RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550442.5

LETMD1-223, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

TSL 4

Gene LETMD1, Length 469 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-223	ENST00000550442	PCDHA4	Q9UN74	947 aa		13.42	□□□□□ -0.26
LETMD1-223	ENST00000550442	PLIN4	Q96Q06	1357 aa		13.42	□□□□□ -0.26
LETMD1-223	ENST00000550442	ESYT2	A0FGR8	921 aa		13.41	□□□□□ -0.26
LETMD1-223	ENST00000550442	PALM3	A6NDB9	673 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
LETMD1-223	ENST00000550442	GOLGA6L9	A6NEM1	432 aa		13.41	□□□□□ -0.26
LETMD1-223	ENST00000550442	SLC26A4	O43511	780 aa		13.41	□□□□□ -0.26
LETMD1-223	ENST00000550442	EN2	P19622	333 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
LETMD1-223	ENST00000550442	GUCY1A2	P33402	732 aa		13.41	□□□□□ -0.26
LETMD1-223	ENST00000550442	LONRF3	Q496Y0	759 aa		13.41	□□□□□ -0.26
LETMD1-223	ENST00000550442	TTC38	Q5R3I4	469 aa		13.41	□□□□□ -0.26
LETMD1-223	ENST00000550442	RCSD1	Q6JBY9	416 aa		13.41	□□□□□ -0.26
LETMD1-223	ENST00000550442	RAB11FIP4	Q86YS3	637 aa		13.41	□□□□□ -0.26
LETMD1-223	ENST00000550442	NAP1L4	Q99733	375 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
LETMD1-223	ENST00000550442	KCNJ14	Q9UNX9	436 aa		13.41	□□□□□ -0.26
LETMD1-223	ENST00000550442	POLR2D	O15514	142 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
LETMD1-223	ENST00000550442	DTNB	O60941	627 aa		13.4	□□□□□ -0.26
LETMD1-223	ENST00000550442	SFPQ	P23246	707 aa	Known RBP eCLIP	13.4	□□□□□ -0.26
LETMD1-223	ENST00000550442	PLCD1	P51178	756 aa		13.4	□□□□□ -0.26
LETMD1-223	ENST00000550442	GPSM2	P81274	684 aa		13.4	□□□□□ -0.26
LETMD1-223	ENST00000550442	SPAG1	Q07617	926 aa		13.4	□□□□□ -0.26
LETMD1-223	ENST00000550442	MORC3	Q14149	939 aa		13.4	□□□□□ -0.26
LETMD1-223	ENST00000550442	DPCR1	Q3MIW9	517 aa		13.4	□□□□□ -0.26
LETMD1-223	ENST00000550442	HHIPL2	Q6UWX4	724 aa		13.4	□□□□□ -0.26
LETMD1-223	ENST00000550442	BLID	Q8IZY5	108 aa		13.4	□□□□□ -0.26
LETMD1-223	ENST00000550442	SRBD1	Q8N5C6	995 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
LETMD1-223	ENST00000550442	SPC24	Q8NBT2	197 aa		13.4	□□□□□ -0.26
LETMD1-223	ENST00000550442	TBC1D16	Q8TBP0	767 aa		13.4	□□□□□ -0.26
LETMD1-223	ENST00000550442	CCDC17	Q96LX7	622 aa		13.4	□□□□□ -0.26
LETMD1-223	ENST00000550442	TMEM106C	Q9BVX2	250 aa		13.4	□□□□□ -0.26
LETMD1-223	ENST00000550442	CFHR5	Q9BXR6	569 aa		13.4	□□□□□ -0.26
LETMD1-223	ENST00000550442	ZC3H12C	Q9C0D7	883 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
LETMD1-223	ENST00000550442	R3HCC1	Q9Y3T6	440 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
LETMD1-223	ENST00000550442	PCDHA5	Q9Y5H7	936 aa		13.4	□□□□□ -0.26
LETMD1-223	ENST00000550442	PTGS1	P23219	599 aa		13.39	□□□□□ -0.27
LETMD1-223	ENST00000550442	FANCC	Q00597	558 aa		13.39	□□□□□ -0.27
LETMD1-223	ENST00000550442	NCAPH	Q15003	741 aa		13.39	□□□□□ -0.27
LETMD1-223	ENST00000550442	ASPRV1	Q53RT3	343 aa		13.39	□□□□□ -0.27
LETMD1-223	ENST00000550442	PPP1R18	Q6NYC8	613 aa		13.39	□□□□□ -0.27
LETMD1-223	ENST00000550442	OTOP1	Q7RTM1	612 aa		13.39	□□□□□ -0.27
LETMD1-223	ENST00000550442	KRT25	Q7Z3Z0	450 aa		13.39	□□□□□ -0.27
LETMD1-223	ENST00000550442	PODN	Q7Z5L7	613 aa		13.39	□□□□□ -0.27
LETMD1-223	ENST00000550442	SH3RF1	Q7Z6J0	888 aa		13.39	□□□□□ -0.27
LETMD1-223	ENST00000550442	METTL16	Q86W50	562 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
LETMD1-223	ENST00000550442	TEX11	Q8IYF3	940 aa		13.39	□□□□□ -0.27
LETMD1-223	ENST00000550442	CCDC47	Q96A33	483 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
LETMD1-223	ENST00000550442	KCNF1	Q9H3M0	494 aa		13.39	□□□□□ -0.27
LETMD1-223	ENST00000550442	C6orf50	Q9HD87	102 aa		13.39	□□□□□ -0.27
LETMD1-223	ENST00000550442	GJB4	Q9NTQ9	266 aa		13.39	□□□□□ -0.27
LETMD1-223	ENST00000550442	BARHL2	Q9NY43	387 aa		13.39	□□□□□ -0.27
LETMD1-223	ENST00000550442	PCDHB6	Q9Y5E3	794 aa		13.39	□□□□□ -0.27
LETMD1-223	ENST00000550442	CCDC194	A0A1B0GVG4	234 aa		13.38	□□□□□ -0.27
LETMD1-223	ENST00000550442		H0YGN5	161 aa		13.38	□□□□□ -0.27
LETMD1-223	ENST00000550442	ALDH1A1	P00352	501 aa		13.38	□□□□□ -0.27
LETMD1-223	ENST00000550442	SERPINC1	P01008	464 aa		13.38	□□□□□ -0.27
LETMD1-223	ENST00000550442	PARP1	P09874	1014 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
LETMD1-223	ENST00000550442	SKIL	P12757	684 aa		13.38	□□□□□ -0.27
LETMD1-223	ENST00000550442	KLRK1	P26718	216 aa		13.38	□□□□□ -0.27
LETMD1-223	ENST00000550442	BTD	P43251	543 aa		13.38	□□□□□ -0.27
LETMD1-223	ENST00000550442	MNX1	P50219	401 aa	Predicted RBP	13.38	□□□□□ -0.27
LETMD1-223	ENST00000550442	UBASH3A	P57075	661 aa		13.38	□□□□□ -0.27
LETMD1-223	ENST00000550442	TTLL12	Q14166	644 aa	Predicted RBP	13.38	□□□□□ -0.27
LETMD1-223	ENST00000550442	MFSD14B	Q5SR56	506 aa		13.38	□□□□□ -0.27
LETMD1-223	ENST00000550442	CHRDL2	Q6WN34	429 aa		13.38	□□□□□ -0.27
LETMD1-223	ENST00000550442	TXNRD3	Q86VQ6	643 aa		13.38	□□□□□ -0.27
LETMD1-223	ENST00000550442	ANKRD20A12P	Q8NF67	263 aa		13.38	□□□□□ -0.27
LETMD1-223	ENST00000550442	NKX2-3	Q8TAU0	364 aa		13.38	□□□□□ -0.27
LETMD1-223	ENST00000550442	SH3RF3	Q8TEJ3	882 aa	Predicted RBP	13.38	□□□□□ -0.27
LETMD1-223	ENST00000550442	OTUD5	Q96G74	571 aa		13.38	□□□□□ -0.27
LETMD1-223	ENST00000550442	ZMYND12	Q9H0C1	365 aa		13.38	□□□□□ -0.27
LETMD1-223	ENST00000550442	DHX36	Q9H2U1	1008 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
LETMD1-223	ENST00000550442	DBNDD1	Q9H9R9	158 aa		13.38	□□□□□ -0.27
LETMD1-223	ENST00000550442	VPS54	Q9P1Q0	977 aa		13.38	□□□□□ -0.27
LETMD1-223	ENST00000550442	SYNPO2	Q9UMS6	1093 aa		13.38	□□□□□ -0.27
LETMD1-223	ENST00000550442	MYH6	P13533	1939 aa		13.38	□□□□□ -0.27
LETMD1-223	ENST00000550442	MYH2	Q9UKX2	1941 aa		13.37	□□□□□ -0.27
LETMD1-223	ENST00000550442	LRRC37A	A6NMS7	1700 aa		13.37	□□□□□ -0.27
LETMD1-223	ENST00000550442	UBE2Q2L	H0YL09	131 aa		13.37	□□□□□ -0.27
LETMD1-223	ENST00000550442	ACTN4	O43707	911 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
LETMD1-223	ENST00000550442	PPFIA3	O75145	1194 aa		13.37	□□□□□ -0.27
LETMD1-223	ENST00000550442	PLEKHA8P1	O95397	391 aa		13.37	□□□□□ -0.27
LETMD1-223	ENST00000550442	USP17L8	P0C7I0	530 aa		13.37	□□□□□ -0.27
LETMD1-223	ENST00000550442	RASA1	P20936	1047 aa		13.37	□□□□□ -0.27
LETMD1-223	ENST00000550442	CDK8	P49336	464 aa		13.37	□□□□□ -0.27
LETMD1-223	ENST00000550442	MKRN3	Q13064	507 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
LETMD1-223	ENST00000550442	TRAF1	Q13077	416 aa		13.37	□□□□□ -0.27
LETMD1-223	ENST00000550442	NR5A1	Q13285	461 aa		13.37	□□□□□ -0.27
LETMD1-223	ENST00000550442	FILIP1L	Q4L180	1135 aa		13.37	□□□□□ -0.27
LETMD1-223	ENST00000550442	ANGEL2	Q5VTE6	544 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
LETMD1-223	ENST00000550442	TGFBRAP1	Q8WUH2	860 aa		13.37	□□□□□ -0.27
LETMD1-223	ENST00000550442	RRP36	Q96EU6	259 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
LETMD1-223	ENST00000550442	CLIC6	Q96NY7	704 aa		13.37	□□□□□ -0.27
LETMD1-223	ENST00000550442	CCSER1	Q9C0I3	900 aa		13.37	□□□□□ -0.27
LETMD1-223	ENST00000550442	LRRC27	Q9C0I9	530 aa		13.37	□□□□□ -0.27
LETMD1-223	ENST00000550442	CSRNP2	Q9H175	543 aa		13.37	□□□□□ -0.27
LETMD1-223	ENST00000550442	EHD4	Q9H223	541 aa		13.37	□□□□□ -0.27
LETMD1-223	ENST00000550442	PDCL3	Q9H2J4	239 aa		13.37	□□□□□ -0.27
LETMD1-223	ENST00000550442	IL17RB	Q9NRM6	502 aa		13.37	□□□□□ -0.27
LETMD1-223	ENST00000550442	SEC63	Q9UGP8	760 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
LETMD1-223	ENST00000550442	MAD2L2	Q9UI95	211 aa		13.37	□□□□□ -0.27
LETMD1-223	ENST00000550442	ZSCAN12	O43309	604 aa		13.36	□□□□□ -0.27

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