RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550996.1

CS-222, Transcript of citrate synthase, human

TSL 2

Gene CS, Length 718 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-222	ENST00000550996	FGD4	Q96M96	766 aa		24.53	■■□□□ 1.52
CS-222	ENST00000550996	ESYT1	Q9BSJ8	1104 aa		24.53	■■□□□ 1.52
CS-222	ENST00000550996	LSG1	Q9H089	658 aa	Known RBP	24.53	■■□□□ 1.52
CS-222	ENST00000550996	RANBP17	Q9H2T7	1088 aa	Known RBP	24.53	■■□□□ 1.52
CS-222	ENST00000550996	DIS3	Q9Y2L1	958 aa	Known RBP	24.53	■■□□□ 1.52
CS-222	ENST00000550996	TNKS	O95271	1327 aa		24.53	■■□□□ 1.52
CS-222	ENST00000550996	ANKLE1	Q8NAG6	615 aa		24.52	■■□□□ 1.52
CS-222	ENST00000550996	PNMA1	Q8ND90	353 aa		24.52	■■□□□ 1.52
CS-222	ENST00000550996	DDX20	Q9UHI6	824 aa	Known RBP	24.52	■■□□□ 1.52
CS-222	ENST00000550996	RBM8A	Q9Y5S9	174 aa	Known RBP	24.52	■■□□□ 1.52
CS-222	ENST00000550996	CNGA1	P29973	690 aa		24.51	■■□□□ 1.51
CS-222	ENST00000550996	SEC23A	Q15436	765 aa		24.51	■■□□□ 1.51
CS-222	ENST00000550996	TINF2	Q9BSI4	451 aa		24.51	■■□□□ 1.51
CS-222	ENST00000550996	RNF146	Q9NTX7	359 aa		24.51	■■□□□ 1.51
CS-222	ENST00000550996	FBXO40	Q9UH90	709 aa		24.51	■■□□□ 1.51
CS-222	ENST00000550996	ZNFX1	Q9P2E3	1918 aa	Known RBP	24.51	■■□□□ 1.51
CS-222	ENST00000550996	GOLGA8H	P0CJ92	632 aa		24.5	■■□□□ 1.51
CS-222	ENST00000550996	CCDC178	Q5BJE1	867 aa		24.5	■■□□□ 1.51
CS-222	ENST00000550996	MUM1L1	Q5H9M0	696 aa		24.5	■■□□□ 1.51
CS-222	ENST00000550996	DDX11	Q96FC9	970 aa		24.5	■■□□□ 1.51
CS-222	ENST00000550996	CPVL	Q9H3G5	476 aa		24.5	■■□□□ 1.51
CS-222	ENST00000550996	RANBP2	P49792	3224 aa	Known RBP	24.5	■■□□□ 1.51
CS-222	ENST00000550996		E7EWF7	191 aa		24.49	■■□□□ 1.51
CS-222	ENST00000550996	ICAM1	P05362	532 aa		24.49	■■□□□ 1.51
CS-222	ENST00000550996	ALAS1	P13196	640 aa		24.49	■■□□□ 1.51
CS-222	ENST00000550996	ANO1	Q5XXA6	986 aa		24.49	■■□□□ 1.51
CS-222	ENST00000550996	TRERF1	Q96PN7	1200 aa		24.49	■■□□□ 1.51
CS-222	ENST00000550996	UBAC1	Q9BSL1	405 aa		24.49	■■□□□ 1.51
CS-222	ENST00000550996	ACAD9	Q9H845	621 aa		24.49	■■□□□ 1.51
CS-222	ENST00000550996	KAT14	Q9H8E8	782 aa		24.49	■■□□□ 1.51
CS-222	ENST00000550996	A1CF	Q9NQ94	594 aa	Known RBP	24.49	■■□□□ 1.51
CS-222	ENST00000550996	PFAS	O15067	1338 aa		24.48	■■□□□ 1.51
CS-222	ENST00000550996	COL9A3	Q14050	684 aa	Predicted RBP	24.48	■■□□□ 1.51
CS-222	ENST00000550996	TKFC	Q3LXA3	575 aa		24.48	■■□□□ 1.51
CS-222	ENST00000550996	NECAB2	Q7Z6G3	386 aa		24.48	■■□□□ 1.51
CS-222	ENST00000550996	ANKRD35	Q8N283	1001 aa		24.48	■■□□□ 1.51
CS-222	ENST00000550996	SENP2	Q9HC62	589 aa		24.48	■■□□□ 1.51
CS-222	ENST00000550996	CCPG1	Q9ULG6	757 aa		24.48	■■□□□ 1.51
CS-222	ENST00000550996	SEPT4	O43236	478 aa		24.47	■■□□□ 1.51
CS-222	ENST00000550996	SNAI1	O95863	264 aa	Predicted RBP	24.47	■■□□□ 1.51
CS-222	ENST00000550996	COL6A1	P12109	1028 aa		24.47	■■□□□ 1.51
CS-222	ENST00000550996	CNTN2	Q02246	1040 aa		24.47	■■□□□ 1.51
CS-222	ENST00000550996	UBA5	Q9GZZ9	404 aa		24.47	■■□□□ 1.51
CS-222	ENST00000550996	DNAH12	Q6ZR08	3092 aa		24.47	■■□□□ 1.51
CS-222	ENST00000550996	ASTN1	O14525	1302 aa		24.46	■■□□□ 1.51
CS-222	ENST00000550996	ZNF865	P0CJ78	1059 aa	Predicted RBP	24.46	■■□□□ 1.51
CS-222	ENST00000550996	ANTXR2	P58335	489 aa		24.46	■■□□□ 1.51
CS-222	ENST00000550996	GPATCH4	Q5T3I0	446 aa	Known RBP	24.46	■■□□□ 1.51
CS-222	ENST00000550996	MAMDC4	Q6UXC1	1216 aa		24.46	■■□□□ 1.51
CS-222	ENST00000550996	FAM133A	Q8N9E0	248 aa		24.46	■■□□□ 1.51
CS-222	ENST00000550996	DPF3	Q92784	378 aa		24.46	■■□□□ 1.51
CS-222	ENST00000550996	HTATIP2	Q9BUP3	242 aa		24.46	■■□□□ 1.51
CS-222	ENST00000550996	NRBP1	Q9UHY1	535 aa		24.46	■■□□□ 1.51
CS-222	ENST00000550996	SMCHD1	A6NHR9	2005 aa		24.45	■■□□□ 1.51
CS-222	ENST00000550996	PLXNA1	Q9UIW2	1896 aa		24.45	■■□□□ 1.51
CS-222	ENST00000550996		H0YGN5	161 aa		24.45	■■□□□ 1.5
CS-222	ENST00000550996	MSC	O60682	206 aa		24.45	■■□□□ 1.5
CS-222	ENST00000550996	NEFL	P07196	543 aa		24.45	■■□□□ 1.5
CS-222	ENST00000550996	TRDN	Q13061	729 aa		24.45	■■□□□ 1.5
CS-222	ENST00000550996	IFIT1B	Q5T764	474 aa	Known RBP	24.45	■■□□□ 1.5
CS-222	ENST00000550996	KIAA1211	Q6ZU35	1233 aa		24.45	■■□□□ 1.5
CS-222	ENST00000550996	CHST3	Q7LGC8	479 aa		24.45	■■□□□ 1.5
CS-222	ENST00000550996	ZNF467	Q7Z7K2	595 aa	Predicted RBP	24.45	■■□□□ 1.5
CS-222	ENST00000550996	MB21D2	Q8IYB1	491 aa	Predicted RBP	24.45	■■□□□ 1.5
CS-222	ENST00000550996	C11orf49	Q9H6J7	331 aa		24.45	■■□□□ 1.5
CS-222	ENST00000550996	FRMPD3	Q5JV73	1810 aa		24.45	■■□□□ 1.5
CS-222	ENST00000550996	SYNGAP1	Q96PV0	1343 aa		24.44	■■□□□ 1.5
CS-222	ENST00000550996	SOWAHB	A6NEL2	793 aa		24.44	■■□□□ 1.5
CS-222	ENST00000550996	MSL3	Q8N5Y2	521 aa	Known RBP	24.44	■■□□□ 1.5
CS-222	ENST00000550996	NCOA7	Q8NI08	942 aa		24.44	■■□□□ 1.5
CS-222	ENST00000550996	LENG1	Q96BZ8	264 aa	Predicted RBP	24.44	■■□□□ 1.5
CS-222	ENST00000550996	ANO2	Q9NQ90	1003 aa		24.44	■■□□□ 1.5
CS-222	ENST00000550996	CYP39A1	Q9NYL5	469 aa		24.44	■■□□□ 1.5
CS-222	ENST00000550996	DDX49	Q9Y6V7	483 aa	Known RBP	24.44	■■□□□ 1.5
CS-222	ENST00000550996	POTEB2	H3BUK9	544 aa		24.43	■■□□□ 1.5
CS-222	ENST00000550996	NFIB	O00712	420 aa		24.43	■■□□□ 1.5
CS-222	ENST00000550996	SLC27A2	O14975	620 aa		24.43	■■□□□ 1.5
CS-222	ENST00000550996	RALYL	Q86SE5	291 aa	Known RBP	24.43	■■□□□ 1.5
CS-222	ENST00000550996	STAG2	Q8N3U4	1231 aa		24.43	■■□□□ 1.5
CS-222	ENST00000550996	CLEC4D	Q8WXI8	215 aa		24.43	■■□□□ 1.5
CS-222	ENST00000550996	PURB	Q96QR8	312 aa	Known RBP	24.43	■■□□□ 1.5
CS-222	ENST00000550996	IFIT3	O14879	490 aa	Known RBP	24.42	■■□□□ 1.5
CS-222	ENST00000550996	NECTIN1	Q15223	517 aa		24.42	■■□□□ 1.5
CS-222	ENST00000550996	ASPRV1	Q53RT3	343 aa		24.42	■■□□□ 1.5
CS-222	ENST00000550996	CREB3L3	Q68CJ9	461 aa		24.42	■■□□□ 1.5
CS-222	ENST00000550996	GPHN	Q9NQX3	736 aa	Predicted RBP	24.42	■■□□□ 1.5
CS-222	ENST00000550996	CDKN2AIP	Q9NXV6	580 aa	Predicted RBP	24.42	■■□□□ 1.5
CS-222	ENST00000550996	WDR19	Q8NEZ3	1342 aa		24.41	■■□□□ 1.5
CS-222	ENST00000550996	CDC45	O75419	566 aa		24.41	■■□□□ 1.5
CS-222	ENST00000550996	PARP1	P09874	1014 aa	Known RBP	24.41	■■□□□ 1.5
CS-222	ENST00000550996	SLC35G1	Q2M3R5	365 aa		24.41	■■□□□ 1.5
CS-222	ENST00000550996	GJC2	Q5T442	439 aa	Predicted RBP	24.41	■■□□□ 1.5
CS-222	ENST00000550996	NSMF	Q6X4W1	530 aa		24.41	■■□□□ 1.5
CS-222	ENST00000550996	ARMCX2	Q7L311	632 aa		24.41	■■□□□ 1.5
CS-222	ENST00000550996	ADGRF4	Q8IZF3	695 aa		24.41	■■□□□ 1.5
CS-222	ENST00000550996	KATNBL1	Q9H079	304 aa		24.41	■■□□□ 1.5
CS-222	ENST00000550996	CNPY2	Q9Y2B0	182 aa		24.41	■■□□□ 1.5
CS-222	ENST00000550996	ALPK3	Q96L96	1907 aa		24.41	■■□□□ 1.5
CS-222	ENST00000550996	CCDC144CP	Q8IYA2	1237 aa		24.4	■■□□□ 1.5
CS-222	ENST00000550996	IGDCC4	Q8TDY8	1250 aa		24.4	■■□□□ 1.5

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