057W	AAT1	Q01802	451 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PRD1	YCL057W	MUB1	Q03162	620 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PRD1	YCL057W	PRP42	Q03776	544 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
PRD1	YCL057W	SWA2	Q06677	668 aa		4.82	□□□□□ -1.64

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